MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 2

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008499	AGCA	2	8	631	638	50 %	0 %	25 %	25 %	116334880
2	NC_008499	CTTT	2	8	660	667	0 %	75 %	0 %	25 %	116334880
3	NC_008499	AAAG	2	8	1290	1297	75 %	0 %	25 %	0 %	116334881
4	NC_008499	CTAA	2	8	1567	1574	50 %	25 %	0 %	25 %	116334881
5	NC_008499	GAAC	2	8	2158	2165	50 %	0 %	25 %	25 %	116334881
6	NC_008499	AAGC	2	8	2899	2906	50 %	0 %	25 %	25 %	116334881
7	NC_008499	ATTA	2	8	2929	2936	50 %	50 %	0 %	0 %	116334881
8	NC_008499	TAAT	2	8	6213	6220	50 %	50 %	0 %	0 %	116334882
9	NC_008499	TCAA	2	8	6330	6337	50 %	25 %	0 %	25 %	116334882
10	NC_008499	CAAT	2	8	6600	6607	50 %	25 %	0 %	25 %	116334882
11	NC_008499	ATTT	2	8	6817	6824	25 %	75 %	0 %	0 %	116334882
12	NC_008499	TTCA	2	8	6920	6927	25 %	50 %	0 %	25 %	116334882
13	NC_008499	CAAA	2	8	7057	7064	75 %	0 %	0 %	25 %	116334882
14	NC_008499	ATTT	2	8	7780	7787	25 %	75 %	0 %	0 %	116334883
15	NC_008499	GAAA	2	8	8715	8722	75 %	0 %	25 %	0 %	116334884
16	NC_008499	GCAA	2	8	10098	10105	50 %	0 %	25 %	25 %	116334885
17	NC_008499	AGTT	2	8	10187	10194	25 %	50 %	25 %	0 %	116334885
18	NC_008499	TTGC	2	8	10243	10250	0 %	50 %	25 %	25 %	116334885
19	NC_008499	AAAT	2	8	13704	13711	75 %	25 %	0 %	0 %	116334886
20	NC_008499	CCAG	2	8	14749	14756	25 %	0 %	25 %	50 %	116334886
21	NC_008499	ATTA	2	8	15654	15661	50 %	50 %	0 %	0 %	116334887
22	NC_008499	ATGG	2	8	15779	15786	25 %	25 %	50 %	0 %	116334887
23	NC_008499	AGCC	2	8	16174	16181	25 %	0 %	25 %	50 %	116334887
24	NC_008499	ATTA	2	8	16588	16595	50 %	50 %	0 %	0 %	116334888
25	NC_008499	ATTT	2	8	16713	16720	25 %	75 %	0 %	0 %	116334888
26	NC_008499	ATTG	2	8	17368	17375	25 %	50 %	25 %	0 %	116334888
27	NC_008499	ATCG	2	8	17745	17752	25 %	25 %	25 %	25 %	116334889
28	NC_008499	ACGG	2	8	17959	17966	25 %	0 %	50 %	25 %	116334889
29	NC_008499	ACGC	2	8	21088	21095	25 %	0 %	25 %	50 %	116334890
30	NC_008499	GGTC	2	8	22203	22210	0 %	25 %	50 %	25 %	116334892
31	NC_008499	TTTA	2	8	22442	22449	25 %	75 %	0 %	0 %	116334892
32	NC_008499	TACA	2	8	23849	23856	50 %	25 %	0 %	25 %	116334893
33	NC_008499	TTAT	2	8	24027	24034	25 %	75 %	0 %	0 %	116334893
34	NC_008499	CAAG	2	8	27341	27348	50 %	0 %	25 %	25 %	116334895
35	NC_008499	TTAA	2	8	28023	28030	50 %	50 %	0 %	0 %	116334896
36	NC_008499	CTTG	2	8	28744	28751	0 %	50 %	25 %	25 %	116334898
37	NC_008499	GTAC	2	8	29089	29096	25 %	25 %	25 %	25 %	116334898
38	NC_008499	ACTG	2	8	29525	29532	25 %	25 %	25 %	25 %	116334899
39	NC_008499	CAAT	2	8	29537	29544	50 %	25 %	0 %	25 %	116334899
40	NC_008499	TGAT	2	8	29548	29555	25 %	50 %	25 %	0 %	116334899
41	NC_008499	CAAT	2	8	29886	29893	50 %	25 %	0 %	25 %	116334899
42	NC_008499	TGTC	2	8	30201	30208	0 %	50 %	25 %	25 %	116334899
43	NC_008499	AGAA	2	8	30310	30317	75 %	0 %	25 %	0 %	116334899
44	NC_008499	TTCA	2	8	30694	30701	25 %	50 %	0 %	25 %	116334899
45	NC_008499	AAAC	2	8	32673	32680	75 %	0 %	0 %	25 %	116334899
46	NC_008499	ACTG	2	8	33014	33021	25 %	25 %	25 %	25 %	116334899
47	NC_008499	GGAG	2	8	34009	34016	25 %	0 %	75 %	0 %	116334900
48	NC_008499	TGAT	2	8	34090	34097	25 %	50 %	25 %	0 %	116334900
49	NC_008499	CTTG	2	8	34470	34477	0 %	50 %	25 %	25 %	116334901
50	NC_008499	CTTT	2	8	34669	34676	0 %	75 %	0 %	25 %	116334901
51	NC_008499	TTTC	2	8	34733	34740	0 %	75 %	0 %	25 %	116334901
52	NC_008499	AACA	2	8	35075	35082	75 %	0 %	0 %	25 %	116334901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.