MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 3

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008392	AACCGC	2	12	4935	4946	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008392	GATCGC	2	12	9323	9334	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008392	GGCGCG	2	12	40200	40211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008392	CTGGTG	3	18	65324	65341	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008392	CGGGTG	7	42	65342	65383	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008392	TGCCGG	2	12	65400	65411	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008392	ACGGTG	2	12	69843	69854	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008392	CATGAG	2	12	128439	128450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008392	CGCGCC	2	12	195029	195040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008392	CGCGGG	2	12	241117	241128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008392	CGACGT	2	12	269596	269607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008392	GCTCCT	2	12	325815	325826	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008392	TCGCTT	2	12	333109	333120	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008392	CATCGC	2	12	333242	333253	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008392	TCGCAG	2	12	364243	364254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008392	GCATCG	2	12	366890	366901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008392	TGACGA	2	12	457377	457388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008392	GATTCG	2	12	492615	492626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008392	AGGTGC	2	12	504818	504829	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008392	TCCAGT	2	12	507103	507114	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008392	CGCCCG	2	12	529286	529297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008392	TGCGAA	2	12	549008	549019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008392	CCGGTT	2	12	549335	549346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008392	CCGAAA	2	12	575761	575772	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008392	GCCGGC	2	12	600668	600679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008392	TCGACG	2	12	618280	618291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008392	GCCGAT	2	12	618509	618520	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008392	CCGGAC	2	12	625086	625097	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008392	CAATGA	2	12	640305	640316	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008392	CCGGCA	2	12	641510	641521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008392	GCACCG	2	12	648214	648225	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008392	CGTGCC	3	18	662519	662536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008392	ACGGGG	2	12	670216	670227	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008392	CTGCAA	2	12	679243	679254	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008392	GGGTGC	2	12	729271	729282	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008392	CCGATA	2	12	761046	761057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008392	GCTGAA	2	12	778436	778447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008392	CCCGAC	2	12	806441	806452	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008392	GAATTT	2	12	811951	811962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008392	CGATTG	2	12	832299	832310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008392	CGGGGT	2	12	842754	842765	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008392	CGCGGC	2	12	860490	860501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008392	GCCGTC	2	12	901076	901087	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008392	TGCGGA	2	12	907578	907589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008392	ATCGCG	2	12	915267	915278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008392	CGATGC	2	12	934266	934277	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008392	TCCAAA	2	12	984069	984080	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008392	TCCATC	2	12	1004865	1004876	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008392	AACCGG	2	12	1008970	1008981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008392	TCGCGT	2	12	1025463	1025474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008392	GGGGCG	2	12	1026649	1026660	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008392	ATTTCC	2	12	1070746	1070757	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008392	CATCCG	2	12	1176647	1176658	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008392	GGCGAC	2	12	1223689	1223700	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.