MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 3

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008392	T	6	6	4324	4329	0 %	100 %	0 %	0 %	115360322
2	NC_008392	C	6	6	4868	4873	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_008392	C	6	6	11689	11694	0 %	0 %	0 %	100 %	115360328
4	NC_008392	A	6	6	11808	11813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008392	C	6	6	15268	15273	0 %	0 %	0 %	100 %	115360332
6	NC_008392	G	6	6	16533	16538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008392	A	6	6	16693	16698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008392	C	6	6	25869	25874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_008392	C	6	6	31736	31741	0 %	0 %	0 %	100 %	115360339
10	NC_008392	G	6	6	34697	34702	0 %	0 %	100 %	0 %	115360340
11	NC_008392	A	6	6	38185	38190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008392	A	6	6	38719	38724	100 %	0 %	0 %	0 %	115360346
13	NC_008392	T	6	6	52885	52890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008392	C	6	6	54459	54464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_008392	T	7	7	56424	56430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008392	T	7	7	63892	63898	0 %	100 %	0 %	0 %	115360374
17	NC_008392	A	7	7	66895	66901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008392	G	6	6	68258	68263	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008392	T	6	6	71847	71852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008392	G	6	6	71865	71870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008392	T	6	6	80083	80088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008392	A	7	7	87546	87552	100 %	0 %	0 %	0 %	115360396
23	NC_008392	T	6	6	88717	88722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008392	G	6	6	89257	89262	0 %	0 %	100 %	0 %	115360399
25	NC_008392	A	6	6	107073	107078	100 %	0 %	0 %	0 %	115360412
26	NC_008392	A	6	6	117467	117472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008392	C	6	6	126335	126340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_008392	C	6	6	132010	132015	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_008392	C	6	6	132066	132071	0 %	0 %	0 %	100 %	115360436
30	NC_008392	T	8	8	134681	134688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008392	T	6	6	142460	142465	0 %	100 %	0 %	0 %	115360442
32	NC_008392	A	6	6	143390	143395	100 %	0 %	0 %	0 %	115360442
33	NC_008392	A	6	6	146539	146544	100 %	0 %	0 %	0 %	115360444
34	NC_008392	A	6	6	151460	151465	100 %	0 %	0 %	0 %	115360445
35	NC_008392	A	6	6	153135	153140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008392	C	6	6	153190	153195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_008392	A	6	6	153209	153214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008392	T	7	7	171561	171567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008392	C	6	6	173738	173743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_008392	C	6	6	174431	174436	0 %	0 %	0 %	100 %	115360465
41	NC_008392	T	6	6	178659	178664	0 %	100 %	0 %	0 %	115360469
42	NC_008392	A	6	6	182089	182094	100 %	0 %	0 %	0 %	115360472
43	NC_008392	A	6	6	188223	188228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008392	A	6	6	188385	188390	100 %	0 %	0 %	0 %	115360479
45	NC_008392	A	6	6	188685	188690	100 %	0 %	0 %	0 %	115360479
46	NC_008392	C	6	6	197180	197185	0 %	0 %	0 %	100 %	115360487
47	NC_008392	T	6	6	205441	205446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008392	T	6	6	211108	211113	0 %	100 %	0 %	0 %	115360496
49	NC_008392	C	6	6	211212	211217	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_008392	A	7	7	222606	222612	100 %	0 %	0 %	0 %	115360503
51	NC_008392	G	6	6	225914	225919	0 %	0 %	100 %	0 %	115360506
52	NC_008392	G	6	6	226301	226306	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008392	C	6	6	239025	239030	0 %	0 %	0 %	100 %	115360514
54	NC_008392	T	6	6	248998	249003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008392	A	6	6	253463	253468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008392	A	6	6	263171	263176	100 %	0 %	0 %	0 %	115360532
57	NC_008392	C	7	7	269700	269706	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_008392	C	6	6	275647	275652	0 %	0 %	0 %	100 %	115360550
59	NC_008392	A	6	6	275711	275716	100 %	0 %	0 %	0 %	115360550
60	NC_008392	G	6	6	278972	278977	0 %	0 %	100 %	0 %	115360553
61	NC_008392	C	6	6	281336	281341	0 %	0 %	0 %	100 %	115360556
62	NC_008392	T	6	6	282565	282570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008392	C	6	6	299726	299731	0 %	0 %	0 %	100 %	115360570
64	NC_008392	T	7	7	300679	300685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008392	A	8	8	316406	316413	100 %	0 %	0 %	0 %	115360583
66	NC_008392	T	6	6	319366	319371	0 %	100 %	0 %	0 %	115360585
67	NC_008392	T	6	6	324872	324877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008392	C	6	6	326184	326189	0 %	0 %	0 %	100 %	115360591
69	NC_008392	G	7	7	332992	332998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008392	G	6	6	342447	342452	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008392	T	6	6	342495	342500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008392	C	6	6	343177	343182	0 %	0 %	0 %	100 %	115360611
73	NC_008392	T	6	6	349313	349318	0 %	100 %	0 %	0 %	115360615
74	NC_008392	C	6	6	353760	353765	0 %	0 %	0 %	100 %	115360620
