MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 plasmid 1

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008502	CAACA	2	10	598	607	60 %	0 %	0 %	40 %	116326659
2	NC_008502	AAAGT	2	10	2155	2164	60 %	20 %	20 %	0 %	116326659
3	NC_008502	ACTTC	2	10	6911	6920	20 %	40 %	0 %	40 %	116326662
4	NC_008502	CATGG	2	10	8025	8034	20 %	20 %	40 %	20 %	116326663
5	NC_008502	ATTTG	2	10	8832	8841	20 %	60 %	20 %	0 %	116326663
6	NC_008502	TTTTA	2	10	10284	10293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008502	ACACG	2	10	11762	11771	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008502	ACATT	2	10	14310	14319	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008502	GAAGA	2	10	14361	14370	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008502	GTTTT	2	10	14484	14493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008502	GGCAA	2	10	15635	15644	40 %	0 %	40 %	20 %	116326668
12	NC_008502	TTCTA	2	10	15864	15873	20 %	60 %	0 %	20 %	116326668
13	NC_008502	GCATG	2	10	17922	17931	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008502	TCTTT	2	10	19700	19709	0 %	80 %	0 %	20 %	116326671
15	NC_008502	TCGCT	2	10	20105	20114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_008502	ATTTT	2	10	20907	20916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008502	TTCTG	2	10	21108	21117	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008502	TGACG	2	10	22985	22994	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008502	AAAGG	2	10	25718	25727	60 %	0 %	40 %	0 %	116326674

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.