MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 plasmid 1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008502	ACCA	2	8	697	704	50 %	0 %	0 %	50 %	116326659
2	NC_008502	TAAT	2	8	876	883	50 %	50 %	0 %	0 %	116326659
3	NC_008502	ATGC	2	8	1407	1414	25 %	25 %	25 %	25 %	116326659
4	NC_008502	GCAA	2	8	1417	1424	50 %	0 %	25 %	25 %	116326659
5	NC_008502	AAAG	2	8	1483	1490	75 %	0 %	25 %	0 %	116326659
6	NC_008502	TTCA	2	8	1732	1739	25 %	50 %	0 %	25 %	116326659
7	NC_008502	CATT	2	8	1929	1936	25 %	50 %	0 %	25 %	116326659
8	NC_008502	CGAA	2	8	1983	1990	50 %	0 %	25 %	25 %	116326659
9	NC_008502	CAAA	2	8	2172	2179	75 %	0 %	0 %	25 %	116326659
10	NC_008502	ATGA	2	8	2764	2771	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008502	CAAA	2	8	3034	3041	75 %	0 %	0 %	25 %	116326660
12	NC_008502	CCAT	2	8	3253	3260	25 %	25 %	0 %	50 %	116326660
13	NC_008502	AATT	2	8	3310	3317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008502	GTTG	2	8	5727	5734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008502	TGCA	2	8	5815	5822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008502	ACCA	2	8	5866	5873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008502	TCAC	2	8	5968	5975	25 %	25 %	0 %	50 %	116326662
18	NC_008502	TTTG	2	8	5996	6003	0 %	75 %	25 %	0 %	116326662
19	NC_008502	AATC	2	8	6167	6174	50 %	25 %	0 %	25 %	116326662
20	NC_008502	CTTT	2	8	6223	6230	0 %	75 %	0 %	25 %	116326662
21	NC_008502	GCGG	2	8	7595	7602	0 %	0 %	75 %	25 %	116326663
22	NC_008502	GTTT	2	8	7636	7643	0 %	75 %	25 %	0 %	116326663
23	NC_008502	TTTG	2	8	7708	7715	0 %	75 %	25 %	0 %	116326663
24	NC_008502	GAAT	2	8	7912	7919	50 %	25 %	25 %	0 %	116326663
25	NC_008502	CAAA	2	8	8152	8159	75 %	0 %	0 %	25 %	116326663
26	NC_008502	CCTG	2	8	8337	8344	0 %	25 %	25 %	50 %	116326663
27	NC_008502	GTCA	2	8	8867	8874	25 %	25 %	25 %	25 %	116326663
28	NC_008502	TCGT	2	8	9329	9336	0 %	50 %	25 %	25 %	116326664
29	NC_008502	CTCA	2	8	9338	9345	25 %	25 %	0 %	50 %	116326664
30	NC_008502	GTCG	2	8	9478	9485	0 %	25 %	50 %	25 %	116326664
31	NC_008502	CCTG	2	8	9795	9802	0 %	25 %	25 %	50 %	116326664
32	NC_008502	TCCA	2	8	10343	10350	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008502	CAAA	2	8	11695	11702	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008502	TTTA	2	8	11875	11882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008502	TCAA	2	8	13077	13084	50 %	25 %	0 %	25 %	116326667
36	NC_008502	TTTG	2	8	14228	14235	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008502	ATTG	2	8	14328	14335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008502	TTAA	2	8	14456	14463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008502	CTTT	2	8	14686	14693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008502	ATCA	2	8	15222	15229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008502	GATG	2	8	15775	15782	25 %	25 %	50 %	0 %	116326668
42	NC_008502	CCGA	2	8	16152	16159	25 %	0 %	25 %	50 %	116326669
43	NC_008502	AAGG	2	8	16296	16303	50 %	0 %	50 %	0 %	116326669
44	NC_008502	AACA	2	8	16603	16610	75 %	0 %	0 %	25 %	116326669
45	NC_008502	ACCT	2	8	16875	16882	25 %	25 %	0 %	50 %	116326670
46	NC_008502	GCCA	2	8	17150	17157	25 %	0 %	25 %	50 %	116326670
47	NC_008502	AATT	2	8	18387	18394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008502	CGTT	2	8	18749	18756	0 %	50 %	25 %	25 %	116326671
49	NC_008502	TGTT	2	8	18778	18785	0 %	75 %	25 %	0 %	116326671
50	NC_008502	TTAA	2	8	18800	18807	50 %	50 %	0 %	0 %	116326671
51	NC_008502	TTTA	2	8	18883	18890	25 %	75 %	0 %	0 %	116326671
52	NC_008502	TTAA	2	8	18974	18981	50 %	50 %	0 %	0 %	116326671
53	NC_008502	ATTA	2	8	19129	19136	50 %	50 %	0 %	0 %	116326671
54	NC_008502	TTTC	2	8	19205	19212	0 %	75 %	0 %	25 %	116326671
55	NC_008502	ATTG	2	8	19353	19360	25 %	50 %	25 %	0 %	116326671
56	NC_008502	GTTA	2	8	19510	19517	25 %	50 %	25 %	0 %	116326671
57	NC_008502	ACCG	2	8	19790	19797	25 %	0 %	25 %	50 %	116326671
58	NC_008502	CTTT	2	8	19939	19946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008502	CAAC	2	8	20014	20021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008502	CTTT	2	8	20814	20821	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008502	CTTA	2	8	20924	20931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008502	CTTT	2	8	21491	21498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008502	GGTC	2	8	22920	22927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008502	TGTT	2	8	23037	23044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008502	GAAA	2	8	24945	24952	75 %	0 %	25 %	0 %	116326674
66	NC_008502	ATGA	2	8	25619	25626	50 %	25 %	25 %	0 %	116326674
67	NC_008502	AATA	2	8	26031	26038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008502	TTTC	2	8	26601	26608	0 %	75 %	0 %	25 %	116326676
69	NC_008502	GCCA	2	8	26835	26842	25 %	0 %	25 %	50 %	116326676
70	NC_008502	TAGA	2	8	26872	26879	50 %	25 %	25 %	0 %	116326676
71	NC_008502	AGAT	2	8	27032	27039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008502	TAAA	3	12	27149	27160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008502	ATGA	2	8	27251	27258	50 %	25 %	25 %	0 %	116326677
74	NC_008502	TGAC	2	8	27915	27922	25 %	25 %	25 %	25 %	116326678
75	NC_008502	TGGT	2	8	28487	28494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.