MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 11557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008435	GCCG	2	8	1421	1428	0 %	0 %	50 %	50 %	115522031
2	NC_008435	CTCG	2	8	1528	1535	0 %	25 %	25 %	50 %	115522031
3	NC_008435	CGAC	2	8	2442	2449	25 %	0 %	25 %	50 %	115522032
4	NC_008435	CGGA	2	8	2550	2557	25 %	0 %	50 %	25 %	115522032
5	NC_008435	GCCG	2	8	2609	2616	0 %	0 %	50 %	50 %	115522032
6	NC_008435	ATCT	2	8	2780	2787	25 %	50 %	0 %	25 %	115522032
7	NC_008435	CAGC	2	8	4049	4056	25 %	0 %	25 %	50 %	115522033
8	NC_008435	TGGA	2	8	4284	4291	25 %	25 %	50 %	0 %	115522033
9	NC_008435	CGGC	2	8	4355	4362	0 %	0 %	50 %	50 %	115522033
10	NC_008435	CCCG	2	8	6463	6470	0 %	0 %	25 %	75 %	115522035
11	NC_008435	GGCC	2	8	6654	6661	0 %	0 %	50 %	50 %	115522035
12	NC_008435	GCCG	2	8	8668	8675	0 %	0 %	50 %	50 %	115522035
13	NC_008435	ACGC	2	8	8756	8763	25 %	0 %	25 %	50 %	115522035
14	NC_008435	TCGA	2	8	9276	9283	25 %	25 %	25 %	25 %	115522036
15	NC_008435	CGAT	2	8	9522	9529	25 %	25 %	25 %	25 %	115522036
16	NC_008435	GCCA	2	8	9687	9694	25 %	0 %	25 %	50 %	115522036
17	NC_008435	CGAT	2	8	10244	10251	25 %	25 %	25 %	25 %	115522037
18	NC_008435	GCCG	2	8	10339	10346	0 %	0 %	50 %	50 %	115522037
19	NC_008435	GCTG	2	8	10605	10612	0 %	25 %	50 %	25 %	115522037
20	NC_008435	GACC	2	8	10689	10696	25 %	0 %	25 %	50 %	115522037
21	NC_008435	GGCT	2	8	10775	10782	0 %	25 %	50 %	25 %	115522037
22	NC_008435	TCGA	2	8	11368	11375	25 %	25 %	25 %	25 %	115522038
23	NC_008435	GCCG	2	8	11955	11962	0 %	0 %	50 %	50 %	115522039
24	NC_008435	AATG	2	8	11982	11989	50 %	25 %	25 %	0 %	115522039
25	NC_008435	GATC	2	8	12274	12281	25 %	25 %	25 %	25 %	115522040
26	NC_008435	CGGC	2	8	12296	12303	0 %	0 %	50 %	50 %	115522040
27	NC_008435	AGCG	2	8	12974	12981	25 %	0 %	50 %	25 %	115522042
28	NC_008435	GCGG	2	8	14564	14571	0 %	0 %	75 %	25 %	115522042
29	NC_008435	CGAT	2	8	14634	14641	25 %	25 %	25 %	25 %	115522042
30	NC_008435	GGCC	2	8	15065	15072	0 %	0 %	50 %	50 %	115522043
31	NC_008435	GATG	2	8	15862	15869	25 %	25 %	50 %	0 %	115522044
32	NC_008435	AGCG	2	8	17254	17261	25 %	0 %	50 %	25 %	115522045
33	NC_008435	CGAG	2	8	17393	17400	25 %	0 %	50 %	25 %	115522045
34	NC_008435	GGTT	2	8	18044	18051	0 %	50 %	50 %	0 %	115522047
35	NC_008435	TCGG	2	8	18121	18128	0 %	25 %	50 %	25 %	115522047
36	NC_008435	CGAG	2	8	18497	18504	25 %	0 %	50 %	25 %	115522047
37	NC_008435	CGGC	2	8	18592	18599	0 %	0 %	50 %	50 %	115522047
38	NC_008435	CGAG	2	8	18968	18975	25 %	0 %	50 %	25 %	115522048
39	NC_008435	GGCC	2	8	19451	19458	0 %	0 %	50 %	50 %	115522048
40	NC_008435	CCGC	2	8	19526	19533	0 %	0 %	25 %	75 %	115522048
41	NC_008435	GCCG	2	8	20057	20064	0 %	0 %	50 %	50 %	115522048
42	NC_008435	GCCG	2	8	21551	21558	0 %	0 %	50 %	50 %	115522049
43	NC_008435	CGGC	2	8	21958	21965	0 %	0 %	50 %	50 %	115522050
44	NC_008435	GCTT	2	8	21993	22000	0 %	50 %	25 %	25 %	115522050
45	NC_008435	TCGA	2	8	23232	23239	25 %	25 %	25 %	25 %	115522051
46	NC_008435	CGGC	2	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	115522052
