MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	TCTA	2	8	273	280	25 %	50 %	0 %	25 %	116326548
2	NC_008505	CTGG	2	8	494	501	0 %	25 %	50 %	25 %	116326548
3	NC_008505	GAAA	2	8	906	913	75 %	0 %	25 %	0 %	116326548
4	NC_008505	GAAA	2	8	1120	1127	75 %	0 %	25 %	0 %	116326548
5	NC_008505	CATT	2	8	1209	1216	25 %	50 %	0 %	25 %	116326548
6	NC_008505	CTGA	2	8	1280	1287	25 %	25 %	25 %	25 %	116326548
7	NC_008505	TTAT	2	8	2242	2249	25 %	75 %	0 %	0 %	116326549
8	NC_008505	ACTT	2	8	2295	2302	25 %	50 %	0 %	25 %	116326549
9	NC_008505	CTTT	2	8	2465	2472	0 %	75 %	0 %	25 %	116326549
10	NC_008505	TTAC	2	8	3233	3240	25 %	50 %	0 %	25 %	116326551
11	NC_008505	AAAC	2	8	3256	3263	75 %	0 %	0 %	25 %	116326551
12	NC_008505	AGCA	2	8	3272	3279	50 %	0 %	25 %	25 %	116326551
13	NC_008505	CAAG	2	8	3540	3547	50 %	0 %	25 %	25 %	116326551
14	NC_008505	ATTC	2	8	3551	3558	25 %	50 %	0 %	25 %	116326551
15	NC_008505	ATGA	2	8	3643	3650	50 %	25 %	25 %	0 %	116326551
16	NC_008505	AAAC	2	8	4070	4077	75 %	0 %	0 %	25 %	116326551
17	NC_008505	TTTA	2	8	4819	4826	25 %	75 %	0 %	0 %	116326552
18	NC_008505	GTCA	2	8	5374	5381	25 %	25 %	25 %	25 %	116326552
19	NC_008505	CTGA	2	8	7017	7024	25 %	25 %	25 %	25 %	116326554
20	NC_008505	GGTT	2	8	7725	7732	0 %	50 %	50 %	0 %	116326554
21	NC_008505	ATTT	2	8	8371	8378	25 %	75 %	0 %	0 %	116326554
22	NC_008505	ATTT	2	8	8693	8700	25 %	75 %	0 %	0 %	116326555
23	NC_008505	TAAT	2	8	9584	9591	50 %	50 %	0 %	0 %	116326556
24	NC_008505	AACA	2	8	9615	9622	75 %	0 %	0 %	25 %	116326556
25	NC_008505	CTTT	2	8	10503	10510	0 %	75 %	0 %	25 %	116326557
26	NC_008505	AACA	2	8	10757	10764	75 %	0 %	0 %	25 %	116326557
27	NC_008505	TGTC	2	8	11033	11040	0 %	50 %	25 %	25 %	116326557
28	NC_008505	TGAT	2	8	11426	11433	25 %	50 %	25 %	0 %	116326557
29	NC_008505	ATAA	2	8	12130	12137	75 %	25 %	0 %	0 %	116326558
30	NC_008505	TTTC	2	8	12806	12813	0 %	75 %	0 %	25 %	116326559
31	NC_008505	TCAT	2	8	13119	13126	25 %	50 %	0 %	25 %	116326559
32	NC_008505	ACTT	2	8	14928	14935	25 %	50 %	0 %	25 %	116326561
33	NC_008505	CTTA	2	8	15475	15482	25 %	50 %	0 %	25 %	116326562
34	NC_008505	TCAA	2	8	15787	15794	50 %	25 %	0 %	25 %	116326562
35	NC_008505	TTAC	2	8	15884	15891	25 %	50 %	0 %	25 %	116326562
36	NC_008505	GGTA	2	8	15943	15950	25 %	25 %	50 %	0 %	116326562
37	NC_008505	AAGT	2	8	16938	16945	50 %	25 %	25 %	0 %	116326562
