MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008506	AT	3	6	163	168	50 %	50 %	0 %	0 %	116326610
2	NC_008506	GA	3	6	1289	1294	50 %	0 %	50 %	0 %	116326610
3	NC_008506	CA	3	6	1341	1346	50 %	0 %	0 %	50 %	116326610
4	NC_008506	GA	3	6	1754	1759	50 %	0 %	50 %	0 %	116326610
5	NC_008506	AG	3	6	2108	2113	50 %	0 %	50 %	0 %	116326611
6	NC_008506	AT	3	6	7112	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	116326617
7	NC_008506	CT	3	6	9661	9666	0 %	50 %	0 %	50 %	116326619
8	NC_008506	AT	3	6	10555	10560	50 %	50 %	0 %	0 %	116326620
9	NC_008506	CA	3	6	10692	10697	50 %	0 %	0 %	50 %	116326620
10	NC_008506	TA	3	6	11011	11016	50 %	50 %	0 %	0 %	116326620
11	NC_008506	GA	3	6	11868	11873	50 %	0 %	50 %	0 %	116326621
12	NC_008506	TA	3	6	11943	11948	50 %	50 %	0 %	0 %	116326621
13	NC_008506	TG	3	6	12326	12331	0 %	50 %	50 %	0 %	116326621
14	NC_008506	AT	3	6	12415	12420	50 %	50 %	0 %	0 %	116326621
15	NC_008506	TG	3	6	13811	13816	0 %	50 %	50 %	0 %	116326621
16	NC_008506	TA	5	10	14503	14512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008506	AT	3	6	15092	15097	50 %	50 %	0 %	0 %	116326622
18	NC_008506	TC	3	6	15393	15398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008506	GA	3	6	15729	15734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008506	AT	3	6	16156	16161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008506	AT	3	6	16233	16238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008506	AG	3	6	16770	16775	50 %	0 %	50 %	0 %	116326623
23	NC_008506	AG	4	8	16948	16955	50 %	0 %	50 %	0 %	116326623
24	NC_008506	TA	3	6	25917	25922	50 %	50 %	0 %	0 %	116326630
25	NC_008506	TA	3	6	28173	28178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008506	AT	4	8	29322	29329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008506	TA	3	6	29380	29385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008506	GT	3	6	29622	29627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008506	AT	3	6	31983	31988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008506	TA	3	6	32000	32005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008506	CA	3	6	33341	33346	50 %	0 %	0 %	50 %	116326634
32	NC_008506	CT	3	6	34164	34169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008506	TA	3	6	34264	34269	50 %	50 %	0 %	0 %	116326635
34	NC_008506	TA	3	6	34411	34416	50 %	50 %	0 %	0 %	116326635
35	NC_008506	CT	3	6	34874	34879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008506	AT	3	6	35155	35160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008506	AT	3	6	35494	35499	50 %	50 %	0 %	0 %	116326636
38	NC_008506	AT	3	6	35602	35607	50 %	50 %	0 %	0 %	116326636
39	NC_008506	CA	3	6	36536	36541	50 %	0 %	0 %	50 %	116326636
40	NC_008506	CT	3	6	37440	37445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008506	TA	3	6	37540	37545	50 %	50 %	0 %	0 %	116326638
42	NC_008506	TA	3	6	37687	37692	50 %	50 %	0 %	0 %	116326638
43	NC_008506	CT	3	6	38150	38155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008506	AG	3	6	39177	39182	50 %	0 %	50 %	0 %	116326639
45	NC_008506	AT	3	6	42766	42771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008506	AT	3	6	43764	43769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008506	TA	3	6	45739	45744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008506	GA	3	6	46623	46628	50 %	0 %	50 %	0 %	116326644
49	NC_008506	GT	3	6	46851	46856	0 %	50 %	50 %	0 %	116326644
50	NC_008506	TG	3	6	47131	47136	0 %	50 %	50 %	0 %	116326644

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.