75	NC_008392	C	6	6	356421	356426	0 %	0 %	0 %	100 %	115360622
76	NC_008392	G	6	6	358734	358739	0 %	0 %	100 %	0 %	115360623
77	NC_008392	T	8	8	360490	360497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008392	A	7	7	360728	360734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008392	A	6	6	360998	361003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008392	A	7	7	361009	361015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008392	T	6	6	362707	362712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008392	T	7	7	364279	364285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008392	G	6	6	364913	364918	0 %	0 %	100 %	0 %	115360628
84	NC_008392	C	6	6	367893	367898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_008392	T	7	7	367943	367949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008392	C	6	6	372983	372988	0 %	0 %	0 %	100 %	115360635
87	NC_008392	C	6	6	373014	373019	0 %	0 %	0 %	100 %	115360635
88	NC_008392	G	7	7	374644	374650	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008392	T	6	6	376119	376124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008392	G	6	6	377326	377331	0 %	0 %	100 %	0 %	115360638
91	NC_008392	T	6	6	380433	380438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008392	C	7	7	380457	380463	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_008392	T	7	7	384186	384192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008392	T	8	8	389480	389487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008392	A	7	7	391292	391298	100 %	0 %	0 %	0 %	115360651
96	NC_008392	T	8	8	393118	393125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008392	C	8	8	395655	395662	0 %	0 %	0 %	100 %	115360655
98	NC_008392	C	6	6	405268	405273	0 %	0 %	0 %	100 %	115360661
99	NC_008392	C	6	6	457139	457144	0 %	0 %	0 %	100 %	115360670
100	NC_008392	C	6	6	463547	463552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_008392	T	6	6	464952	464957	0 %	100 %	0 %	0 %	115360675
102	NC_008392	A	6	6	478950	478955	100 %	0 %	0 %	0 %	115360686
103	NC_008392	A	6	6	488354	488359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008392	T	6	6	489067	489072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008392	G	6	6	489228	489233	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008392	A	6	6	492648	492653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008392	C	6	6	492749	492754	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_008392	T	6	6	506176	506181	0 %	100 %	0 %	0 %	115360710
109	NC_008392	C	6	6	513601	513606	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_008392	C	6	6	514141	514146	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_008392	C	6	6	514609	514614	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_008392	C	6	6	516475	516480	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_008392	C	6	6	523194	523199	0 %	0 %	0 %	100 %	115360720
114	NC_008392	A	6	6	524908	524913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008392	T	7	7	528369	528375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008392	A	6	6	529399	529404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008392	A	6	6	548442	548447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008392	A	6	6	549495	549500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008392	A	7	7	550660	550666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008392	A	6	6	555765	555770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008392	C	6	6	557045	557050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_008392	T	7	7	566196	566202	0 %	100 %	0 %	0 %	115360754
123	NC_008392	G	6	6	574298	574303	0 %	0 %	100 %	0 %	115360762
124	NC_008392	A	6	6	575739	575744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008392	G	6	6	579733	579738	0 %	0 %	100 %	0 %	115360766
126	NC_008392	T	6	6	590991	590996	0 %	100 %	0 %	0 %	115360773
127	NC_008392	T	6	6	610957	610962	0 %	100 %	0 %	0 %	115360791
128	NC_008392	A	6	6	614888	614893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008392	T	6	6	643012	643017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008392	T	6	6	647843	647848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008392	T	6	6	651871	651876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008392	A	6	6	664646	664651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008392	T	6	6	669117	669122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008392	T	7	7	672898	672904	0 %	100 %	0 %	0 %	115360852
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136	NC_008392	A	6	6	681582	681587	100 %	0 %	0 %	0 %	115360861
137	NC_008392	A	6	6	687403	687408	100 %	0 %	0 %	0 %	115360868
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139	NC_008392	T	6	6	715232	715237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008392	G	6	6	719371	719376	0 %	0 %	100 %	0 %	115360896
141	NC_008392	T	6	6	729008	729013	0 %	100 %	0 %	0 %	115360903
142	NC_008392	A	6	6	740957	740962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008392	T	6	6	757130	757135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008392	G	6	6	758801	758806	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008392	A	6	6	769237	769242	100 %	0 %	0 %	0 %	115360940
146	NC_008392	T	6	6	769968	769973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.