MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 plasmid pLEUM1

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008496	CTT	2	6	336	341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008496	GCT	2	6	376	381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008496	ATC	2	6	490	495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008496	TTG	2	6	498	503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008496	AGA	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008496	ATT	2	6	1593	1598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008496	GGA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008496	ATG	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008496	GCG	2	6	5412	5417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008496	ATT	2	6	5427	5432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008496	CAA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008496	TGA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008496	GAC	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008496	CAA	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008496	AAC	2	6	5738	5743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008496	AAT	2	6	5913	5918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008496	CAC	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008496	ATT	2	6	6595	6600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008496	CTT	3	9	6627	6635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008496	CAG	2	6	6654	6659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008496	AAT	2	6	6700	6705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008496	CTG	2	6	6854	6859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008496	ATT	2	6	6977	6982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008496	TGG	2	6	7212	7217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008496	ATG	2	6	7227	7232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008496	AAT	2	6	7936	7941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008496	CAA	2	6	8073	8078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008496	ACA	2	6	8129	8134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008496	GAT	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008496	CAT	2	6	8411	8416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008496	ACA	2	6	9888	9893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008496	GGA	2	6	10023	10028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008496	ATT	2	6	10054	10059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008496	TAT	2	6	10112	10117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008496	TGC	2	6	10315	10320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008496	ACC	2	6	10765	10770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008496	AAC	2	6	10789	10794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008496	TCT	2	6	10855	10860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008496	ATT	2	6	10888	10893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008496	ACC	2	6	10930	10935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008496	TGG	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008496	TAA	2	6	11183	11188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008496	ATT	2	6	11201	11206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008496	GTA	2	6	12754	12759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008496	TAT	2	6	12782	12787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008496	TAA	2	6	12835	12840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008496	TGA	2	6	12863	12868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008496	TAT	2	6	12892	12897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008496	ATT	2	6	12899	12904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008496	ATG	2	6	12918	12923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008496	ATC	2	6	13519	13524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008496	GTT	2	6	13726	13731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008496	CAA	2	6	13747	13752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008496	TAT	2	6	13971	13976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008496	GGT	2	6	15086	15091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008496	CAA	2	6	15132	15137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008496	CGT	2	6	15192	15197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008496	ATT	2	6	15244	15249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008496	ATA	2	6	15842	15847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008496	TTG	2	6	15864	15869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008496	TGT	2	6	15883	15888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008496	TAA	2	6	16051	16056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008496	GCT	2	6	16180	16185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008496	TAA	2	6	18612	18617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008496	TAA	2	6	18702	18707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008496	ATT	2	6	18750	18755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008496	TAT	2	6	18780	18785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008496	TTA	2	6	18815	18820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008496	CCA	2	6	18833	18838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008496	TGT	2	6	18916	18921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008496	ACT	2	6	19073	19078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008496	GTA	2	6	19124	19129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008496	ATA	2	6	19216	19221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008496	AGT	2	6	19275	19280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008496	TCT	2	6	19372	19377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008496	CAA	2	6	19454	19459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008496	CTT	2	6	19460	19465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008496	ATA	3	9	19517	19525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008496	TGT	2	6	19544	19549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008496	TGG	2	6	19583	19588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008496	AGA	2	6	19651	19656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008496	TCT	2	6	19680	19685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008496	AAT	2	6	19774	19779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008496	ATC	2	6	19793	19798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008496	TAA	2	6	19802	19807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008496	TAA	2	6	19829	19834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008496	ATT	2	6	19847	19852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008496	AAG	2	6	19937	19942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008496	TTG	2	6	20060	20065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008496	TAA	2	6	20265	20270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008496	TAA	2	6	20299	20304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008496	TTA	2	6	20305	20310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008496	AGG	2	6	20321	20326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008496	GGA	2	6	20920	20925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008496	ATT	2	6	21571	21576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008496	CTC	2	6	21594	21599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008496	TAG	2	6	21615	21620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008496	GCT	2	6	21727	21732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008496	CTT	2	6	21770	21775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008496	TGA	2	6	21934	21939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008496	TCT	2	6	22019	22024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008496	ACG	2	6	22280	22285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008496	TCC	2	6	22554	22559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_008496	CTT	2	6	22708	22713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008496	TAA	2	6	22874	22879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008496	TAA	2	6	23648	23653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008496	TGG	2	6	23725	23730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008496	TTG	2	6	23757	23762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008496	GTT	2	6	23837	23842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008496	AGT	2	6	23854	23859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008496	ACT	2	6	23863	23868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008496	TTA	2	6	23959	23964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008496	AAC	2	6	23972	23977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008496	ATT	2	6	24076	24081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008496	TAA	2	6	24149	24154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008496	TTG	2	6	24268	24273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008496	TCA	2	6	24309	24314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008496	GTA	2	6	24513	24518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008496	ATG	2	6	24556	24561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008496	ATT	2	6	24572	24577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008496	GCT	2	6	25113	25118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008496	ATT	2	6	25203	25208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008496	TAT	2	6	25228	25233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008496	ATT	3	9	25263	25271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008496	GGC	2	6	25287	25292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008496	GAC	2	6	25295	25300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008496	ATG	2	6	25311	25316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008496	TGT	2	6	25582	25587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008496	AAT	2	6	27209	27214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008496	AAT	2	6	27237	27242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008496	AAG	2	6	27376	27381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008496	ATG	2	6	27391	27396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008496	TAA	2	6	27482	27487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008496	AAT	2	6	27554	27559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008496	AAT	2	6	27580	27585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008496	ATT	2	6	28820	28825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008496	GTA	2	6	28917	28922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008496	AGC	2	6	30050	30055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008496	CCT	2	6	30443	30448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_008496	CTG	2	6	30579	30584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008496	CGG	2	6	30632	30637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008496	AAT	2	6	30747	30752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.