MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 4174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008435	GCATC	2	10	862	871	20 %	20 %	20 %	40 %	115522031
2	NC_008435	GCCGC	2	10	937	946	0 %	0 %	40 %	60 %	115522031
3	NC_008435	ACGCT	2	10	1913	1922	20 %	20 %	20 %	40 %	115522031
4	NC_008435	ACCAC	2	10	1959	1968	40 %	0 %	0 %	60 %	115522031
5	NC_008435	GCGCC	2	10	3752	3761	0 %	0 %	40 %	60 %	115522033
6	NC_008435	CAGCG	2	10	4116	4125	20 %	0 %	40 %	40 %	115522033
7	NC_008435	GCGCG	2	10	4713	4722	0 %	0 %	60 %	40 %	115522033
8	NC_008435	TGCGC	2	10	5096	5105	0 %	20 %	40 %	40 %	115522034
9	NC_008435	TCAGC	2	10	5665	5674	20 %	20 %	20 %	40 %	115522034
10	NC_008435	GTGCT	2	10	7300	7309	0 %	40 %	40 %	20 %	115522035
11	NC_008435	AGCAA	2	10	7791	7800	60 %	0 %	20 %	20 %	115522035
12	NC_008435	CCGCG	2	10	8842	8851	0 %	0 %	40 %	60 %	115522035
13	NC_008435	CCCGA	2	10	11493	11502	20 %	0 %	20 %	60 %	115522038
14	NC_008435	ATCGC	2	10	13590	13599	20 %	20 %	20 %	40 %	115522042
15	NC_008435	TGGCC	2	10	14966	14975	0 %	20 %	40 %	40 %	115522043
16	NC_008435	TCCGG	2	10	18439	18448	0 %	20 %	40 %	40 %	115522047
17	NC_008435	CCCAG	2	10	19157	19166	20 %	0 %	20 %	60 %	115522048
18	NC_008435	GATCA	2	10	20772	20781	40 %	20 %	20 %	20 %	115522049
19	NC_008435	GCGTT	2	10	22587	22596	0 %	40 %	40 %	20 %	115522050
20	NC_008435	CCGCG	2	10	23011	23020	0 %	0 %	40 %	60 %	115522051
21	NC_008435	CGCGG	2	10	25623	25632	0 %	0 %	60 %	40 %	115522054
22	NC_008435	CGGCG	2	10	27444	27453	0 %	0 %	60 %	40 %	115522055
23	NC_008435	CCGGC	2	10	27579	27588	0 %	0 %	40 %	60 %	115522055
24	NC_008435	GCGCC	2	10	30688	30697	0 %	0 %	40 %	60 %	115522057
25	NC_008435	GCCGC	2	10	33428	33437	0 %	0 %	40 %	60 %	115522058
26	NC_008435	GCGCC	2	10	34349	34358	0 %	0 %	40 %	60 %	115522059
27	NC_008435	GCGCC	2	10	35927	35936	0 %	0 %	40 %	60 %	115522062
28	NC_008435	CCGCG	2	10	37643	37652	0 %	0 %	40 %	60 %	115522063
29	NC_008435	CGCGG	2	10	37859	37868	0 %	0 %	60 %	40 %	115522063
30	NC_008435	ACCGC	2	10	38932	38941	20 %	0 %	20 %	60 %	115522064
31	NC_008435	GTCCG	2	10	40519	40528	0 %	20 %	40 %	40 %	115522065
32	NC_008435	GCCGA	2	10	42410	42419	20 %	0 %	40 %	40 %	115522068
33	NC_008435	TGCGC	2	10	42796	42805	0 %	20 %	40 %	40 %	115522068
34	NC_008435	GTGCT	2	10	47037	47046	0 %	40 %	40 %	20 %	115522073
35	NC_008435	GGGCT	2	10	47151	47160	0 %	20 %	60 %	20 %	115522073
36	NC_008435	GGCGA	2	10	48198	48207	20 %	0 %	60 %	20 %	115522075
37	NC_008435	CGGCG	2	10	51101	51110	0 %	0 %	60 %	40 %	115522076
38	NC_008435	CAGGA	2	10	53070	53079	40 %	0 %	40 %	20 %	115522079
