MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 2

Total Repeats: 441

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008499	CAC	2	6	9	14	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008499	ATA	2	6	145	150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008499	CAA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008499	GCT	2	6	368	373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008499	TAA	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334880
6	NC_008499	TCA	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334880
7	NC_008499	ATA	2	6	698	703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008499	TTG	2	6	748	753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008499	AGC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008499	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008499	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008499	CAG	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008499	TGT	2	6	980	985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008499	ACA	2	6	1027	1032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008499	GCT	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334881
16	NC_008499	GTG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334881
17	NC_008499	AAG	2	6	1175	1180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334881
18	NC_008499	ATT	2	6	1377	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334881
19	NC_008499	GGC	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334881
20	NC_008499	CAA	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
21	NC_008499	CAA	2	6	1801	1806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
22	NC_008499	AAG	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334881
23	NC_008499	ATA	2	6	1841	1846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334881
24	NC_008499	CAA	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
25	NC_008499	TTA	2	6	2011	2016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334881
26	NC_008499	CTG	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334881
27	NC_008499	GTT	2	6	2100	2105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334881
28	NC_008499	GTG	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334881
29	NC_008499	CGG	2	6	2179	2184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334881
30	NC_008499	TTA	2	6	2269	2274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334881
31	NC_008499	CAA	2	6	2278	2283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
32	NC_008499	ACA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
33	NC_008499	GTC	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334881
34	NC_008499	ATG	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334881
35	NC_008499	CAA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
36	NC_008499	ACA	2	6	2871	2876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
37	NC_008499	TGA	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334881
38	NC_008499	AGC	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334881
39	NC_008499	TTA	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008499	GAG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008499	AAC	2	6	3371	3376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008499	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008499	AAG	2	6	3586	3591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008499	ACC	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008499	ATC	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008499	ATT	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008499	TGG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008499	ACT	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008499	CAA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008499	AAG	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008499	TAA	2	6	4242	4247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008499	CAA	3	9	4264	4272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008499	CAA	2	6	4294	4299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008499	GAA	2	6	4336	4341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008499	AAC	2	6	4361	4366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008499	AAC	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008499	GTC	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008499	ATT	2	6	4708	4713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008499	TAT	2	6	4783	4788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008499	TGA	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008499	GAA	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008499	TTC	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008499	TGA	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008499	TGC	2	6	5117	5122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008499	TCA	2	6	5130	5135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008499	GAA	2	6	5168	5173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008499	GTT	2	6	5514	5519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008499	GTT	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008499	TGC	2	6	5735	5740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008499	ACG	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008499	CTA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008499	CCT	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008499	TCT	2	6	6243	6248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
74	NC_008499	TCT	2	6	6417	6422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
75	NC_008499	ACC	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334882
76	NC_008499	TCT	2	6	6432	6437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
77	NC_008499	ATA	2	6	6460	6465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
78	NC_008499	AAT	2	6	6496	6501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
79	NC_008499	TCT	2	6	6636	6641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
80	NC_008499	TCT	2	6	6643	6648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
81	NC_008499	TAT	2	6	6667	6672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334882
82	NC_008499	AAT	2	6	6706	6711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
83	NC_008499	TCT	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
84	NC_008499	TTA	2	6	6831	6836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334882
85	NC_008499	ATT	2	6	6867	6872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334882
86	NC_008499	TGA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334882
87	NC_008499	TAA	2	6	6989	6994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
88	NC_008499	ATC	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334882
89	NC_008499	CTG	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334882
90	NC_008499	CTT	2	6	7174	7179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008499	GAT	2	6	7285	7290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008499	ATG	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008499	TCG	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008499	TGT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008499	AAT	2	6	7555	7560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008499	CTT	2	6	7614	7619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008499	ATT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008499	AAG	2	6	7678	7683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008499	AAT	2	6	7709	7714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334883
100	NC_008499	ATC	2	6	7753	7758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334883
101	NC_008499	TCA	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334883
102	NC_008499	ATG	2	6	7792	7797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334883
103	NC_008499	TTG	2	6	7822	7827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334883
104	NC_008499	GTT	2	6	7942	7947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008499	CAA	2	6	8011	8016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008499	ATT	2	6	8239	8244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334884
107	NC_008499	TGA	2	6	8469	8474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334884
108	NC_008499	ATT	2	6	8483	8488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334884
109	NC_008499	CAA	2	6	8543	8548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334884
110	NC_008499	AGC	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334884
111	NC_008499	GAT	2	6	8609	8614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334884
112	NC_008499	GAC	2	6	8695	8700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334884
113	NC_008499	GAT	2	6	8736	8741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334884
114	NC_008499	ATA	2	6	8899	8904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008499	ATT	3	9	8985	8993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008499	TTG	2	6	9140	9145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334885
117	NC_008499	ATT	2	6	9214	9219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334885
118	NC_008499	GAT	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
119	NC_008499	TGG	3	9	9558	9566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334885
120	NC_008499	GAT	2	6	9621	9626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
121	NC_008499	TGA	2	6	9716	9721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
122	NC_008499	TTG	2	6	9812	9817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334885
123	NC_008499	CGC	2	6	9830	9835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116334885
124	NC_008499	GTT	2	6	9857	9862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334885
125	NC_008499	TGG	2	6	9876	9881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334885
126	NC_008499	CTG	2	6	9929	9934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334885
127	NC_008499	CGA	2	6	10144	10149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334885
128	NC_008499	TGA	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
129	NC_008499	GAT	2	6	10267	10272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
130	NC_008499	TGG	2	6	10274	10279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334885
131	NC_008499	TCA	2	6	10337	10342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008499	CAT	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008499	ATT	2	6	10461	10466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008499	TGA	2	6	10519	10524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008499	TCG	2	6	10528	10533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008499	TCA	2	6	10799	10804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008499	TTA	2	6	10815	10820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_008499	TCA	2	6	11223	11228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_008499	GTT	2	6	11284	11289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008499	TCA	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008499	GTA	2	6	11643	11648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_008499	TAT	2	6	35374	35379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.