47	NC_008435	CCGC	2	8	23938	23945	0 %	0 %	25 %	75 %	115522052
48	NC_008435	CCGC	2	8	24108	24115	0 %	0 %	25 %	75 %	115522052
49	NC_008435	CATC	2	8	25648	25655	25 %	25 %	0 %	50 %	115522054
50	NC_008435	CGGT	2	8	27146	27153	0 %	25 %	50 %	25 %	115522054
51	NC_008435	GCAG	2	8	28407	28414	25 %	0 %	50 %	25 %	115522055
52	NC_008435	TCGG	2	8	29185	29192	0 %	25 %	50 %	25 %	115522056
53	NC_008435	GATC	2	8	30092	30099	25 %	25 %	25 %	25 %	115522056
54	NC_008435	GATG	2	8	31059	31066	25 %	25 %	50 %	0 %	115522057
55	NC_008435	GATC	2	8	31674	31681	25 %	25 %	25 %	25 %	115522057
56	NC_008435	AGCG	2	8	32057	32064	25 %	0 %	50 %	25 %	115522057
57	NC_008435	CAGC	2	8	32110	32117	25 %	0 %	25 %	50 %	115522057
58	NC_008435	CGGC	2	8	32216	32223	0 %	0 %	50 %	50 %	115522057
59	NC_008435	CGGT	2	8	32285	32292	0 %	25 %	50 %	25 %	115522057
60	NC_008435	GGCG	2	8	32705	32712	0 %	0 %	75 %	25 %	115522058
61	NC_008435	CCCG	2	8	32931	32938	0 %	0 %	25 %	75 %	115522058
62	NC_008435	CACC	2	8	33333	33340	25 %	0 %	0 %	75 %	115522058
63	NC_008435	TCCA	2	8	33718	33725	25 %	25 %	0 %	50 %	115522058
64	NC_008435	GTCG	2	8	33774	33781	0 %	25 %	50 %	25 %	115522058
65	NC_008435	GCTG	2	8	34331	34338	0 %	25 %	50 %	25 %	115522059
66	NC_008435	GATC	2	8	34816	34823	25 %	25 %	25 %	25 %	115522060
67	NC_008435	GGCG	2	8	34889	34896	0 %	0 %	75 %	25 %	115522060
68	NC_008435	GTTC	2	8	34950	34957	0 %	50 %	25 %	25 %	115522060
69	NC_008435	CGGC	2	8	34988	34995	0 %	0 %	50 %	50 %	115522060
70	NC_008435	CGAG	2	8	35128	35135	25 %	0 %	50 %	25 %	115522060
71	NC_008435	CAGC	2	8	35198	35205	25 %	0 %	25 %	50 %	115522060
72	NC_008435	GGAT	2	8	35572	35579	25 %	25 %	50 %	0 %	115522061
73	NC_008435	GCGG	2	8	35782	35789	0 %	0 %	75 %	25 %	115522062
74	NC_008435	TCGG	2	8	36543	36550	0 %	25 %	50 %	25 %	115522063
75	NC_008435	GCCG	2	8	37076	37083	0 %	0 %	50 %	50 %	115522063
76	NC_008435	GCCG	2	8	37214	37221	0 %	0 %	50 %	50 %	115522063
77	NC_008435	CGCC	2	8	38356	38363	0 %	0 %	25 %	75 %	115522064
78	NC_008435	GTGG	2	8	39047	39054	0 %	25 %	75 %	0 %	115522064
79	NC_008435	GTCG	2	8	39071	39078	0 %	25 %	50 %	25 %	115522064
80	NC_008435	CTTC	2	8	39292	39299	0 %	50 %	0 %	50 %	115522064
81	NC_008435	AGAA	2	8	40254	40261	75 %	0 %	25 %	0 %	115522065
82	NC_008435	GCGG	2	8	40658	40665	0 %	0 %	75 %	25 %	115522066
83	NC_008435	GATC	2	8	40998	41005	25 %	25 %	25 %	25 %	115522066
84	NC_008435	TCGG	2	8	41707	41714	0 %	25 %	50 %	25 %	115522067
85	NC_008435	CTGG	2	8	42524	42531	0 %	25 %	50 %	25 %	115522068
86	NC_008435	CGGT	2	8	42549	42556	0 %	25 %	50 %	25 %	115522068
87	NC_008435	CGCC	2	8	42595	42602	0 %	0 %	25 %	75 %	115522068
88	NC_008435	TCGG	2	8	43420	43427	0 %	25 %	50 %	25 %	115522069
89	NC_008435	GCCG	2	8	44960	44967	0 %	0 %	50 %	50 %	115522070
90	NC_008435	TGCA	2	8	45413	45420	25 %	25 %	25 %	25 %	115522071
91	NC_008435	TCGC	2	8	45474	45481	0 %	25 %	25 %	50 %	115522071
92	NC_008435	CGAT	2	8	46067	46074	25 %	25 %	25 %	25 %	115522071
93	NC_008435	TGGC	2	8	46283	46290	0 %	25 %	50 %	25 %	115522071
94	NC_008435	CCGC	2	8	46566	46573	0 %	0 %	25 %	75 %	115522072