39	NC_008435	CGTTG	2	10	54109	54118	0 %	40 %	40 %	20 %	115522081
40	NC_008435	CGCGG	2	10	55207	55216	0 %	0 %	60 %	40 %	115522082
41	NC_008435	GCGCA	2	10	56086	56095	20 %	0 %	40 %	40 %	115522083
42	NC_008435	CCGAC	2	10	56099	56108	20 %	0 %	20 %	60 %	115522083
43	NC_008435	CCCGG	2	10	56747	56756	0 %	0 %	40 %	60 %	115522084
44	NC_008435	GCATC	2	10	59757	59766	20 %	20 %	20 %	40 %	115522087
45	NC_008435	CTCGC	2	10	61376	61385	0 %	20 %	20 %	60 %	115522088
46	NC_008435	CGGCC	2	10	61501	61510	0 %	0 %	40 %	60 %	115522088
47	NC_008435	GCACG	2	10	62906	62915	20 %	0 %	40 %	40 %	115522089
48	NC_008435	GCTCA	2	10	65722	65731	20 %	20 %	20 %	40 %	115522090
49	NC_008435	GCCAA	2	10	66407	66416	40 %	0 %	20 %	40 %	115522090
50	NC_008435	CGCGG	2	10	66444	66453	0 %	0 %	60 %	40 %	115522090
51	NC_008435	GCGCG	2	10	68256	68265	0 %	0 %	60 %	40 %	115522090
52	NC_008435	CCGGC	2	10	68845	68854	0 %	0 %	40 %	60 %	115522090
53	NC_008435	CGGCG	2	10	70895	70904	0 %	0 %	60 %	40 %	115522092
54	NC_008435	GCCTG	2	10	71560	71569	0 %	20 %	40 %	40 %	115522092
55	NC_008435	CGGCG	2	10	72285	72294	0 %	0 %	60 %	40 %	115522092
56	NC_008435	TGCGG	2	10	74436	74445	0 %	20 %	60 %	20 %	115522094
57	NC_008435	GGCCT	2	10	74490	74499	0 %	20 %	40 %	40 %	115522094
58	NC_008435	CCGCG	2	10	75903	75912	0 %	0 %	40 %	60 %	115522095
59	NC_008435	CCGCA	2	10	78184	78193	20 %	0 %	20 %	60 %	115522098
60	NC_008435	TCGCC	2	10	80774	80783	0 %	20 %	20 %	60 %	115522099
61	NC_008435	CGGCG	2	10	82771	82780	0 %	0 %	60 %	40 %	115522100
62	NC_008435	TGCGC	2	10	82899	82908	0 %	20 %	40 %	40 %	115522100
63	NC_008435	GGCGC	2	10	83880	83889	0 %	0 %	60 %	40 %	115522101
64	NC_008435	GACGA	2	10	84943	84952	40 %	0 %	40 %	20 %	115522102
65	NC_008435	TGGCT	2	10	88032	88041	0 %	40 %	40 %	20 %	115522106
66	NC_008435	GGCCG	2	10	88863	88872	0 %	0 %	60 %	40 %	115522106
67	NC_008435	CGCGC	2	10	90204	90213	0 %	0 %	40 %	60 %	115522108
68	NC_008435	CGGCG	2	10	93521	93530	0 %	0 %	60 %	40 %	115522111
69	NC_008435	GCCTC	2	10	93546	93555	0 %	20 %	20 %	60 %	115522111
70	NC_008435	GCCGC	2	10	94989	94998	0 %	0 %	40 %	60 %	115522113
71	NC_008435	CGCGG	2	10	95112	95121	0 %	0 %	60 %	40 %	115522113
72	NC_008435	CCACA	2	10	95684	95693	40 %	0 %	0 %	60 %	115522114
73	NC_008435	CGAGC	2	10	97875	97884	20 %	0 %	40 %	40 %	115522115
74	NC_008435	CGGGC	2	10	98139	98148	0 %	0 %	60 %	40 %	115522115
75	NC_008435	GTCCG	2	10	98352	98361	0 %	20 %	40 %	40 %	115522115
76	NC_008435	CGGTG	2	10	99739	99748	0 %	20 %	60 %	20 %	115522116
77	NC_008435	GCCGA	2	10	101252	101261	20 %	0 %	40 %	40 %	115522116
78	NC_008435	GGCGC	2	10	104126	104135	0 %	0 %	60 %	40 %	115522120
