MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	AAATGA	2	12	1311	1322	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116326548
2	NC_008505	CAAAAT	2	12	4185	4196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116326551
3	NC_008505	AAAATT	2	12	6517	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326553
4	NC_008505	GAAGCA	2	12	7836	7847	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116326554
5	NC_008505	TGACAA	2	12	11919	11930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116326558
6	NC_008505	AAATGG	2	12	13558	13569	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116326560
7	NC_008505	ATTTTG	2	12	14055	14066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116326560
8	NC_008505	AGCGGG	2	12	17722	17733	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116326562
9	NC_008505	GTTTGA	2	12	21814	21825	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116326565
10	NC_008505	TTTCTT	2	12	22111	22122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116326565
11	NC_008505	TTTCTT	2	12	26459	26470	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116326570
12	NC_008505	TCGCCA	2	12	31768	31779	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116326573
13	NC_008505	TCCTTC	2	12	32557	32568	0 %	50 %	0 %	50 %	116326574
14	NC_008505	TGCAGT	2	12	36745	36756	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116326579
15	NC_008505	CAAGTC	2	12	40628	40639	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116326581
16	NC_008505	AACGTG	2	12	41678	41689	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116326582
17	NC_008505	GATTAT	2	12	44033	44044	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116326586
18	NC_008505	CCGTGA	2	12	46564	46575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116326588
19	NC_008505	TTGATG	2	12	46860	46871	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116326588
20	NC_008505	GAAAAA	2	12	63604	63615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116326597
21	NC_008505	AAGTTC	2	12	68286	68297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116326603
22	NC_008505	AGAAAA	2	12	71660	71671	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116326605

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.