95	NC_008435	CGCC	2	8	46639	46646	0 %	0 %	25 %	75 %	115522072
96	NC_008435	CGGC	2	8	46872	46879	0 %	0 %	50 %	50 %	115522073
97	NC_008435	CAGG	2	8	48557	48564	25 %	0 %	50 %	25 %	115522075
98	NC_008435	GACC	2	8	49157	49164	25 %	0 %	25 %	50 %	115522075
99	NC_008435	CGGC	2	8	49999	50006	0 %	0 %	50 %	50 %	115522076
100	NC_008435	GCCG	2	8	50334	50341	0 %	0 %	50 %	50 %	115522076
101	NC_008435	TCGA	2	8	50947	50954	25 %	25 %	25 %	25 %	115522076
102	NC_008435	GCCG	2	8	52113	52120	0 %	0 %	50 %	50 %	115522077
103	NC_008435	CGGC	2	8	52287	52294	0 %	0 %	50 %	50 %	115522077
104	NC_008435	CCGC	2	8	52627	52634	0 %	0 %	25 %	75 %	115522078
105	NC_008435	CGCC	2	8	52770	52777	0 %	0 %	25 %	75 %	115522078
106	NC_008435	CAAC	2	8	54226	54233	50 %	0 %	0 %	50 %	115522081
107	NC_008435	GCCA	2	8	55478	55485	25 %	0 %	25 %	50 %	115522083
108	NC_008435	CGGC	2	8	55787	55794	0 %	0 %	50 %	50 %	115522083
109	NC_008435	CGGC	2	8	55909	55916	0 %	0 %	50 %	50 %	115522083
110	NC_008435	GGCA	2	8	56033	56040	25 %	0 %	50 %	25 %	115522083
111	NC_008435	GAAC	2	8	56448	56455	50 %	0 %	25 %	25 %	115522084
112	NC_008435	GACC	2	8	57595	57602	25 %	0 %	25 %	50 %	115522085
113	NC_008435	CGAG	2	8	57759	57766	25 %	0 %	50 %	25 %	115522085
114	NC_008435	CGAA	2	8	57816	57823	50 %	0 %	25 %	25 %	115522085
115	NC_008435	GCCG	2	8	58651	58658	0 %	0 %	50 %	50 %	115522086
116	NC_008435	GCCG	2	8	58922	58929	0 %	0 %	50 %	50 %	115522086
117	NC_008435	ATCC	2	8	58975	58982	25 %	25 %	0 %	50 %	115522086
118	NC_008435	GCCG	2	8	61330	61337	0 %	0 %	50 %	50 %	115522088
119	NC_008435	GAGC	2	8	61525	61532	25 %	0 %	50 %	25 %	115522088
120	NC_008435	GCCG	2	8	62162	62169	0 %	0 %	50 %	50 %	115522088
121	NC_008435	TGGA	2	8	62552	62559	25 %	25 %	50 %	0 %	115522088
122	NC_008435	CTGG	2	8	62578	62585	0 %	25 %	50 %	25 %	115522088
123	NC_008435	AGGC	2	8	62872	62879	25 %	0 %	50 %	25 %	115522089
124	NC_008435	GGAC	2	8	64191	64198	25 %	0 %	50 %	25 %	115522090
125	NC_008435	CTGG	2	8	64215	64222	0 %	25 %	50 %	25 %	115522090
126	NC_008435	CGGC	2	8	64327	64334	0 %	0 %	50 %	50 %	115522090
127	NC_008435	CGGA	2	8	64475	64482	25 %	0 %	50 %	25 %	115522090
128	NC_008435	GCCG	2	8	64518	64525	0 %	0 %	50 %	50 %	115522090
129	NC_008435	TGCC	2	8	64541	64548	0 %	25 %	25 %	50 %	115522090
130	NC_008435	CGGC	2	8	64577	64584	0 %	0 %	50 %	50 %	115522090
131	NC_008435	ACCG	2	8	65311	65318	25 %	0 %	25 %	50 %	115522090
132	NC_008435	CGAC	2	8	65787	65794	25 %	0 %	25 %	50 %	115522090
133	NC_008435	GCTC	2	8	67184	67191	0 %	25 %	25 %	50 %	115522090
134	NC_008435	TCAA	2	8	67886	67893	50 %	25 %	0 %	25 %	115522090
135	NC_008435	CGGC	2	8	68070	68077	0 %	0 %	50 %	50 %	115522090
136	NC_008435	CCTT	2	8	68237	68244	0 %	50 %	0 %	50 %	115522090
137	NC_008435	CGAC	2	8	68555	68562	25 %	0 %	25 %	50 %	115522090
138	NC_008435	CGGA	2	8	68750	68757	25 %	0 %	50 %	25 %	115522090
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140	NC_008435	TGGC	2	8	69015	69022	0 %	25 %	50 %	25 %	115522090
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