79	NC_008435	CTGCC	2	10	106198	106207	0 %	20 %	20 %	60 %	115522121
80	NC_008435	CCGCG	2	10	106766	106775	0 %	0 %	40 %	60 %	115522121
81	NC_008435	GGCGT	2	10	107899	107908	0 %	20 %	60 %	20 %	115522122
82	NC_008435	CGGCT	2	10	108904	108913	0 %	20 %	40 %	40 %	115522123
83	NC_008435	CCGCG	2	10	109239	109248	0 %	0 %	40 %	60 %	115522123
84	NC_008435	GCGCC	2	10	109554	109563	0 %	0 %	40 %	60 %	115522123
85	NC_008435	TCCGG	2	10	113110	113119	0 %	20 %	40 %	40 %	115522126
86	NC_008435	GCAGC	2	10	114874	114883	20 %	0 %	40 %	40 %	115522128
87	NC_008435	GCGCG	2	10	114952	114961	0 %	0 %	60 %	40 %	115522128
88	NC_008435	CTGGA	2	10	116105	116114	20 %	20 %	40 %	20 %	115522128
89	NC_008435	AAGGC	2	10	121153	121162	40 %	0 %	40 %	20 %	115522134
90	NC_008435	GCCGA	2	10	121514	121523	20 %	0 %	40 %	40 %	115522135
91	NC_008435	CCGCA	2	10	123929	123938	20 %	0 %	20 %	60 %	115522137
92	NC_008435	CGGGC	2	10	124535	124544	0 %	0 %	60 %	40 %	115522138
93	NC_008435	GCCGG	2	10	124950	124959	0 %	0 %	60 %	40 %	115522138
94	NC_008435	CCCGC	2	10	125265	125274	0 %	0 %	20 %	80 %	115522139
95	NC_008435	TGATC	2	10	127466	127475	20 %	40 %	20 %	20 %	115522141
96	NC_008435	GCGAA	2	10	128399	128408	40 %	0 %	40 %	20 %	115522142
97	NC_008435	GTCAG	2	10	129725	129734	20 %	20 %	40 %	20 %	115522143
98	NC_008435	CGGCG	2	10	129760	129769	0 %	0 %	60 %	40 %	115522143
99	NC_008435	CACGA	2	10	130312	130321	40 %	0 %	20 %	40 %	115522143
100	NC_008435	GCCGA	2	10	133770	133779	20 %	0 %	40 %	40 %	115522145
101	NC_008435	GCCCG	2	10	136005	136014	0 %	0 %	40 %	60 %	115522147
102	NC_008435	CGATC	2	10	138347	138356	20 %	20 %	20 %	40 %	115522150
103	NC_008435	CCACG	2	10	139367	139376	20 %	0 %	20 %	60 %	115522150
104	NC_008435	CGGCG	2	10	141910	141919	0 %	0 %	60 %	40 %	115522153
105	NC_008435	CGCGG	2	10	142913	142922	0 %	0 %	60 %	40 %	115522154
106	NC_008435	GCGCG	2	10	143140	143149	0 %	0 %	60 %	40 %	115522154
107	NC_008435	GCCAG	2	10	145892	145901	20 %	0 %	40 %	40 %	115522157
108	NC_008435	CAGCG	2	10	146491	146500	20 %	0 %	40 %	40 %	115522157
109	NC_008435	TCGGT	2	10	146938	146947	0 %	40 %	40 %	20 %	115522157
110	NC_008435	GGCCG	2	10	148798	148807	0 %	0 %	60 %	40 %	115522158
111	NC_008435	CGCGG	2	10	150793	150802	0 %	0 %	60 %	40 %	115522160
112	NC_008435	ATCGA	2	10	152172	152181	40 %	20 %	20 %	20 %	115522160
113	NC_008435	TCACA	2	10	152996	153005	40 %	20 %	0 %	40 %	115522160
114	NC_008435	GGCGT	2	10	153249	153258	0 %	20 %	60 %	20 %	115522160
115	NC_008435	CGGCG	2	10	155064	155073	0 %	0 %	60 %	40 %	115522162
116	NC_008435	TGATC	2	10	157052	157061	20 %	40 %	20 %	20 %	115522163
