MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	CTGG	2	8	103	110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008505	GTTT	2	8	135	142	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008505	AATT	2	8	1654	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008505	TCAA	2	8	4633	4640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008505	ATAA	2	8	4725	4732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008505	ATTA	2	8	5924	5931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008505	ATCA	2	8	9227	9234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008505	ACTT	2	8	14529	14536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008505	TTTA	2	8	14556	14563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008505	ATAA	2	8	14571	14578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008505	CAAA	2	8	18360	18367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008505	ATAA	2	8	18528	18535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008505	TACA	2	8	18576	18583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008505	ACAG	2	8	20994	21001	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008505	ATAA	2	8	21139	21146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008505	GTTT	2	8	22394	22401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008505	GGAC	2	8	22477	22484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008505	TTTC	2	8	22526	22533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008505	ATTT	2	8	22565	22572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008505	CGTA	2	8	22674	22681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008505	GTTC	2	8	22711	22718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008505	CTTT	2	8	24832	24839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008505	TCAC	2	8	25944	25951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008505	GGTC	2	8	26911	26918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008505	AAAT	2	8	27053	27060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008505	AATT	2	8	28507	28514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008505	CTTT	2	8	28551	28558	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008505	AATA	2	8	28680	28687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008505	TAAG	2	8	29011	29018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008505	GTTG	2	8	29081	29088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008505	TGAG	2	8	29266	29273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008505	TCTT	2	8	29608	29615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008505	GAAC	2	8	29694	29701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008505	TGTT	2	8	29720	29727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008505	TTCA	2	8	29758	29765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008505	CATT	2	8	29856	29863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008505	CATG	2	8	30164	30171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008505	GTTT	2	8	30251	30258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008505	ATTA	2	8	30907	30914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008505	TATT	2	8	31401	31408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008505	TTTG	2	8	33728	33735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008505	TTTG	2	8	33748	33755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008505	TTGG	2	8	34008	34015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008505	AATA	2	8	35201	35208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008505	TATG	2	8	35237	35244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008505	TTTC	2	8	39576	39583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008505	ATAA	2	8	39643	39650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008505	AAGA	2	8	39879	39886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008505	AACT	2	8	41453	41460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008505	AATA	2	8	51494	51501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008505	AATA	2	8	53371	53378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008505	TTTA	2	8	54168	54175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008505	AGAA	2	8	54176	54183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008505	ATAA	2	8	54683	54690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008505	TTCT	2	8	55739	55746	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008505	GAAA	2	8	56395	56402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008505	AAAT	2	8	57039	57046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008505	ATTT	2	8	57161	57168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008505	ATCA	2	8	57212	57219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008505	CAAA	2	8	57513	57520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008505	CTAT	2	8	57692	57699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008505	CTCA	2	8	58391	58398	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008505	ACCT	2	8	58751	58758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008505	TACT	2	8	59316	59323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008505	CAAA	2	8	59676	59683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008505	ATTT	2	8	59730	59737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008505	ATTT	2	8	59854	59861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008505	TTGC	2	8	60823	60830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008505	AGAA	2	8	61025	61032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008505	TTAT	2	8	61618	61625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008505	ATTC	2	8	61800	61807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008505	AGGA	2	8	61898	61905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008505	CTTG	2	8	62664	62671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008505	AAAC	2	8	62814	62821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008505	AGCA	2	8	63083	63090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008505	ATTT	2	8	63939	63946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008505	AATT	2	8	64924	64931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008505	TAAA	2	8	65182	65189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008505	TTTA	2	8	65210	65217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008505	TGAG	2	8	65328	65335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008505	GATA	2	8	69437	69444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008505	AATC	2	8	69840	69847	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008505	ATTT	2	8	71908	71915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008505	AATA	2	8	72076	72083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008505	GAAA	2	8	73287	73294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008505	GAAT	2	8	74697	74704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.