MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 plasmid pLEUM1

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008496	TATTT	2	10	2749	2758	20 %	80 %	0 %	0 %	116326496
2	NC_008496	TACAT	2	10	4151	4160	40 %	40 %	0 %	20 %	116326498
3	NC_008496	TGCAT	2	10	4208	4217	20 %	40 %	20 %	20 %	116326498
4	NC_008496	CCAAG	2	10	9113	9122	40 %	0 %	20 %	40 %	116326502
5	NC_008496	ATATT	2	10	11536	11545	40 %	60 %	0 %	0 %	116326505
6	NC_008496	GAAAT	2	10	13159	13168	60 %	20 %	20 %	0 %	116326507
7	NC_008496	GTGGC	2	10	13238	13247	0 %	20 %	60 %	20 %	116326507
8	NC_008496	AATGC	2	10	13350	13359	40 %	20 %	20 %	20 %	116326507
9	NC_008496	ACATT	2	10	14451	14460	40 %	40 %	0 %	20 %	116326508
10	NC_008496	TCAAT	2	10	14568	14577	40 %	40 %	0 %	20 %	116326508
11	NC_008496	CCCCA	2	10	18467	18476	20 %	0 %	0 %	80 %	116326513
12	NC_008496	TAATT	2	10	25793	25802	40 %	60 %	0 %	0 %	116326518
13	NC_008496	TTCAA	2	10	25985	25994	40 %	40 %	0 %	20 %	116326518
14	NC_008496	TAATT	2	10	26465	26474	40 %	60 %	0 %	0 %	116326518
15	NC_008496	GAAAA	2	10	26873	26882	80 %	0 %	20 %	0 %	116326518
16	NC_008496	TGGTT	2	10	27761	27770	0 %	60 %	40 %	0 %	116326519
17	NC_008496	ATATA	2	10	28015	28024	60 %	40 %	0 %	0 %	116326519
18	NC_008496	GTGTT	2	10	28044	28053	0 %	60 %	40 %	0 %	116326519
19	NC_008496	GATAA	2	10	28382	28391	60 %	20 %	20 %	0 %	116326519
20	NC_008496	GAGAA	2	10	29758	29767	60 %	0 %	40 %	0 %	116326521
21	NC_008496	CACAA	2	10	33089	33098	60 %	0 %	0 %	40 %	116326524
22	NC_008496	GAGAA	2	10	34862	34871	60 %	0 %	40 %	0 %	116326526
23	NC_008496	TTACC	2	10	35833	35842	20 %	40 %	0 %	40 %	116326528
24	NC_008496	AGTGA	2	10	35935	35944	40 %	20 %	40 %	0 %	116326528
25	NC_008496	AAGCA	2	10	36725	36734	60 %	0 %	20 %	20 %	116326528

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.