MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	TATAG	2	10	3122	3131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008505	CGGAA	2	10	3183	3192	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008505	AAAGA	2	10	4569	4578	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008505	ACTTA	2	10	5983	5992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008505	ATGGA	2	10	14510	14519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008505	TAATT	2	10	14609	14618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008505	TAAAG	2	10	18409	18418	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008505	TTCAA	2	10	18811	18820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008505	CAAGA	2	10	21046	21055	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008505	TTTCG	2	10	24754	24763	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008505	ATTTT	2	10	25969	25978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008505	ATAAA	2	10	28913	28922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008505	AAAAT	2	10	29588	29597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008505	AGAAA	2	10	30858	30867	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008505	CTTTT	2	10	31384	31393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008505	TCATT	2	10	32332	32341	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008505	CTATT	2	10	33222	33231	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008505	TTAGA	2	10	43062	43071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008505	CTTTT	2	10	45279	45288	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008505	ACGCA	2	10	45311	45320	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008505	ATTAT	2	10	51282	51291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008505	TTGAA	2	10	51463	51472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008505	CAATT	2	10	57539	57548	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008505	AATTC	2	10	59706	59715	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008505	ATTTA	2	10	61241	61250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008505	TGGGA	2	10	62646	62655	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008505	TATAG	2	10	69794	69803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008505	ATAAA	2	10	71979	71988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008505	TAAAG	2	10	73340	73349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008505	AAAAT	2	10	73352	73361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.