MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 plasmid 1

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008502	ACCA	2	8	697	704	50 %	0 %	0 %	50 %	116326659
2	NC_008502	TAAT	2	8	876	883	50 %	50 %	0 %	0 %	116326659
3	NC_008502	ATGC	2	8	1407	1414	25 %	25 %	25 %	25 %	116326659
4	NC_008502	GCAA	2	8	1417	1424	50 %	0 %	25 %	25 %	116326659
5	NC_008502	AAAG	2	8	1483	1490	75 %	0 %	25 %	0 %	116326659
6	NC_008502	TTCA	2	8	1732	1739	25 %	50 %	0 %	25 %	116326659
7	NC_008502	CATT	2	8	1929	1936	25 %	50 %	0 %	25 %	116326659
8	NC_008502	CGAA	2	8	1983	1990	50 %	0 %	25 %	25 %	116326659
9	NC_008502	CAAA	2	8	2172	2179	75 %	0 %	0 %	25 %	116326659
10	NC_008502	CAAA	2	8	3034	3041	75 %	0 %	0 %	25 %	116326660
11	NC_008502	CCAT	2	8	3253	3260	25 %	25 %	0 %	50 %	116326660
12	NC_008502	TCAC	2	8	5968	5975	25 %	25 %	0 %	50 %	116326662
13	NC_008502	TTTG	2	8	5996	6003	0 %	75 %	25 %	0 %	116326662
14	NC_008502	AATC	2	8	6167	6174	50 %	25 %	0 %	25 %	116326662
15	NC_008502	CTTT	2	8	6223	6230	0 %	75 %	0 %	25 %	116326662
16	NC_008502	GCGG	2	8	7595	7602	0 %	0 %	75 %	25 %	116326663
17	NC_008502	GTTT	2	8	7636	7643	0 %	75 %	25 %	0 %	116326663
18	NC_008502	TTTG	2	8	7708	7715	0 %	75 %	25 %	0 %	116326663
19	NC_008502	GAAT	2	8	7912	7919	50 %	25 %	25 %	0 %	116326663
20	NC_008502	CAAA	2	8	8152	8159	75 %	0 %	0 %	25 %	116326663
21	NC_008502	CCTG	2	8	8337	8344	0 %	25 %	25 %	50 %	116326663
22	NC_008502	GTCA	2	8	8867	8874	25 %	25 %	25 %	25 %	116326663
23	NC_008502	TCGT	2	8	9329	9336	0 %	50 %	25 %	25 %	116326664
24	NC_008502	CTCA	2	8	9338	9345	25 %	25 %	0 %	50 %	116326664
25	NC_008502	GTCG	2	8	9478	9485	0 %	25 %	50 %	25 %	116326664
26	NC_008502	CCTG	2	8	9795	9802	0 %	25 %	25 %	50 %	116326664
27	NC_008502	TCAA	2	8	13077	13084	50 %	25 %	0 %	25 %	116326667
28	NC_008502	GATG	2	8	15775	15782	25 %	25 %	50 %	0 %	116326668
29	NC_008502	CCGA	2	8	16152	16159	25 %	0 %	25 %	50 %	116326669
30	NC_008502	AAGG	2	8	16296	16303	50 %	0 %	50 %	0 %	116326669
31	NC_008502	AACA	2	8	16603	16610	75 %	0 %	0 %	25 %	116326669
32	NC_008502	ACCT	2	8	16875	16882	25 %	25 %	0 %	50 %	116326670
33	NC_008502	GCCA	2	8	17150	17157	25 %	0 %	25 %	50 %	116326670
34	NC_008502	CGTT	2	8	18749	18756	0 %	50 %	25 %	25 %	116326671
35	NC_008502	TGTT	2	8	18778	18785	0 %	75 %	25 %	0 %	116326671
36	NC_008502	TTAA	2	8	18800	18807	50 %	50 %	0 %	0 %	116326671
37	NC_008502	TTTA	2	8	18883	18890	25 %	75 %	0 %	0 %	116326671
38	NC_008502	TTAA	2	8	18974	18981	50 %	50 %	0 %	0 %	116326671
39	NC_008502	ATTA	2	8	19129	19136	50 %	50 %	0 %	0 %	116326671
40	NC_008502	TTTC	2	8	19205	19212	0 %	75 %	0 %	25 %	116326671
41	NC_008502	ATTG	2	8	19353	19360	25 %	50 %	25 %	0 %	116326671
42	NC_008502	GTTA	2	8	19510	19517	25 %	50 %	25 %	0 %	116326671
43	NC_008502	ACCG	2	8	19790	19797	25 %	0 %	25 %	50 %	116326671
44	NC_008502	GAAA	2	8	24945	24952	75 %	0 %	25 %	0 %	116326674
45	NC_008502	ATGA	2	8	25619	25626	50 %	25 %	25 %	0 %	116326674
46	NC_008502	TTTC	2	8	26601	26608	0 %	75 %	0 %	25 %	116326676
47	NC_008502	GCCA	2	8	26835	26842	25 %	0 %	25 %	50 %	116326676
48	NC_008502	TAGA	2	8	26872	26879	50 %	25 %	25 %	0 %	116326676
49	NC_008502	ATGA	2	8	27251	27258	50 %	25 %	25 %	0 %	116326677
50	NC_008502	TGAC	2	8	27915	27922	25 %	25 %	25 %	25 %	116326678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.