MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 2

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008504	TTTAA	2	10	740	749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008504	TTTAT	2	10	1639	1648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008504	GAAAA	2	10	2155	2164	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008504	AATCA	2	10	2188	2197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008504	TTTAA	2	10	2256	2265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008504	AAGAT	2	10	2511	2520	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008504	TAAAA	2	10	3104	3113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008504	AAAAT	2	10	3518	3527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008504	GAACG	2	10	4066	4075	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008504	ATATA	2	10	4773	4782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008504	ATATT	2	10	4840	4849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008504	CTTTT	2	10	5672	5681	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008504	ATTTT	2	10	5942	5951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008504	TGAAT	2	10	6560	6569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008504	CTTTT	2	10	6773	6782	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008504	ATACT	2	10	7000	7009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.