38	NC_008505	CCAA	2	8	16967	16974	50 %	0 %	0 %	50 %	116326562
39	NC_008505	CAGT	2	8	17931	17938	25 %	25 %	25 %	25 %	116326562
40	NC_008505	TATC	2	8	19391	19398	25 %	50 %	0 %	25 %	116326563
41	NC_008505	AGTA	2	8	20094	20101	50 %	25 %	25 %	0 %	116326563
42	NC_008505	CTAC	2	8	20325	20332	25 %	25 %	0 %	50 %	116326563
43	NC_008505	GCTG	2	8	20385	20392	0 %	25 %	50 %	25 %	116326564
44	NC_008505	AATC	2	8	20758	20765	50 %	25 %	0 %	25 %	116326564
45	NC_008505	TTTC	2	8	22072	22079	0 %	75 %	0 %	25 %	116326565
46	NC_008505	TCTT	2	8	23301	23308	0 %	75 %	0 %	25 %	116326566
47	NC_008505	AAAT	2	8	23332	23339	75 %	25 %	0 %	0 %	116326566
48	NC_008505	TTCT	2	8	23785	23792	0 %	75 %	0 %	25 %	116326566
49	NC_008505	AAAC	2	8	23827	23834	75 %	0 %	0 %	25 %	116326566
50	NC_008505	AGAT	2	8	23850	23857	50 %	25 %	25 %	0 %	116326566
51	NC_008505	ATAG	2	8	24161	24168	50 %	25 %	25 %	0 %	116326566
52	NC_008505	TTCT	2	8	24496	24503	0 %	75 %	0 %	25 %	116326566
53	NC_008505	TTTC	2	8	25261	25268	0 %	75 %	0 %	25 %	116326567
54	NC_008505	ATTT	2	8	26249	26256	25 %	75 %	0 %	0 %	116326569
55	NC_008505	ATTG	2	8	26306	26313	25 %	50 %	25 %	0 %	116326569
56	NC_008505	TTGA	2	8	26382	26389	25 %	50 %	25 %	0 %	116326569
57	NC_008505	AATT	2	8	27938	27945	50 %	50 %	0 %	0 %	116326571
58	NC_008505	CATA	2	8	32493	32500	50 %	25 %	0 %	25 %	116326574
59	NC_008505	TTCA	2	8	32608	32615	25 %	50 %	0 %	25 %	116326574
60	NC_008505	CTTT	2	8	32874	32881	0 %	75 %	0 %	25 %	116326574
61	NC_008505	TTTC	2	8	32941	32948	0 %	75 %	0 %	25 %	116326574
62	NC_008505	GATA	2	8	33042	33049	50 %	25 %	25 %	0 %	116326574
63	NC_008505	CTTC	2	8	33400	33407	0 %	50 %	0 %	50 %	116326575
64	NC_008505	GAAT	2	8	34808	34815	50 %	25 %	25 %	0 %	116326576
65	NC_008505	TCGT	2	8	35049	35056	0 %	50 %	25 %	25 %	116326576
66	NC_008505	TCTT	2	8	35414	35421	0 %	75 %	0 %	25 %	116326577
67	NC_008505	TTTC	2	8	36038	36045	0 %	75 %	0 %	25 %	116326578
68	NC_008505	ATTT	2	8	37719	37726	25 %	75 %	0 %	0 %	116326579
69	NC_008505	ACTT	2	8	38070	38077	25 %	50 %	0 %	25 %	116326579
70	NC_008505	AAAC	2	8	38282	38289	75 %	0 %	0 %	25 %	116326579
71	NC_008505	TTTG	2	8	38458	38465	0 %	75 %	25 %	0 %	116326580
72	NC_008505	ATTG	2	8	38757	38764	25 %	50 %	25 %	0 %	116326580
73	NC_008505	TAAA	2	8	38809	38816	75 %	25 %	0 %	0 %	116326580