117	NC_008435	GCTCA	2	10	157972	157981	20 %	20 %	20 %	40 %	115522165
118	NC_008435	GGCGC	2	10	161104	161113	0 %	0 %	60 %	40 %	115522169
119	NC_008435	ATCGG	2	10	163752	163761	20 %	20 %	40 %	20 %	115522170
120	NC_008435	GCCTT	2	10	164225	164234	0 %	40 %	20 %	40 %	115522171
121	NC_008435	CGCGC	2	10	164367	164376	0 %	0 %	40 %	60 %	115522171
122	NC_008435	GCCGC	2	10	164451	164460	0 %	0 %	40 %	60 %	115522171
123	NC_008435	CCGGC	3	15	164474	164488	0 %	0 %	40 %	60 %	115522171
124	NC_008435	GCGCC	2	10	165661	165670	0 %	0 %	40 %	60 %	115522173
125	NC_008435	CTTCA	2	10	167393	167402	20 %	40 %	0 %	40 %	115522175
126	NC_008435	GCGCT	2	10	168637	168646	0 %	20 %	40 %	40 %	115522176
127	NC_008435	TCGCC	2	10	169518	169527	0 %	20 %	20 %	60 %	115522176
128	NC_008435	CCGGC	2	10	170485	170494	0 %	0 %	40 %	60 %	115522176
129	NC_008435	AAGGC	2	10	172195	172204	40 %	0 %	40 %	20 %	115522177
130	NC_008435	GCGAT	2	10	172216	172225	20 %	20 %	40 %	20 %	115522177
131	NC_008435	GGCGC	2	10	175083	175092	0 %	0 %	60 %	40 %	115522180
132	NC_008435	TGGCG	2	10	175560	175569	0 %	20 %	60 %	20 %	115522180
133	NC_008435	CGGCG	2	10	175670	175679	0 %	0 %	60 %	40 %	115522180
134	NC_008435	GCAGC	2	10	175890	175899	20 %	0 %	40 %	40 %	115522181
135	NC_008435	GCGCG	2	10	177134	177143	0 %	0 %	60 %	40 %	115522183
136	NC_008435	GCCGA	2	10	178182	178191	20 %	0 %	40 %	40 %	115522184
137	NC_008435	CAGGC	2	10	178322	178331	20 %	0 %	40 %	40 %	115522185
138	NC_008435	GGCGA	2	10	178637	178646	20 %	0 %	60 %	20 %	115522185
139	NC_008435	GCGAG	2	10	179146	179155	20 %	0 %	60 %	20 %	115522186
140	NC_008435	GCACG	2	10	182027	182036	20 %	0 %	40 %	40 %	115522188
141	NC_008435	TGGAC	2	10	182537	182546	20 %	20 %	40 %	20 %	115522188
142	NC_008435	CGGCA	2	10	183403	183412	20 %	0 %	40 %	40 %	115522189
143	NC_008435	CCTGC	2	10	184184	184193	0 %	20 %	20 %	60 %	115522189
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147	NC_008435	GCATC	2	10	190512	190521	20 %	20 %	20 %	40 %	115522195
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149	NC_008435	CCACG	2	10	191931	191940	20 %	0 %	20 %	60 %	115522197
150	NC_008435	GCGCG	2	10	193122	193131	0 %	0 %	60 %	40 %	115522198
151	NC_008435	GCCGC	2	10	196340	196349	0 %	0 %	40 %	60 %	115522200
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157	NC_008435	CGGCC	2	10	199213	199222	0 %	0 %	40 %	60 %	115522204
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174	NC_008435	CACGC	2	10	222921	222930	20 %	0 %	20 %	60 %	115522226
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176	NC_008435	GGTCG	2	10	225009	225018	0 %	20 %	60 %	20 %	115522228
