MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 90997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008435	ACA	2	6	636	641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522031
2	NC_008435	ACC	2	6	692	697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522031
3	NC_008435	GCA	2	6	751	756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522031
4	NC_008435	GCC	2	6	959	964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522031
5	NC_008435	CGG	2	6	1021	1026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522031
6	NC_008435	CGC	2	6	1029	1034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522031
7	NC_008435	TCG	3	9	1062	1070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522031
8	NC_008435	GCC	2	6	1119	1124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522031
9	NC_008435	GCG	2	6	1125	1130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522031
10	NC_008435	CTG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522031
11	NC_008435	TCG	2	6	1275	1280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522031
12	NC_008435	CGA	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522031
13	NC_008435	ACC	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522031
14	NC_008435	GGT	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522031
15	NC_008435	CGC	2	6	1441	1446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522031
16	NC_008435	CCG	2	6	1454	1459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522031
17	NC_008435	CGA	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522031
18	NC_008435	CGG	2	6	1504	1509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522031
19	NC_008435	TGG	2	6	1512	1517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522031
20	NC_008435	CGG	2	6	1575	1580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522031
21	NC_008435	GCT	2	6	1684	1689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522031
22	NC_008435	GTG	2	6	1805	1810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522031
23	NC_008435	TGT	2	6	1842	1847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522031
24	NC_008435	CGG	2	6	1948	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522031
25	NC_008435	CGC	2	6	2014	2019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522031
26	NC_008435	CGA	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522031
27	NC_008435	GCG	2	6	2371	2376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522032
28	NC_008435	CCG	2	6	2478	2483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522032
29	NC_008435	CCA	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522032
30	NC_008435	CGC	2	6	2665	2670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522032
31	NC_008435	CTA	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522032
32	NC_008435	CGC	2	6	2809	2814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522032
33	NC_008435	GCG	2	6	2877	2882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522032
34	NC_008435	CCG	2	6	2883	2888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522032
35	NC_008435	CAA	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522032
36	NC_008435	GTG	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522032
37	NC_008435	AAC	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522032
38	NC_008435	TGG	2	6	3090	3095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522032
39	NC_008435	CCG	2	6	3180	3185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522032
40	NC_008435	CGC	2	6	3304	3309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522032
41	NC_008435	GCC	2	6	3326	3331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522032
42	NC_008435	CGG	2	6	3640	3645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522033
43	NC_008435	TCG	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522033
44	NC_008435	CGA	2	6	3767	3772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522033
45	NC_008435	GGC	2	6	3878	3883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522033
46	NC_008435	CCA	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522033
47	NC_008435	CCG	3	9	3928	3936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522033
48	NC_008435	ATC	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522033
49	NC_008435	CGG	3	9	4011	4019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522033
50	NC_008435	TTC	2	6	4020	4025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522033
51	NC_008435	GCG	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522033
52	NC_008435	CGC	3	9	4217	4225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522033
53	NC_008435	GCC	2	6	4242	4247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522033
54	NC_008435	GCC	3	9	4371	4379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522033
55	NC_008435	GCT	2	6	4478	4483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522033
56	NC_008435	TGC	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522033
57	NC_008435	CGA	2	6	4553	4558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522033
58	NC_008435	GGT	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522033
59	NC_008435	CGC	3	9	4584	4592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522033
60	NC_008435	GAG	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522033
61	NC_008435	TCG	2	6	4660	4665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522033
62	NC_008435	ACT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522033
63	NC_008435	ACC	2	6	4884	4889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522034
64	NC_008435	GGT	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522034
65	NC_008435	GCT	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522034
66	NC_008435	CGC	2	6	4951	4956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522034
67	NC_008435	CGC	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522034
68	NC_008435	AGC	2	6	5074	5079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522034
69	NC_008435	CGA	2	6	5144	5149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522034
70	NC_008435	CGA	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522034
71	NC_008435	CCA	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522034
72	NC_008435	GCG	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522034
73	NC_008435	TGA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522034
74	NC_008435	CCA	2	6	5326	5331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522034
75	NC_008435	CGA	2	6	5377	5382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522034
76	NC_008435	GAT	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522034
77	NC_008435	ATC	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522034
78	NC_008435	TCA	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522034
79	NC_008435	CGA	2	6	5603	5608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522034
80	NC_008435	TCA	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522034
81	NC_008435	CGG	2	6	5693	5698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522034
82	NC_008435	CGA	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522034
83	NC_008435	GGC	2	6	5775	5780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522034
84	NC_008435	ACG	2	6	5890	5895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522034
85	NC_008435	CGA	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522034
86	NC_008435	CGT	2	6	5936	5941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522034
87	NC_008435	GTG	2	6	5961	5966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522034
88	NC_008435	CGA	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
89	NC_008435	CAC	2	6	6607	6612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522035
90	NC_008435	GGT	2	6	6624	6629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
91	NC_008435	GTG	2	6	6679	6684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
92	NC_008435	CGA	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
93	NC_008435	CGG	2	6	6764	6769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
94	NC_008435	TCA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522035
95	NC_008435	CGG	2	6	6798	6803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
96	NC_008435	GGC	2	6	6835	6840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
97	NC_008435	GGT	2	6	6861	6866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
98	NC_008435	TGG	4	12	6959	6970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
99	NC_008435	TGT	2	6	7109	7114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522035
100	NC_008435	GAG	2	6	7144	7149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522035
101	NC_008435	GCG	2	6	7163	7168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
102	NC_008435	TGG	2	6	7169	7174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
103	NC_008435	CAA	2	6	7197	7202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522035
104	NC_008435	TGG	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