74	NC_008505	ATTT	2	8	38932	38939	25 %	75 %	0 %	0 %	116326580
75	NC_008505	CAAA	2	8	40100	40107	75 %	0 %	0 %	25 %	116326581
76	NC_008505	TGTC	2	8	40250	40257	0 %	50 %	25 %	25 %	116326581
77	NC_008505	CAGA	2	8	40442	40449	50 %	0 %	25 %	25 %	116326581
78	NC_008505	GTAA	2	8	40509	40516	50 %	25 %	25 %	0 %	116326581
79	NC_008505	TATT	2	8	40712	40719	25 %	75 %	0 %	0 %	116326581
80	NC_008505	GAAC	2	8	40795	40802	50 %	0 %	25 %	25 %	116326581
81	NC_008505	AGGA	2	8	40830	40837	50 %	0 %	50 %	0 %	116326581
82	NC_008505	CATC	2	8	41087	41094	25 %	25 %	0 %	50 %	116326581
83	NC_008505	GGTT	2	8	43676	43683	0 %	50 %	50 %	0 %	116326585
84	NC_008505	CATT	2	8	43811	43818	25 %	50 %	0 %	25 %	116326585
85	NC_008505	TCAA	2	8	43997	44004	50 %	25 %	0 %	25 %	116326586
86	NC_008505	GAAT	2	8	44399	44406	50 %	25 %	25 %	0 %	116326587
87	NC_008505	GAAA	2	8	44714	44721	75 %	0 %	25 %	0 %	116326587
88	NC_008505	GGCT	2	8	45543	45550	0 %	25 %	50 %	25 %	116326588
89	NC_008505	TGGC	2	8	45688	45695	0 %	25 %	50 %	25 %	116326588
90	NC_008505	GGCT	2	8	45723	45730	0 %	25 %	50 %	25 %	116326588
91	NC_008505	ATTG	2	8	46264	46271	25 %	50 %	25 %	0 %	116326588
92	NC_008505	CTGC	2	8	46453	46460	0 %	25 %	25 %	50 %	116326588
93	NC_008505	TGGC	2	8	46881	46888	0 %	25 %	50 %	25 %	116326588
94	NC_008505	TTTC	2	8	47732	47739	0 %	75 %	0 %	25 %	116326588
95	NC_008505	CATG	2	8	50365	50372	25 %	25 %	25 %	25 %	116326588
96	NC_008505	AGGC	2	8	50905	50912	25 %	0 %	50 %	25 %	116326588
97	NC_008505	GCTT	2	8	51051	51058	0 %	50 %	25 %	25 %	116326588
98	NC_008505	CAGC	2	8	51151	51158	25 %	0 %	25 %	50 %	116326588
99	NC_008505	CTTT	2	8	51199	51206	0 %	75 %	0 %	25 %	116326588
100	NC_008505	GTCA	2	8	51612	51619	25 %	25 %	25 %	25 %	116326589
101	NC_008505	GACC	2	8	51625	51632	25 %	0 %	25 %	50 %	116326589
102	NC_008505	TGCT	2	8	51717	51724	0 %	50 %	25 %	25 %	116326589
103	NC_008505	ACAA	2	8	51807	51814	75 %	0 %	0 %	25 %	116326589
104	NC_008505	TCAG	2	8	52347	52354	25 %	25 %	25 %	25 %	116326589
105	NC_008505	GAAA	2	8	52904	52911	75 %	0 %	25 %	0 %	116326590
106	NC_008505	TTTA	2	8	54777	54784	25 %	75 %	0 %	0 %	116326591
107	NC_008505	GTCA	2	8	55332	55339	25 %	25 %	25 %	25 %	116326591
108	NC_008505	TGAT	2	8	56003	56010	25 %	50 %	25 %	0 %	116326592
109	NC_008505	GAAA	2	8	60293	60300	75 %	0 %	25 %	0 %	116326596
