MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 2

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008499	TAA	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334880
2	NC_008499	TCA	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334880
3	NC_008499	GCT	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334881
4	NC_008499	GTG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334881
5	NC_008499	AAG	2	6	1175	1180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334881
6	NC_008499	ATT	2	6	1377	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334881
7	NC_008499	GGC	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334881
8	NC_008499	CAA	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
9	NC_008499	CAA	2	6	1801	1806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
10	NC_008499	AAG	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334881
11	NC_008499	ATA	2	6	1841	1846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334881
12	NC_008499	CAA	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
13	NC_008499	TTA	2	6	2011	2016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334881
14	NC_008499	CTG	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334881
15	NC_008499	GTT	2	6	2100	2105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334881
16	NC_008499	GTG	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334881
17	NC_008499	CGG	2	6	2179	2184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334881
18	NC_008499	TTA	2	6	2269	2274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334881
19	NC_008499	CAA	2	6	2278	2283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
20	NC_008499	ACA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
21	NC_008499	GTC	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334881
22	NC_008499	ATG	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334881
23	NC_008499	CAA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
24	NC_008499	ACA	2	6	2871	2876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
25	NC_008499	TGA	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334881
26	NC_008499	AGC	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334881
27	NC_008499	TCT	2	6	6243	6248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
28	NC_008499	TCT	2	6	6417	6422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
29	NC_008499	ACC	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334882
30	NC_008499	TCT	2	6	6432	6437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
31	NC_008499	ATA	2	6	6460	6465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
32	NC_008499	AAT	2	6	6496	6501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
33	NC_008499	TCT	2	6	6636	6641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
34	NC_008499	TCT	2	6	6643	6648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
35	NC_008499	TAT	2	6	6667	6672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334882
36	NC_008499	AAT	2	6	6706	6711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
37	NC_008499	TCT	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
38	NC_008499	TTA	2	6	6831	6836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334882
39	NC_008499	ATT	2	6	6867	6872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334882
40	NC_008499	TGA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334882
41	NC_008499	TAA	2	6	6989	6994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
42	NC_008499	ATC	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334882
43	NC_008499	CTG	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334882
44	NC_008499	AAT	2	6	7709	7714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334883
45	NC_008499	ATC	2	6	7753	7758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334883
46	NC_008499	TCA	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334883
47	NC_008499	ATG	2	6	7792	7797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334883
48	NC_008499	TTG	2	6	7822	7827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334883
49	NC_008499	ATT	2	6	8239	8244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334884
50	NC_008499	TGA	2	6	8469	8474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334884
51	NC_008499	ATT	2	6	8483	8488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334884
52	NC_008499	CAA	2	6	8543	8548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334884
53	NC_008499	AGC	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334884
54	NC_008499	GAT	2	6	8609	8614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334884
55	NC_008499	GAC	2	6	8695	8700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334884
56	NC_008499	GAT	2	6	8736	8741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334884
57	NC_008499	TTG	2	6	9140	9145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334885
58	NC_008499	ATT	2	6	9214	9219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334885
59	NC_008499	GAT	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
60	NC_008499	TGG	3	9	9558	9566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334885
61	NC_008499	GAT	2	6	9621	9626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
62	NC_008499	TGA	2	6	9716	9721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
63	NC_008499	TTG	2	6	9812	9817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334885
64	NC_008499	CGC	2	6	9830	9835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116334885
65	NC_008499	GTT	2	6	9857	9862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334885
66	NC_008499	TGG	2	6	9876	9881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334885
67	NC_008499	CTG	2	6	9929	9934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334885
68	NC_008499	CGA	2	6	10144	10149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334885
69	NC_008499	TGA	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
70	NC_008499	GAT	2	6	10267	10272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
71	NC_008499	TGG	2	6	10274	10279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334885
72	NC_008499	TTG	3	9	13473	13481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334886
73	NC_008499	CGG	2	6	13492	13497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334886
74	NC_008499	ATG	2	6	13629	13634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334886
75	NC_008499	GCT	2	6	13952	13957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334886
76	NC_008499	CTG	2	6	14133	14138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334886
77	NC_008499	AGT	2	6	14434	14439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334886
78	NC_008499	TCA	2	6	14444	14449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334886
79	NC_008499	TCA	2	6	14626	14631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334886
80	NC_008499	GGT	2	6	14639	14644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334886
81	NC_008499	CAA	2	6	14702	14707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334886
82	NC_008499	AGC	2	6	14788	14793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334886
83	NC_008499	TGA	2	6	15628	15633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334887
84	NC_008499	TGC	2	6	15669	15674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334887
85	NC_008499	TCA	2	6	15682	15687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334887
86	NC_008499	GAA	2	6	15720	15725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334887
87	NC_008499	GTT	2	6	16066	16071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334887
88	NC_008499	GTT	2	6	16076	16081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334887
89	NC_008499	TGC	2	6	16287	16292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334887
90	NC_008499	ACG	2	6	16305	16310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334887
91	NC_008499	GCG	2	6	16662	16667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334888
92	NC_008499	TGT	2	6	16790	16795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334888
93	NC_008499	TGT	2	6	16805	16810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334888
94	NC_008499	CTG	2	6	16873	16878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334888
95	NC_008499	TGC	2	6	16909	16914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334888
96	NC_008499	TGC	2	6	16918	16923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334888
97	NC_008499	AAG	2	6	17052	17057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334888
98	NC_008499	ATT	2	6	17083	17088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334888
99	NC_008499	ATA	2	6	17147	17152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334888
100	NC_008499	CCG	2	6	17172	17177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116334888
101	NC_008499	TTC	2	6	17245	17250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334888
102	NC_008499	CAG	2	6	17262	17267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334888
103	NC_008499	CGC	2	6	17280	17285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116334888
104	NC_008499	CAA	2	6	17295	17300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334888
105	NC_008499	GGC	2	6	17344	17349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334888
106	NC_008499	AAC	2	6	17351	17356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334888
107	NC_008499	CGT	2	6	17494	17499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334888
108	NC_008499	AAT	2	6	17535	17540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334888
109	NC_008499	CCA	2	6	17671	17676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334889
110	NC_008499	CAT	2	6	17816	17821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334889
111	NC_008499	ATT	2	6	17868	17873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334889
112	NC_008499	AGC	2	6	17984	17989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334889
113	NC_008499	AAT	2	6	18004	18009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334889
114	NC_008499	ACT	2	6	20681	20686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334890
115	NC_008499	GTT	2	6	20971	20976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334890
116	NC_008499	TGA	2	6	21004	21009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334890
117	NC_008499	GAT	2	6	21058	21063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334890
118	NC_008499	AGC	2	6	21096	21101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334890
119	NC_008499	TAT	2	6	21554	21559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334891
120	NC_008499	TTC	2	6	21590	21595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334891
121	NC_008499	CTC	2	6	21746	21751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116334892
122	NC_008499	TAC	2	6	21785	21790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334892
123	NC_008499	AAT	2	6	21971	21976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334892
124	NC_008499	ATT	2	6	22109	22114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334892
125	NC_008499	TAA	2	6	22421	22426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334892
126	NC_008499	GTT	3	9	22473	22481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334892
127	NC_008499	TAT	2	6	23783	23788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334893
128	NC_008499	TGT	2	6	23803	23808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334893
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.