MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	ACATT	2	10	621	630	40 %	40 %	0 %	20 %	116326548
2	NC_008505	AAAGT	2	10	1160	1169	60 %	20 %	20 %	0 %	116326548
3	NC_008505	TTCTT	2	10	2603	2612	0 %	80 %	0 %	20 %	116326549
4	NC_008505	TATAG	2	10	3122	3131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008505	CGGAA	2	10	3183	3192	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008505	CAAAA	2	10	3887	3896	80 %	0 %	0 %	20 %	116326551
7	NC_008505	AACAA	2	10	3955	3964	80 %	0 %	0 %	20 %	116326551
8	NC_008505	AAAGA	2	10	4569	4578	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008505	ACTTA	2	10	5983	5992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008505	TGAAA	2	10	6025	6034	60 %	20 %	20 %	0 %	116326553
11	NC_008505	TATTT	2	10	7916	7925	20 %	80 %	0 %	0 %	116326554
12	NC_008505	GTTTT	2	10	9119	9128	0 %	80 %	20 %	0 %	116326555
13	NC_008505	CAAAA	2	10	10367	10376	80 %	0 %	0 %	20 %	116326557
14	NC_008505	ATTTT	2	10	10782	10791	20 %	80 %	0 %	0 %	116326557
15	NC_008505	CTCAA	2	10	11775	11784	40 %	20 %	0 %	40 %	116326558
16	NC_008505	ATGGA	2	10	14510	14519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008505	TAATT	2	10	14609	14618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008505	TAACT	2	10	14885	14894	40 %	40 %	0 %	20 %	116326561
19	NC_008505	TTGAT	2	10	16311	16320	20 %	60 %	20 %	0 %	116326562
20	NC_008505	CTTTA	2	10	18127	18136	20 %	60 %	0 %	20 %	116326562
21	NC_008505	TAAAG	2	10	18409	18418	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008505	TTCAA	2	10	18811	18820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008505	AGAAC	2	10	20596	20605	60 %	0 %	20 %	20 %	116326564
24	NC_008505	ATAAA	2	10	20813	20822	80 %	20 %	0 %	0 %	116326564
25	NC_008505	CAAGA	2	10	21046	21055	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008505	TTTTG	2	10	21655	21664	0 %	80 %	20 %	0 %	116326565
27	NC_008505	ATACA	2	10	22946	22955	60 %	20 %	0 %	20 %	116326566
28	NC_008505	CTTAT	2	10	22965	22974	20 %	60 %	0 %	20 %	116326566
29	NC_008505	ATAAG	2	10	23151	23160	60 %	20 %	20 %	0 %	116326566
30	NC_008505	TTTCG	2	10	24754	24763	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008505	ATTTT	2	10	25969	25978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008505	TCTTT	2	10	26444	26453	0 %	80 %	0 %	20 %	116326570
33	NC_008505	CCTGC	2	10	26492	26501	0 %	20 %	20 %	60 %	116326570
34	NC_008505	ATAAA	2	10	28913	28922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008505	AAAAT	2	10	29588	29597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008505	AATTA	2	10	30647	30656	60 %	40 %	0 %	0 %	116326572
37	NC_008505	AGAAA	2	10	30858	30867	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008505	CTTTT	2	10	31384	31393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008505	TCATT	2	10	32332	32341	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008505	CTATT	2	10	33222	33231	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008505	CAGCA	2	10	34260	34269	40 %	0 %	20 %	40 %	116326576
42	NC_008505	TTGTA	2	10	34478	34487	20 %	60 %	20 %	0 %	116326576
43	NC_008505	TTTTG	2	10	34822	34831	0 %	80 %	20 %	0 %	116326576
44	NC_008505	TTTGA	2	10	37238	37247	20 %	60 %	20 %	0 %	116326579
45	NC_008505	TAAAA	2	10	38315	38324	80 %	20 %	0 %	0 %	116326579
46	NC_008505	AATTG	2	10	38430	38439	40 %	40 %	20 %	0 %	116326580
47	NC_008505	TATTT	2	10	40073	40082	20 %	80 %	0 %	0 %	116326581
48	NC_008505	TTTGC	2	10	41122	41131	0 %	60 %	20 %	20 %	116326581
49	NC_008505	ATCCA	2	10	42766	42775	40 %	20 %	0 %	40 %	116326583
50	NC_008505	TCTTT	2	10	43007	43016	0 %	80 %	0 %	20 %	116326583
51	NC_008505	TTAGA	2	10	43062	43071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008505	CTTTT	2	10	45279	45288	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008505	ACGCA	2	10	45311	45320	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008505	TTCAA	2	10	49062	49071	40 %	40 %	0 %	20 %	116326588
55	NC_008505	ATTAT	2	10	51282	51291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008505	TTGAA	2	10	51463	51472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008505	AAAGC	2	10	54923	54932	60 %	0 %	20 %	20 %	116326591
58	NC_008505	AGTCG	2	10	55948	55957	20 %	20 %	40 %	20 %	116326592
59	NC_008505	CAATT	2	10	57539	57548	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008505	GATTG	2	10	58091	58100	20 %	40 %	40 %	0 %	116326593
61	NC_008505	AATTC	2	10	59706	59715	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008505	ATTTA	2	10	61241	61250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008505	TGGGA	2	10	62646	62655	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008505	ACAAT	2	10	64637	64646	60 %	20 %	0 %	20 %	116326598
65	NC_008505	AAAAT	2	10	66470	66479	80 %	20 %	0 %	0 %	116326600
66	NC_008505	CTCTA	2	10	67158	67167	20 %	40 %	0 %	40 %	116326601
67	NC_008505	GCTTC	2	10	68253	68262	0 %	40 %	20 %	40 %	116326603
68	NC_008505	TTCTT	2	10	69275	69284	0 %	80 %	0 %	20 %	116326603
69	NC_008505	TATAG	2	10	69794	69803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008505	TGATG	2	10	70002	70011	20 %	40 %	40 %	0 %	116326604
71	NC_008505	TCAAT	2	10	71136	71145	40 %	40 %	0 %	20 %	116326605
72	NC_008505	ATAAA	2	10	71979	71988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008505	TTTTA	2	10	72819	72828	20 %	80 %	0 %	0 %	116326606
74	NC_008505	TTTTA	2	10	72930	72939	20 %	80 %	0 %	0 %	116326607
75	NC_008505	TAAAG	2	10	73340	73349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008505	AAAAT	2	10	73352	73361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008505	TAGTT	2	10	73386	73395	20 %	60 %	20 %	0 %	116326608

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.