MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	AG	3	6	388	393	50 %	0 %	50 %	0 %	116326548
2	NC_008505	GA	3	6	452	457	50 %	0 %	50 %	0 %	116326548
3	NC_008505	CG	3	6	1817	1822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008505	AG	3	6	2022	2027	50 %	0 %	50 %	0 %	116326549
5	NC_008505	GT	3	6	2746	2751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008505	AC	3	6	3099	3104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008505	AC	3	6	3511	3516	50 %	0 %	0 %	50 %	116326551
8	NC_008505	AC	3	6	3710	3715	50 %	0 %	0 %	50 %	116326551
9	NC_008505	TA	3	6	4276	4281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008505	GA	3	6	4461	4466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008505	AT	3	6	7112	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	116326554
12	NC_008505	AT	3	6	8397	8402	50 %	50 %	0 %	0 %	116326554
13	NC_008505	AG	3	6	8557	8562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008505	TA	3	6	9378	9383	50 %	50 %	0 %	0 %	116326556
15	NC_008505	TA	3	6	9675	9680	50 %	50 %	0 %	0 %	116326556
16	NC_008505	GA	3	6	10019	10024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008505	TC	3	6	10572	10577	0 %	50 %	0 %	50 %	116326557
18	NC_008505	AC	3	6	12108	12113	50 %	0 %	0 %	50 %	116326558
19	NC_008505	AT	3	6	12338	12343	50 %	50 %	0 %	0 %	116326558
20	NC_008505	TA	3	6	12673	12678	50 %	50 %	0 %	0 %	116326559
21	NC_008505	AT	3	6	13376	13381	50 %	50 %	0 %	0 %	116326560
22	NC_008505	AG	3	6	13762	13767	50 %	0 %	50 %	0 %	116326560
23	NC_008505	CT	3	6	14495	14500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008505	AT	4	8	14619	14626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008505	AG	3	6	15261	15266	50 %	0 %	50 %	0 %	116326561
26	NC_008505	CT	3	6	15546	15551	0 %	50 %	0 %	50 %	116326562
27	NC_008505	GT	3	6	17868	17873	0 %	50 %	50 %	0 %	116326562
28	NC_008505	AT	4	8	18899	18906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008505	AC	4	8	19448	19455	50 %	0 %	0 %	50 %	116326563
30	NC_008505	GA	3	6	19866	19871	50 %	0 %	50 %	0 %	116326563
31	NC_008505	GA	3	6	21133	21138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008505	TA	3	6	21571	21576	50 %	50 %	0 %	0 %	116326565
33	NC_008505	CT	3	6	22140	22145	0 %	50 %	0 %	50 %	116326565
34	NC_008505	TG	3	6	23481	23486	0 %	50 %	50 %	0 %	116326566
35	NC_008505	CT	3	6	24080	24085	0 %	50 %	0 %	50 %	116326566
36	NC_008505	TG	3	6	25125	25130	0 %	50 %	50 %	0 %	116326567
37	NC_008505	TC	3	6	25446	25451	0 %	50 %	0 %	50 %	116326567
38	NC_008505	TC	3	6	25558	25563	0 %	50 %	0 %	50 %	116326568
39	NC_008505	AC	3	6	26098	26103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008505	CT	3	6	26218	26223	0 %	50 %	0 %	50 %	116326569
41	NC_008505	TC	3	6	26556	26561	0 %	50 %	0 %	50 %	116326570
42	NC_008505	TA	3	6	26741	26746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008505	TA	3	6	27720	27725	50 %	50 %	0 %	0 %	116326571
44	NC_008505	AT	4	8	27924	27931	50 %	50 %	0 %	0 %	116326571
45	NC_008505	TA	3	6	28113	28118	50 %	50 %	0 %	0 %	116326571
46	NC_008505	TA	3	6	28327	28332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008505	AT	3	6	28523	28528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008505	TC	3	6	29708	29713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008505	AT	3	6	30561	30566	50 %	50 %	0 %	0 %	116326572
50	NC_008505	CT	3	6	30737	30742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008505	TA	4	8	30997	31004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008505	TA	3	6	31243	31248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008505	TA	4	8	32205	32212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008505	TA	3	6	33291	33296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008505	TA	3	6	33769	33774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008505	AT	3	6	35041	35046	50 %	50 %	0 %	0 %	116326576
57	NC_008505	CA	3	6	35268	35273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008505	CT	3	6	35386	35391	0 %	50 %	0 %	50 %	116326577
59	NC_008505	CT	3	6	35658	35663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008505	TA	3	6	35758	35763	50 %	50 %	0 %	0 %	116326578
