MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 2

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008504	ATAA	2	8	78	85	75 %	25 %	0 %	0 %	116326541
2	NC_008504	TTTA	2	8	196	203	25 %	75 %	0 %	0 %	116326541
3	NC_008504	TTTA	2	8	484	491	25 %	75 %	0 %	0 %	116326541
4	NC_008504	AAAT	2	8	502	509	75 %	25 %	0 %	0 %	116326541
5	NC_008504	TAAT	2	8	525	532	50 %	50 %	0 %	0 %	116326541
6	NC_008504	TAAA	2	8	565	572	75 %	25 %	0 %	0 %	116326541
7	NC_008504	ACTA	2	8	691	698	50 %	25 %	0 %	25 %	116326541
8	NC_008504	TTAT	2	8	779	786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008504	AGTG	2	8	1102	1109	25 %	25 %	50 %	0 %	116326542
10	NC_008504	CATC	2	8	1214	1221	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008504	AAAT	2	8	1441	1448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008504	GAAT	2	8	1665	1672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008504	AAAT	2	8	1674	1681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008504	ATTA	2	8	1915	1922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008504	TAAA	2	8	3324	3331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008504	TCAA	2	8	3898	3905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008504	TAAT	2	8	4416	4423	50 %	50 %	0 %	0 %	116326543
18	NC_008504	ACAA	2	8	4545	4552	75 %	0 %	0 %	25 %	116326543
19	NC_008504	TACT	2	8	4711	4718	25 %	50 %	0 %	25 %	116326543
20	NC_008504	TAAA	2	8	5006	5013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008504	TCAC	2	8	5021	5028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008504	CAAA	2	8	5218	5225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008504	GAAC	2	8	5811	5818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008504	TGTT	2	8	5837	5844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008504	AAAG	2	8	5923	5930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008504	ACTC	2	8	6265	6272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008504	AGAC	2	8	6680	6687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008504	GACT	2	8	6706	6713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008504	GAAA	2	8	7156	7163	75 %	0 %	25 %	0 %	116326544
30	NC_008504	GAAA	2	8	7537	7544	75 %	0 %	25 %	0 %	116326544
31	NC_008504	ATTT	2	8	8309	8316	25 %	75 %	0 %	0 %	116326545
32	NC_008504	ATTT	2	8	8480	8487	25 %	75 %	0 %	0 %	116326545
33	NC_008504	TTAA	2	8	8727	8734	50 %	50 %	0 %	0 %	116326545
34	NC_008504	ATAA	2	8	9128	9135	75 %	25 %	0 %	0 %	116326546
35	NC_008504	AAAC	2	8	9170	9177	75 %	0 %	0 %	25 %	116326546
36	NC_008504	CAAT	2	8	9310	9317	50 %	25 %	0 %	25 %	116326546
37	NC_008504	AAAG	2	8	9453	9460	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.