105	NC_008435	CAA	2	6	7314	7319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522035
106	NC_008435	CGG	2	6	7335	7340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
107	NC_008435	AAG	2	6	7408	7413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522035
108	NC_008435	CGA	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
109	NC_008435	TCG	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522035
110	NC_008435	TCC	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522035
111	NC_008435	GGT	2	6	7539	7544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
112	NC_008435	CGC	2	6	7569	7574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522035
113	NC_008435	TCG	2	6	7610	7615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522035
114	NC_008435	GGT	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
115	NC_008435	CGG	2	6	7634	7639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
116	NC_008435	CAT	2	6	7700	7705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522035
117	NC_008435	TCG	2	6	7763	7768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522035
118	NC_008435	GGT	2	6	7783	7788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
119	NC_008435	TGC	2	6	7826	7831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522035
120	NC_008435	CGA	2	6	7938	7943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
121	NC_008435	ATC	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522035
122	NC_008435	TGA	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522035
123	NC_008435	GCT	3	9	8022	8030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522035
124	NC_008435	TTC	3	9	8035	8043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522035
125	NC_008435	GGC	2	6	8068	8073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
126	NC_008435	GCC	2	6	8091	8096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522035
127	NC_008435	CGA	2	6	8181	8186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
128	NC_008435	CGG	2	6	8220	8225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
129	NC_008435	TGG	2	6	8243	8248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522035
130	NC_008435	GGC	2	6	8319	8324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
131	NC_008435	CGC	3	9	8376	8384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522035
132	NC_008435	CGA	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
133	NC_008435	GCG	2	6	8489	8494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522035
134	NC_008435	CGA	2	6	8514	8519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
135	NC_008435	GCT	2	6	8523	8528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522035
136	NC_008435	CGA	2	6	8553	8558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
137	NC_008435	AGG	2	6	8576	8581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522035
138	NC_008435	CGA	2	6	8793	8798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
139	NC_008435	CGA	2	6	8802	8807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522035
140	NC_008435	CGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522035
141	NC_008435	GCA	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522036
142	NC_008435	GCG	2	6	9208	9213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522036
143	NC_008435	CGC	2	6	9226	9231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522036
144	NC_008435	GCA	2	6	9343	9348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522036
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146	NC_008435	TCG	2	6	9495	9500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522036
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150	NC_008435	AGC	2	6	9753	9758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522036
151	NC_008435	GGC	2	6	9764	9769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522036
152	NC_008435	AGC	2	6	9822	9827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522036
153	NC_008435	CCG	2	6	9840	9845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522036
154	NC_008435	GCG	2	6	9852	9857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522036
155	NC_008435	CGG	2	6	9865	9870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522036
156	NC_008435	GAA	2	6	9872	9877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522036
157	NC_008435	GCA	2	6	9915	9920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522036
158	NC_008435	CAG	2	6	9998	10003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522036
159	NC_008435	CCT	2	6	10264	10269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522037
160	NC_008435	GCT	2	6	10276	10281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522037
161	NC_008435	GAC	2	6	10319	10324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522037
162	NC_008435	GCA	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522037
163	NC_008435	CAC	2	6	10387	10392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522037
164	NC_008435	GCT	2	6	10441	10446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522037
165	NC_008435	GTC	2	6	10465	10470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522037
166	NC_008435	CGC	2	6	10474	10479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522037
167	NC_008435	CGA	2	6	10519	10524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522037
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169	NC_008435	CGT	2	6	10587	10592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522037
170	NC_008435	CGC	2	6	10711	10716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522037
171	NC_008435	GTC	2	6	10844	10849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522037
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176	NC_008435	ACC	2	6	10943	10948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522037
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179	NC_008435	CGC	2	6	11082	11087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522037
180	NC_008435	TCT	2	6	11156	11161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522038
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182	NC_008435	CTT	2	6	11211	11216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522038
183	NC_008435	AGA	2	6	11219	11224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522038
184	NC_008435	ACG	2	6	11251	11256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522038
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209	NC_008435	CGG	2	6	13108	13113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522042
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225	NC_008435	GCG	2	6	13789	13794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522042
226	NC_008435	CAG	2	6	13859	13864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522042
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228	NC_008435	CGG	2	6	13894	13899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522042
229	NC_008435	ACC	2	6	14031	14036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522042
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238	NC_008435	CCA	2	6	14425	14430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522042
239	NC_008435	GAA	2	6	14447	14452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522042
240	NC_008435	CAT	2	6	14504	14509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522042
241	NC_008435	GGC	2	6	14528	14533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522042
242	NC_008435	CAG	2	6	14549	14554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522042
243	NC_008435	TCC	2	6	14574	14579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522042
244	NC_008435	CTT	2	6	14666	14671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522042
245	NC_008435	GGC	2	6	14686	14691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522042
246	NC_008435	TCA	2	6	14851	14856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522042
247	NC_008435	CGG	2	6	15032	15037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522043
248	NC_008435	GAA	2	6	15054	15059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522043
249	NC_008435	GCT	4	12	15164	15175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522043
250	NC_008435	TCA	3	9	15266	15274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522043
251	NC_008435	GAA	2	6	15300	15305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522043
252	NC_008435	CAG	2	6	15309	15314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522043
253	NC_008435	TGG	2	6	15496	15501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522044
254	NC_008435	GGT	2	6	15521	15526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522044
255	NC_008435	GAT	2	6	15542	15547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522044
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499	NC_008435	CGG	2	6	28590	28595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522055
500	NC_008435	GTT	2	6	28602	28607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522055

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