61	NC_008505	TA	3	6	35905	35910	50 %	50 %	0 %	0 %	116326578
62	NC_008505	CT	3	6	36368	36373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008505	AT	3	6	37531	37536	50 %	50 %	0 %	0 %	116326579
64	NC_008505	TC	3	6	38661	38666	0 %	50 %	0 %	50 %	116326580
65	NC_008505	CT	3	6	39435	39440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008505	CA	3	6	41726	41731	50 %	0 %	0 %	50 %	116326582
67	NC_008505	TC	3	6	42317	42322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008505	TC	3	6	42808	42813	0 %	50 %	0 %	50 %	116326583
69	NC_008505	AT	3	6	42978	42983	50 %	50 %	0 %	0 %	116326583
70	NC_008505	AG	3	6	44386	44391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008505	TA	3	6	44849	44854	50 %	50 %	0 %	0 %	116326587
72	NC_008505	AT	3	6	44995	45000	50 %	50 %	0 %	0 %	116326587
73	NC_008505	TC	3	6	45421	45426	0 %	50 %	0 %	50 %	116326588
74	NC_008505	TA	3	6	48526	48531	50 %	50 %	0 %	0 %	116326588
75	NC_008505	TA	3	6	51304	51309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008505	TA	3	6	51319	51324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008505	AG	3	6	52576	52581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008505	TA	3	6	53039	53044	50 %	50 %	0 %	0 %	116326590
79	NC_008505	AT	3	6	53185	53190	50 %	50 %	0 %	0 %	116326590
80	NC_008505	AG	3	6	53286	53291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008505	GT	3	6	53420	53425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008505	GT	3	6	54202	54207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008505	CT	3	6	54240	54245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008505	GT	3	6	54401	54406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008505	AT	3	6	54609	54614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008505	TA	3	6	56192	56197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008505	AG	3	6	56538	56543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008505	GA	3	6	57312	57317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008505	TC	3	6	57669	57674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008505	CT	3	6	57920	57925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008505	AT	3	6	59302	59307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008505	AG	3	6	59965	59970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008505	TA	3	6	60428	60433	50 %	50 %	0 %	0 %	116326596
94	NC_008505	AT	3	6	60574	60579	50 %	50 %	0 %	0 %	116326596
95	NC_008505	AG	3	6	60675	60680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008505	CT	3	6	60946	60951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008505	TC	3	6	61286	61291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008505	AT	3	6	61546	61551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008505	TA	3	6	61581	61586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008505	CT	3	6	63288	63293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008505	AT	3	6	63827	63832	50 %	50 %	0 %	0 %	116326597
102	NC_008505	TA	3	6	63900	63905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008505	TA	3	6	64366	64371	50 %	50 %	0 %	0 %	116326598
104	NC_008505	AC	3	6	64528	64533	50 %	0 %	0 %	50 %	116326598
105	NC_008505	AT	3	6	65092	65097	50 %	50 %	0 %	0 %	116326599
106	NC_008505	AC	3	6	65406	65411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008505	CA	4	8	66090	66097	50 %	0 %	0 %	50 %	116326600
108	NC_008505	GA	3	6	67384	67389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008505	TC	3	6	67719	67724	0 %	50 %	0 %	50 %	116326602
110	NC_008505	AG	3	6	67993	67998	50 %	0 %	50 %	0 %	116326602
111	NC_008505	AG	3	6	68694	68699	50 %	0 %	50 %	0 %	116326603
112	NC_008505	GT	3	6	68933	68938	0 %	50 %	50 %	0 %	116326603
113	NC_008505	GT	3	6	69418	69423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008505	CA	3	6	69772	69777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008505	TC	3	6	70869	70874	0 %	50 %	0 %	50 %	116326605
116	NC_008505	AG	3	6	71846	71851	50 %	0 %	50 %	0 %	116326605
117	NC_008505	CA	3	6	73932	73937	50 %	0 %	0 %	50 %	116326608
118	NC_008505	TG	3	6	74334	74339	0 %	50 %	50 %	0 %	116326608

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.