177	NC_008435	GCCGC	2	10	225090	225099	0 %	0 %	40 %	60 %	115522228
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182	NC_008435	TACGG	2	10	229380	229389	20 %	20 %	40 %	20 %	115522232
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200	NC_008435	CAGCG	2	10	257592	257601	20 %	0 %	40 %	40 %	115522257
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214	NC_008435	GCGAC	2	10	272687	272696	20 %	0 %	40 %	40 %	115522270
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237	NC_008435	TGGTC	2	10	302686	302695	0 %	40 %	40 %	20 %	115522289
238	NC_008435	GATCG	2	10	303041	303050	20 %	20 %	40 %	20 %	115522290
239	NC_008435	AATGG	2	10	303457	303466	40 %	20 %	40 %	0 %	115522291
240	NC_008435	CGACC	2	10	303654	303663	20 %	0 %	20 %	60 %	115522291
241	NC_008435	CCGCG	2	10	306332	306341	0 %	0 %	40 %	60 %	115522294
242	NC_008435	CCGCG	2	10	306581	306590	0 %	0 %	40 %	60 %	115522294
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244	NC_008435	GATCC	2	10	312292	312301	20 %	20 %	20 %	40 %	115522300
245	NC_008435	CCGCG	2	10	318184	318193	0 %	0 %	40 %	60 %	115522306
246	NC_008435	GCCGC	2	10	318379	318388	0 %	0 %	40 %	60 %	115522306
247	NC_008435	GCCGG	2	10	320810	320819	0 %	0 %	60 %	40 %	115522309
248	NC_008435	CGCGG	2	10	323092	323101	0 %	0 %	60 %	40 %	115522310
249	NC_008435	ACCGC	2	10	324590	324599	20 %	0 %	20 %	60 %	115522313
250	NC_008435	CGGCG	2	10	326569	326578	0 %	0 %	60 %	40 %	115522314
251	NC_008435	CGAGC	2	10	327303	327312	20 %	0 %	40 %	40 %	115522315
252	NC_008435	GCGCG	2	10	328092	328101	0 %	0 %	60 %	40 %	115522315
253	NC_008435	CGCCC	2	10	328675	328684	0 %	0 %	20 %	80 %	115522316
254	NC_008435	CGGGT	2	10	329790	329799	0 %	20 %	60 %	20 %	115522318
255	NC_008435	GGCCG	2	10	331640	331649	0 %	0 %	60 %	40 %	115522320
256	NC_008435	TCCGC	2	10	331892	331901	0 %	20 %	20 %	60 %	115522320
257	NC_008435	AGCAC	2	10	335064	335073	40 %	0 %	20 %	40 %	115522325
258	NC_008435	CGCGG	2	10	335922	335931	0 %	0 %	60 %	40 %	115522325
259	NC_008435	AGGTC	2	10	337440	337449	20 %	20 %	40 %	20 %	115522325
260	NC_008435	GCCTT	2	10	338785	338794	0 %	40 %	20 %	40 %	115522327
261	NC_008435	GCAGC	2	10	339228	339237	20 %	0 %	40 %	40 %	115522327
262	NC_008435	TCCAG	2	10	343007	343016	20 %	20 %	20 %	40 %	115522330
263	NC_008435	GCTCG	2	10	343949	343958	0 %	20 %	40 %	40 %	115522332
264	NC_008435	GGCGA	2	10	344010	344019	20 %	0 %	60 %	20 %	115522332
265	NC_008435	CGCGC	2	10	344274	344283	0 %	0 %	40 %	60 %	115522332
266	NC_008435	CGCGC	2	10	345514	345523	0 %	0 %	40 %	60 %	115522333
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