MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	ACATT	2	10	621	630	40 %	40 %	0 %	20 %	116326548
2	NC_008505	AAAGT	2	10	1160	1169	60 %	20 %	20 %	0 %	116326548
3	NC_008505	TTCTT	2	10	2603	2612	0 %	80 %	0 %	20 %	116326549
4	NC_008505	CAAAA	2	10	3887	3896	80 %	0 %	0 %	20 %	116326551
5	NC_008505	AACAA	2	10	3955	3964	80 %	0 %	0 %	20 %	116326551
6	NC_008505	TGAAA	2	10	6025	6034	60 %	20 %	20 %	0 %	116326553
7	NC_008505	TATTT	2	10	7916	7925	20 %	80 %	0 %	0 %	116326554
8	NC_008505	GTTTT	2	10	9119	9128	0 %	80 %	20 %	0 %	116326555
9	NC_008505	CAAAA	2	10	10367	10376	80 %	0 %	0 %	20 %	116326557
10	NC_008505	ATTTT	2	10	10782	10791	20 %	80 %	0 %	0 %	116326557
11	NC_008505	CTCAA	2	10	11775	11784	40 %	20 %	0 %	40 %	116326558
12	NC_008505	TAACT	2	10	14885	14894	40 %	40 %	0 %	20 %	116326561
13	NC_008505	TTGAT	2	10	16311	16320	20 %	60 %	20 %	0 %	116326562
14	NC_008505	CTTTA	2	10	18127	18136	20 %	60 %	0 %	20 %	116326562
15	NC_008505	AGAAC	2	10	20596	20605	60 %	0 %	20 %	20 %	116326564
16	NC_008505	ATAAA	2	10	20813	20822	80 %	20 %	0 %	0 %	116326564
17	NC_008505	TTTTG	2	10	21655	21664	0 %	80 %	20 %	0 %	116326565
18	NC_008505	ATACA	2	10	22946	22955	60 %	20 %	0 %	20 %	116326566
19	NC_008505	CTTAT	2	10	22965	22974	20 %	60 %	0 %	20 %	116326566
20	NC_008505	ATAAG	2	10	23151	23160	60 %	20 %	20 %	0 %	116326566
21	NC_008505	TCTTT	2	10	26444	26453	0 %	80 %	0 %	20 %	116326570
22	NC_008505	CCTGC	2	10	26492	26501	0 %	20 %	20 %	60 %	116326570
23	NC_008505	AATTA	2	10	30647	30656	60 %	40 %	0 %	0 %	116326572
24	NC_008505	CAGCA	2	10	34260	34269	40 %	0 %	20 %	40 %	116326576
25	NC_008505	TTGTA	2	10	34478	34487	20 %	60 %	20 %	0 %	116326576
26	NC_008505	TTTTG	2	10	34822	34831	0 %	80 %	20 %	0 %	116326576
27	NC_008505	TTTGA	2	10	37238	37247	20 %	60 %	20 %	0 %	116326579
28	NC_008505	TAAAA	2	10	38315	38324	80 %	20 %	0 %	0 %	116326579
29	NC_008505	AATTG	2	10	38430	38439	40 %	40 %	20 %	0 %	116326580
30	NC_008505	TATTT	2	10	40073	40082	20 %	80 %	0 %	0 %	116326581
31	NC_008505	TTTGC	2	10	41122	41131	0 %	60 %	20 %	20 %	116326581
32	NC_008505	ATCCA	2	10	42766	42775	40 %	20 %	0 %	40 %	116326583
33	NC_008505	TCTTT	2	10	43007	43016	0 %	80 %	0 %	20 %	116326583
34	NC_008505	TTCAA	2	10	49062	49071	40 %	40 %	0 %	20 %	116326588
35	NC_008505	AAAGC	2	10	54923	54932	60 %	0 %	20 %	20 %	116326591
36	NC_008505	AGTCG	2	10	55948	55957	20 %	20 %	40 %	20 %	116326592
37	NC_008505	GATTG	2	10	58091	58100	20 %	40 %	40 %	0 %	116326593
38	NC_008505	ACAAT	2	10	64637	64646	60 %	20 %	0 %	20 %	116326598
39	NC_008505	AAAAT	2	10	66470	66479	80 %	20 %	0 %	0 %	116326600
40	NC_008505	CTCTA	2	10	67158	67167	20 %	40 %	0 %	40 %	116326601
41	NC_008505	GCTTC	2	10	68253	68262	0 %	40 %	20 %	40 %	116326603
42	NC_008505	TTCTT	2	10	69275	69284	0 %	80 %	0 %	20 %	116326603
43	NC_008505	TGATG	2	10	70002	70011	20 %	40 %	40 %	0 %	116326604
44	NC_008505	TCAAT	2	10	71136	71145	40 %	40 %	0 %	20 %	116326605
45	NC_008505	TTTTA	2	10	72819	72828	20 %	80 %	0 %	0 %	116326606
46	NC_008505	TTTTA	2	10	72930	72939	20 %	80 %	0 %	0 %	116326607
47	NC_008505	TAGTT	2	10	73386	73395	20 %	60 %	20 %	0 %	116326608

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.