MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 plasmid pLEUM1

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008496	CAG	2	6	53	58	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326494
2	NC_008496	GTC	2	6	112	117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326494
3	NC_008496	CTG	2	6	128	133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326494
4	NC_008496	ATG	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326495
5	NC_008496	TTG	2	6	893	898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326495
6	NC_008496	CAT	2	6	974	979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326495
7	NC_008496	TCG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326495
8	NC_008496	GTC	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326495
9	NC_008496	ACA	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326495
10	NC_008496	ATT	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326495
11	NC_008496	CAA	2	6	1513	1518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326495
12	NC_008496	ATA	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326496
13	NC_008496	ACA	2	6	1976	1981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326496
14	NC_008496	TAT	2	6	1999	2004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326496
15	NC_008496	GAA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326496
16	NC_008496	AAC	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326496
17	NC_008496	TGA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326496
18	NC_008496	AGA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326496
19	NC_008496	ACT	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326496
20	NC_008496	TAT	2	6	2449	2454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326496
21	NC_008496	ATT	2	6	2516	2521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326496
22	NC_008496	AGA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326496
23	NC_008496	GAT	2	6	2854	2859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326496
24	NC_008496	AAT	2	6	2870	2875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326496
25	NC_008496	AGG	3	9	2877	2885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326496
26	NC_008496	ATC	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326496
27	NC_008496	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326496
28	NC_008496	TAT	2	6	3258	3263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326496
29	NC_008496	GAC	2	6	3366	3371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326496
30	NC_008496	GTT	2	6	3389	3394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326496
31	NC_008496	TAA	2	6	3600	3605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326496
32	NC_008496	TAG	2	6	3681	3686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326496
33	NC_008496	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326497
34	NC_008496	CTG	2	6	3873	3878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326497
35	NC_008496	TGA	2	6	3937	3942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326497
36	NC_008496	TCA	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326498
37	NC_008496	CAA	2	6	4306	4311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326498
38	NC_008496	TTC	2	6	4349	4354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326498
39	NC_008496	CTG	2	6	4369	4374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326498
40	NC_008496	TAG	2	6	4393	4398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326498
41	NC_008496	AAG	3	9	4450	4458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326498
42	NC_008496	ATG	2	6	4462	4467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326498
43	NC_008496	TAA	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326498
44	NC_008496	AGA	2	6	4553	4558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326498
45	NC_008496	ATC	2	6	4613	4618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326499
46	NC_008496	ATC	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326499
47	NC_008496	ATG	2	6	4667	4672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326499
48	NC_008496	TAT	2	6	4730	4735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326499
49	NC_008496	CGA	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326499
50	NC_008496	ATT	2	6	5074	5079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326499
51	NC_008496	TCA	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326499
52	NC_008496	ATT	3	9	5271	5279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326499
53	NC_008496	ACG	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326500
54	NC_008496	ATC	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326500
55	NC_008496	TTA	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326500
56	NC_008496	TCG	2	6	6372	6377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326500
57	NC_008496	TTG	2	6	6480	6485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326500
58	NC_008496	ATT	3	9	6510	6518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326500
59	NC_008496	TTA	2	6	7331	7336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326501
60	NC_008496	CAA	2	6	7652	7657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326501
61	NC_008496	TTG	2	6	7661	7666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326501
62	NC_008496	TCA	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326501
63	NC_008496	GCA	2	6	7792	7797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326501
64	NC_008496	TTG	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326501
65	NC_008496	CAT	2	6	8607	8612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326502
66	NC_008496	TAA	2	6	8919	8924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326502
67	NC_008496	ATC	2	6	9001	9006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326502
68	NC_008496	TTG	2	6	9025	9030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326502
69	NC_008496	ACA	2	6	9076	9081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326502
70	NC_008496	CGA	2	6	9149	9154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326502
71	NC_008496	GCC	2	6	9166	9171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326502
72	NC_008496	TAT	2	6	9185	9190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326502
73	NC_008496	GCA	2	6	9255	9260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326503
74	NC_008496	TTA	2	6	9345	9350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326503
75	NC_008496	TAA	2	6	9380	9385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326503
76	NC_008496	CAC	2	6	9439	9444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326503
77	NC_008496	ATT	2	6	9494	9499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326503
78	NC_008496	GTT	2	6	9595	9600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326503
79	NC_008496	GCC	2	6	9619	9624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326503
80	NC_008496	TAA	2	6	9713	9718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326503
81	NC_008496	CAC	2	6	9730	9735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326503
82	NC_008496	CAT	2	6	9787	9792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326503
83	NC_008496	GTT	2	6	10414	10419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326504
84	NC_008496	CAC	2	6	10513	10518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326504
85	NC_008496	TAA	2	6	10525	10530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326504
86	NC_008496	AAT	2	6	10549	10554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326504
87	NC_008496	AGT	2	6	10573	10578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326504
88	NC_008496	CTA	2	6	10581	10586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326504
89	NC_008496	TTG	2	6	11313	11318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326505
90	NC_008496	TAA	2	6	11448	11453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326505
91	NC_008496	ATC	2	6	11469	11474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326505
92	NC_008496	CTA	2	6	11486	11491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326505
93	NC_008496	TGA	2	6	11560	11565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326505
94	NC_008496	AGT	2	6	11606	11611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326505
95	NC_008496	ATT	2	6	11634	11639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326505
96	NC_008496	ATC	2	6	11706	11711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326505
97	NC_008496	GTT	2	6	11769	11774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326505
98	NC_008496	TAA	2	6	11790	11795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326505
99	NC_008496	CAA	2	6	11906	11911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326505
100	NC_008496	ATT	2	6	12021	12026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326505
101	NC_008496	CAA	2	6	12110	12115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326505
102	NC_008496	TCC	2	6	12144	12149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326505
103	NC_008496	TCA	2	6	12223	12228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326505
104	NC_008496	TTA	2	6	12396	12401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326506
105	NC_008496	TCA	2	6	12435	12440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326506
106	NC_008496	AAT	2	6	12443	12448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326506
107	NC_008496	TTA	2	6	12516	12521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326506
108	NC_008496	TTC	2	6	12650	12655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326506
109	NC_008496	TGA	2	6	12678	12683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326506
110	NC_008496	TAT	2	6	12703	12708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326506
111	NC_008496	AAT	2	6	13194	13199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326507
112	NC_008496	ATT	2	6	13372	13377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326507
113	NC_008496	ATT	2	6	14091	14096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326508
114	NC_008496	ATT	2	6	14138	14143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326508
115	NC_008496	AAG	2	6	14208	14213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326508
116	NC_008496	ATT	3	9	14219	14227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326508
117	NC_008496	ATT	2	6	14270	14275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326508
118	NC_008496	TAT	2	6	14301	14306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326508
119	NC_008496	CAA	2	6	14340	14345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326508
120	NC_008496	CAC	2	6	14440	14445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326508
121	NC_008496	TAA	2	6	14562	14567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326508
122	NC_008496	CCA	2	6	15314	15319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326509
123	NC_008496	ATT	2	6	15374	15379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326509
124	NC_008496	TCT	2	6	15440	15445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326509
125	NC_008496	TCT	2	6	15464	15469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326509
126	NC_008496	CGA	2	6	15502	15507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326509
127	NC_008496	ATC	2	6	15511	15516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326509
128	NC_008496	TGA	2	6	15523	15528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326509
129	NC_008496	TAG	2	6	15538	15543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326509
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254	NC_008496	ATG	2	6	33762	33767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326524
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.