110	NC_008505	ATCA	2	8	63710	63717	50 %	25 %	0 %	25 %	116326597
111	NC_008505	AAAG	2	8	64077	64084	75 %	0 %	25 %	0 %	116326598
112	NC_008505	TGAT	2	8	64225	64232	25 %	50 %	25 %	0 %	116326598
113	NC_008505	GATA	2	8	64404	64411	50 %	25 %	25 %	0 %	116326598
114	NC_008505	CTTT	2	8	64445	64452	0 %	75 %	0 %	25 %	116326598
115	NC_008505	TAAT	2	8	64462	64469	50 %	50 %	0 %	0 %	116326598
116	NC_008505	TACC	2	8	64510	64517	25 %	25 %	0 %	50 %	116326598
117	NC_008505	AAAC	2	8	64830	64837	75 %	0 %	0 %	25 %	116326598
118	NC_008505	GAAA	2	8	65025	65032	75 %	0 %	25 %	0 %	116326599
119	NC_008505	CAAC	2	8	65041	65048	50 %	0 %	0 %	50 %	116326599
120	NC_008505	ATTA	2	8	65052	65059	50 %	50 %	0 %	0 %	116326599
121	NC_008505	AGCA	2	8	65135	65142	50 %	0 %	25 %	25 %	116326599
122	NC_008505	AGAA	2	8	65157	65164	75 %	0 %	25 %	0 %	116326599
123	NC_008505	TTTA	2	8	65637	65644	25 %	75 %	0 %	0 %	116326600
124	NC_008505	TATT	2	8	65896	65903	25 %	75 %	0 %	0 %	116326600
125	NC_008505	ACTT	2	8	66281	66288	25 %	50 %	0 %	25 %	116326600
126	NC_008505	TGGT	2	8	66326	66333	0 %	50 %	50 %	0 %	116326600
127	NC_008505	TATT	2	8	66496	66503	25 %	75 %	0 %	0 %	116326600
128	NC_008505	TCAA	2	8	67508	67515	50 %	25 %	0 %	25 %	116326602
129	NC_008505	AGAA	2	8	67627	67634	75 %	0 %	25 %	0 %	116326602
130	NC_008505	ATAA	2	8	67660	67667	75 %	25 %	0 %	0 %	116326602
131	NC_008505	ACTC	2	8	67921	67928	25 %	25 %	0 %	50 %	116326602
132	NC_008505	TTTC	2	8	68315	68322	0 %	75 %	0 %	25 %	116326603
133	NC_008505	GAGT	2	8	68712	68719	25 %	25 %	50 %	0 %	116326603
134	NC_008505	ACTT	2	8	68967	68974	25 %	50 %	0 %	25 %	116326603
135	NC_008505	GACT	2	8	70382	70389	25 %	25 %	25 %	25 %	116326604
136	NC_008505	AAAG	2	8	70450	70457	75 %	0 %	25 %	0 %	116326604
137	NC_008505	AATA	2	8	70805	70812	75 %	25 %	0 %	0 %	116326605
138	NC_008505	AAGA	2	8	70860	70867	75 %	0 %	25 %	0 %	116326605
139	NC_008505	TTTC	2	8	71241	71248	0 %	75 %	0 %	25 %	116326605
140	NC_008505	CATT	2	8	71872	71879	25 %	50 %	0 %	25 %	116326605
141	NC_008505	AATA	2	8	72098	72105	75 %	25 %	0 %	0 %	116326606
142	NC_008505	ATTA	2	8	72728	72735	50 %	50 %	0 %	0 %	116326606
143	NC_008505	TGAT	2	8	73811	73818	25 %	50 %	25 %	0 %	116326608
144	NC_008505	GACT	2	8	74235	74242	25 %	25 %	25 %	25 %	116326608

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.