MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008498	CTC	2	6	10	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008498	TAT	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008498	CAA	2	6	98	103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008498	TTA	2	6	218	223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008498	TTA	2	6	1308	1313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008498	TTA	2	6	1376	1381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008498	AAT	2	6	1394	1399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008498	CTA	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008498	TCT	2	6	2487	2492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008498	CAT	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008498	GCC	2	6	2585	2590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008498	TCG	2	6	2631	2636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008498	TCA	2	6	2665	2670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008498	CAC	2	6	2671	2676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_008498	TGA	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008498	TCA	2	6	3310	3315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008498	ATA	2	6	5074	5079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008498	TAA	2	6	5118	5123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008498	GAA	2	6	5134	5139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008498	AAT	2	6	5822	5827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008498	CTG	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008498	ATG	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008498	GCT	2	6	6167	6172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008498	CAA	2	6	6174	6179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008498	GGA	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008498	CGA	2	6	6353	6358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008498	AAG	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008498	TGC	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008498	CAT	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008498	GGT	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008498	GCA	2	6	6645	6650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008498	ACC	2	6	7846	7851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008498	ATT	2	6	7883	7888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008498	TTG	2	6	7912	7917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008498	TAA	2	6	8047	8052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008498	TTA	2	6	8086	8091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008498	AGC	2	6	8150	8155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008498	GGC	2	6	9426	9431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008498	TCA	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008498	CAA	2	6	9496	9501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008498	TAA	2	6	9698	9703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008498	TGG	2	6	9724	9729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008498	TTA	2	6	9747	9752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008498	GTT	2	6	9769	9774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008498	ATT	2	6	9956	9961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008498	GGT	2	6	9964	9969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008498	ATT	2	6	10620	10625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008498	TTC	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008498	TCT	2	6	10936	10941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008498	AGG	2	6	11184	11189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008498	ACC	2	6	11966	11971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008498	ATT	2	6	12075	12080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008498	AGG	2	6	12089	12094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008498	ATA	2	6	12814	12819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008498	TTC	2	6	12977	12982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008498	GGT	2	6	13003	13008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008498	TTC	2	6	13068	13073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008498	CTT	2	6	13093	13098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008498	TGA	2	6	13125	13130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008498	TCA	2	6	13199	13204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008498	TCA	2	6	13239	13244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008498	AAT	2	6	13324	13329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008498	TAA	2	6	13398	13403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.