MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 1

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008503	GAT	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326530
2	NC_008503	TTC	2	6	449	454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326530
3	NC_008503	CAT	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326530
4	NC_008503	ATT	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326530
5	NC_008503	GGA	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326530
6	NC_008503	TCT	2	6	1091	1096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326530
7	NC_008503	GTA	2	6	1127	1132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326530
8	NC_008503	CTT	2	6	1218	1223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326530
9	NC_008503	CAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326530
10	NC_008503	TCA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326530
11	NC_008503	TGA	2	6	1766	1771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326530
12	NC_008503	CTA	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326531
13	NC_008503	TTG	2	6	2001	2006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
14	NC_008503	CTC	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326531
15	NC_008503	GTT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
16	NC_008503	AGA	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326531
17	NC_008503	CGA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326531
18	NC_008503	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326531
19	NC_008503	TGA	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326531
20	NC_008503	AGG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326531
21	NC_008503	TGA	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326531
22	NC_008503	TTG	2	6	2779	2784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
23	NC_008503	TCT	2	6	2948	2953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326531
24	NC_008503	GGA	2	6	3009	3014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326531
25	NC_008503	CTA	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326531
26	NC_008503	AAT	2	6	3127	3132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
27	NC_008503	AAT	2	6	3157	3162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
28	NC_008503	TTG	2	6	3177	3182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
29	NC_008503	AAG	2	6	3316	3321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326531
30	NC_008503	ATA	2	6	3391	3396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
31	NC_008503	TGA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326531
32	NC_008503	GAA	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326531
33	NC_008503	GAG	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326531
34	NC_008503	ACA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326531
35	NC_008503	ATT	2	6	3733	3738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326531
36	NC_008503	AAT	2	6	3767	3772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
37	NC_008503	TAT	2	6	3922	3927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326531
38	NC_008503	CAG	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326532
39	NC_008503	ATT	2	6	4713	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326532
40	NC_008503	CTA	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326532
41	NC_008503	ACG	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326532
42	NC_008503	ACT	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326532
43	NC_008503	ATT	2	6	4933	4938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326532
44	NC_008503	AGC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326532
45	NC_008503	TGA	2	6	5045	5050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326532
46	NC_008503	AAT	2	6	5160	5165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326532
47	NC_008503	AAG	2	6	5287	5292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326532
48	NC_008503	TAT	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326532
49	NC_008503	CCA	2	6	5975	5980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326533
50	NC_008503	TTC	2	6	6002	6007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
51	NC_008503	TAT	2	6	6013	6018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326533
52	NC_008503	TAT	2	6	6052	6057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326533
53	NC_008503	TCT	2	6	6099	6104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
54	NC_008503	TTC	2	6	6110	6115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
55	NC_008503	GTT	2	6	6145	6150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326533
56	NC_008503	GTC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326533
57	NC_008503	TTG	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326533
58	NC_008503	TAA	2	6	6331	6336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326533
59	NC_008503	TTC	2	6	6485	6490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
60	NC_008503	AGT	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326534
61	NC_008503	AAC	2	6	6721	6726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326534
62	NC_008503	TAA	2	6	6735	6740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326534
63	NC_008503	TTC	2	6	6783	6788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
64	NC_008503	TCT	2	6	6793	6798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
65	NC_008503	TCT	2	6	6866	6871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
66	NC_008503	AAG	2	6	6935	6940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326534
67	NC_008503	TTC	2	6	6954	6959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
68	NC_008503	TCA	2	6	7267	7272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326534
69	NC_008503	CTT	3	9	7337	7345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
70	NC_008503	CTT	2	6	7385	7390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
71	NC_008503	ATA	2	6	7459	7464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326534
72	NC_008503	TGG	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326534
73	NC_008503	CAG	2	6	8428	8433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326535
74	NC_008503	ATT	2	6	8440	8445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326535
75	NC_008503	CTA	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326535
76	NC_008503	ACG	2	6	8533	8538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326535
77	NC_008503	ACT	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326535
78	NC_008503	ATT	2	6	8660	8665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326535
79	NC_008503	AGC	2	6	8733	8738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326535
80	NC_008503	TGA	2	6	8772	8777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326535
81	NC_008503	AAT	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326535
82	NC_008503	AAG	2	6	9014	9019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326535
83	NC_008503	TAT	2	6	9059	9064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326535
84	NC_008503	CAT	2	6	9779	9784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326536
85	NC_008503	GTA	2	6	9822	9827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326536
86	NC_008503	GAG	2	6	9925	9930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326536
87	NC_008503	AAG	2	6	10009	10014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326536
88	NC_008503	TTC	2	6	10332	10337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326537
89	NC_008503	TTG	2	6	10440	10445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326537
90	NC_008503	TCA	2	6	10448	10453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326537
91	NC_008503	ACA	2	6	10457	10462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326537
92	NC_008503	CTT	2	6	10470	10475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326537
93	NC_008503	TAA	2	6	10621	10626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326538
94	NC_008503	TTC	2	6	10657	10662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326538
95	NC_008503	TCA	2	6	10730	10735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326538
96	NC_008503	TTC	2	6	10759	10764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326538
97	NC_008503	AAT	2	6	10825	10830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326538
98	NC_008503	GTT	2	6	10904	10909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326538
99	NC_008503	TAT	2	6	11064	11069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326538
100	NC_008503	TCT	2	6	11072	11077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326538
101	NC_008503	CAT	2	6	11214	11219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326538
102	NC_008503	TCT	2	6	12754	12759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326539
103	NC_008503	CTA	2	6	12764	12769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326539
104	NC_008503	ATT	2	6	12820	12825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326539
105	NC_008503	CTT	2	6	12833	12838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326539
106	NC_008503	TTG	3	9	12897	12905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326539
107	NC_008503	GTC	2	6	12961	12966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326539
108	NC_008503	TTG	2	6	13276	13281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326539
109	NC_008503	TTG	2	6	13381	13386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326539

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.