MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008503	GCAA	2	8	80	87	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008503	ATTT	2	8	226	233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008503	ATTT	2	8	715	722	25 %	75 %	0 %	0 %	116326530
4	NC_008503	CTTT	2	8	878	885	0 %	75 %	0 %	25 %	116326530
5	NC_008503	TTGA	2	8	996	1003	25 %	50 %	25 %	0 %	116326530
6	NC_008503	TTTA	2	8	1402	1409	25 %	75 %	0 %	0 %	116326530
7	NC_008503	GTTT	2	8	1554	1561	0 %	75 %	25 %	0 %	116326530
8	NC_008503	AAAG	2	8	1659	1666	75 %	0 %	25 %	0 %	116326530
9	NC_008503	CTTA	2	8	1787	1794	25 %	50 %	0 %	25 %	116326531
10	NC_008503	GTTT	2	8	2194	2201	0 %	75 %	25 %	0 %	116326531
11	NC_008503	CTTC	2	8	2330	2337	0 %	50 %	0 %	50 %	116326531
12	NC_008503	GTTT	2	8	2586	2593	0 %	75 %	25 %	0 %	116326531
13	NC_008503	GTAA	2	8	3023	3030	50 %	25 %	25 %	0 %	116326531
14	NC_008503	AATA	2	8	3997	4004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008503	AGAA	2	8	4032	4039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008503	ATTG	2	8	4125	4132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008503	GTTA	2	8	4188	4195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008503	ACTA	2	8	4464	4471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008503	TTGA	2	8	5166	5173	25 %	50 %	25 %	0 %	116326532
20	NC_008503	TTTA	2	8	5383	5390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008503	ATAA	2	8	5586	5593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008503	ATTT	2	8	5669	5676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008503	TATT	2	8	5855	5862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008503	GCTT	2	8	6435	6442	0 %	50 %	25 %	25 %	116326533
25	NC_008503	AATC	2	8	6890	6897	50 %	25 %	0 %	25 %	116326534
26	NC_008503	GATT	2	8	7220	7227	25 %	50 %	25 %	0 %	116326534
27	NC_008503	AAAG	2	8	7425	7432	75 %	0 %	25 %	0 %	116326534
28	NC_008503	TTCA	2	8	7593	7600	25 %	50 %	0 %	25 %	116326534
29	NC_008503	CAAA	2	8	8053	8060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008503	TTAT	2	8	8276	8283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008503	TTGA	2	8	8893	8900	25 %	50 %	25 %	0 %	116326535
32	NC_008503	TTTA	2	8	9110	9117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008503	TAGT	2	8	9594	9601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008503	TAAA	2	8	9733	9740	75 %	25 %	0 %	0 %	116326536
35	NC_008503	TGAT	2	8	9883	9890	25 %	50 %	25 %	0 %	116326536
36	NC_008503	TAAT	2	8	10194	10201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008503	TTTG	2	8	10252	10259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008503	TATT	2	8	10267	10274	25 %	75 %	0 %	0 %	116326537
39	NC_008503	ATAA	2	8	10414	10421	75 %	25 %	0 %	0 %	116326537
40	NC_008503	CTGT	2	8	10649	10656	0 %	50 %	25 %	25 %	116326538
41	NC_008503	TTTG	2	8	10665	10672	0 %	75 %	25 %	0 %	116326538
42	NC_008503	ATTG	2	8	10785	10792	25 %	50 %	25 %	0 %	116326538
43	NC_008503	GTTT	2	8	11152	11159	0 %	75 %	25 %	0 %	116326538
44	NC_008503	ATAA	2	8	11517	11524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008503	GTCA	2	8	11820	11827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008503	TGTT	2	8	12778	12785	0 %	75 %	25 %	0 %	116326539
47	NC_008503	CGTT	2	8	12914	12921	0 %	50 %	25 %	25 %	116326539
48	NC_008503	TTGA	2	8	13740	13747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008503	TTTG	2	8	13949	13956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.