MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 2

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008504	TAT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
2	NC_008504	TAT	2	6	147	152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
3	NC_008504	TTA	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
4	NC_008504	TCT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326541
5	NC_008504	ATT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
6	NC_008504	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
7	NC_008504	TAT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
8	NC_008504	TAA	2	6	613	618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326541
9	NC_008504	TGT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326541
10	NC_008504	ATT	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008504	ATT	2	6	773	778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008504	ACG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326542
13	NC_008504	CAA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326542
14	NC_008504	GAA	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326542
15	NC_008504	TTA	2	6	1192	1197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008504	GAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008504	ATA	2	6	1587	1592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008504	ATA	2	6	1709	1714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008504	TAT	2	6	1756	1761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008504	TTG	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008504	TAT	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008504	TGA	2	6	1925	1930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008504	TTA	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008504	TAT	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008504	ATA	2	6	1997	2002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008504	AAT	2	6	2055	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008504	AAT	2	6	2136	2141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008504	AGA	3	9	2178	2186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008504	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008504	CAA	3	9	2443	2451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008504	AGA	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008504	TGG	2	6	2474	2479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008504	AAG	2	6	2669	2674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008504	GAA	2	6	2709	2714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008504	TGA	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008504	TGA	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008504	TGG	2	6	3132	3137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008504	TAT	2	6	3344	3349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008504	ACC	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008504	AAT	2	6	3668	3673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008504	TGA	3	9	3742	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008504	ATT	2	6	3843	3848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008504	ATA	2	6	3892	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008504	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326543
45	NC_008504	TTA	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326543
46	NC_008504	ATT	2	6	4631	4636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326543
47	NC_008504	TGG	2	6	4672	4677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326543
48	NC_008504	AGG	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326543
49	NC_008504	CTA	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008504	TAT	2	6	4966	4971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008504	TAA	2	6	5042	5047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008504	AGT	2	6	5071	5076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008504	AAT	3	9	5154	5162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008504	TAT	3	9	5190	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008504	ATA	3	9	5391	5399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008504	GAA	3	9	5880	5888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008504	CTT	2	6	5905	5910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008504	TGT	2	6	6121	6126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008504	TTA	2	6	6156	6161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008504	CTA	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008504	TGT	2	6	6302	6307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008504	TCA	2	6	6436	6441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008504	TTG	2	6	6573	6578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008504	GTT	2	6	6628	6633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008504	ATA	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008504	GAA	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008504	TTC	2	6	7057	7062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008504	TAT	2	6	7105	7110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326544
69	NC_008504	GGT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326544
70	NC_008504	TCA	2	6	7197	7202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326544
71	NC_008504	TAT	2	6	7299	7304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326544
72	NC_008504	AAG	2	6	7365	7370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
73	NC_008504	AAG	2	6	7410	7415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
74	NC_008504	ATT	2	6	7598	7603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326544
75	NC_008504	GAA	2	6	7796	7801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
76	NC_008504	ATA	2	6	7863	7868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326544
77	NC_008504	GAA	2	6	7885	7890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
78	NC_008504	AAG	2	6	7938	7943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
79	NC_008504	AGA	2	6	7966	7971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
80	NC_008504	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
81	NC_008504	GAA	2	6	8206	8211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
82	NC_008504	AGG	2	6	8303	8308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326545
83	NC_008504	AGG	2	6	8348	8353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326545
84	NC_008504	TAT	3	9	8399	8407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326545
85	NC_008504	TAA	2	6	8494	8499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326545
86	NC_008504	TAT	2	6	8714	8719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326545
87	NC_008504	CTA	2	6	8918	8923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326546
88	NC_008504	AGA	2	6	9232	9237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326546
89	NC_008504	AGA	2	6	9391	9396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326546
90	NC_008504	TGG	2	6	9416	9421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326546
91	NC_008504	GAT	2	6	9439	9444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326546

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.