MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008506	CAAA	2	8	5157	5164	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008506	GTTT	2	8	5419	5426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008506	TTGT	2	8	5437	5444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008506	GAAA	2	8	5515	5522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008506	AGGG	2	8	6553	6560	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008506	CATC	2	8	7840	7847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008506	TCAT	3	12	9981	9992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008506	AAGT	2	8	10152	10159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008506	TAAA	2	8	10398	10405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008506	TTTA	2	8	14032	14039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008506	AAAT	2	8	14343	14350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008506	AATC	2	8	15859	15866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008506	TGAT	2	8	15940	15947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008506	ATTC	2	8	15997	16004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008506	AAAT	2	8	16090	16097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008506	CTTG	2	8	20100	20107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008506	ATAA	2	8	24203	24210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008506	TTTA	2	8	25402	25409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008506	AGAA	2	8	26603	26610	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008506	GTAG	2	8	27924	27931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008506	CCCT	2	8	28313	28320	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_008506	CTTT	2	8	28516	28523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008506	AACA	2	8	29162	29169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008506	GAAA	2	8	29633	29640	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008506	TTGA	2	8	30003	30010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008506	AGTA	2	8	30063	30070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008506	TACT	2	8	30202	30209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008506	AGTA	2	8	30474	30481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008506	CTAC	2	8	30705	30712	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008506	CAAA	2	8	31039	31046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008506	AAAG	2	8	32086	32093	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008506	ATTC	2	8	35179	35186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008506	AAGG	2	8	35306	35313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008506	AAAT	2	8	38383	38390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008506	TTAT	2	8	40491	40498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008506	TTTA	2	8	40528	40535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008506	ATTT	2	8	40719	40726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008506	TTAT	2	8	42724	42731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008506	ATGT	2	8	43600	43607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008506	TCAG	2	8	44121	44128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008506	ATTT	2	8	44185	44192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008506	TTTA	2	8	44582	44589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008506	CTTT	2	8	45520	45527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.