MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 2

Total Repeats: 2815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008391	GCGCC	2	10	486	495	0 %	0 %	40 %	60 %	115357971
2	NC_008391	GTCGA	2	10	1186	1195	20 %	20 %	40 %	20 %	115357971
3	NC_008391	ACGCG	2	10	1556	1565	20 %	0 %	40 %	40 %	115357972
4	NC_008391	TCGCG	2	10	1568	1577	0 %	20 %	40 %	40 %	115357972
5	NC_008391	TGCAT	2	10	2071	2080	20 %	40 %	20 %	20 %	115357972
6	NC_008391	TGCGC	2	10	2158	2167	0 %	20 %	40 %	40 %	115357972
7	NC_008391	GCGCG	2	10	3382	3391	0 %	0 %	60 %	40 %	115357974
8	NC_008391	CGGCC	2	10	3532	3541	0 %	0 %	40 %	60 %	115357974
9	NC_008391	TTTCA	2	10	4096	4105	20 %	60 %	0 %	20 %	115357974
10	NC_008391	CAAGT	2	10	4770	4779	40 %	20 %	20 %	20 %	115357976
11	NC_008391	GCCGA	2	10	4911	4920	20 %	0 %	40 %	40 %	115357976
12	NC_008391	GCCCG	2	10	5129	5138	0 %	0 %	40 %	60 %	115357976
13	NC_008391	GCGAA	2	10	6178	6187	40 %	0 %	40 %	20 %	115357976
14	NC_008391	ACGCG	2	10	7859	7868	20 %	0 %	40 %	40 %	115357978
15	NC_008391	GCCGC	2	10	8124	8133	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008391	GGTCG	2	10	9689	9698	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008391	GTCGC	2	10	11263	11272	0 %	20 %	40 %	40 %	115357982
18	NC_008391	GGCGA	2	10	11422	11431	20 %	0 %	60 %	20 %	115357982
19	NC_008391	CGCGG	2	10	12566	12575	0 %	0 %	60 %	40 %	115357984
20	NC_008391	CGGTC	2	10	12697	12706	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008391	GCGCC	2	10	14104	14113	0 %	0 %	40 %	60 %	115357986
22	NC_008391	GAACG	2	10	14779	14788	40 %	0 %	40 %	20 %	115357987
23	NC_008391	GGATC	2	10	15003	15012	20 %	20 %	40 %	20 %	115357987
24	NC_008391	GTCAG	2	10	15259	15268	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008391	GCCGG	2	10	15597	15606	0 %	0 %	60 %	40 %	115357988
26	NC_008391	CGGCC	2	10	15809	15818	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_008391	TGATT	2	10	18233	18242	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008391	CGGCG	2	10	19067	19076	0 %	0 %	60 %	40 %	115357991
29	NC_008391	CCGCG	2	10	19230	19239	0 %	0 %	40 %	60 %	115357991
30	NC_008391	TCGAG	2	10	20030	20039	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008391	ACGCC	2	10	20863	20872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_008391	AGGCG	2	10	20906	20915	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008391	CGCAC	2	10	23268	23277	20 %	0 %	20 %	60 %	115357994
34	NC_008391	CATCG	2	10	23992	24001	20 %	20 %	20 %	40 %	115357994
35	NC_008391	TCGCG	2	10	24528	24537	0 %	20 %	40 %	40 %	115357994
36	NC_008391	CGTTC	2	10	26756	26765	0 %	40 %	20 %	40 %	115357996
37	NC_008391	CGTGG	2	10	27275	27284	0 %	20 %	60 %	20 %	115357996
38	NC_008391	GTTCG	2	10	27804	27813	0 %	40 %	40 %	20 %	115357997
39	NC_008391	CGTTT	2	10	27942	27951	0 %	60 %	20 %	20 %	115357997
40	NC_008391	ATGCG	2	10	28603	28612	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008391	CACGA	2	10	28909	28918	40 %	0 %	20 %	40 %	115357998
42	NC_008391	CACGA	2	10	29125	29134	40 %	0 %	20 %	40 %	115357998
43	NC_008391	GGCCT	2	10	30941	30950	0 %	20 %	40 %	40 %	115358000
44	NC_008391	TCGCG	2	10	36314	36323	0 %	20 %	40 %	40 %	115358004
45	NC_008391	GCACG	2	10	37830	37839	20 %	0 %	40 %	40 %	115358007
46	NC_008391	GCGCG	2	10	38052	38061	0 %	0 %	60 %	40 %	115358007
47	NC_008391	TGCGT	2	10	38880	38889	0 %	40 %	40 %	20 %	115358007
48	NC_008391	AGACG	2	10	39303	39312	40 %	0 %	40 %	20 %	115358007
49	NC_008391	TATAA	2	10	39547	39556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008391	TCCGG	2	10	40432	40441	0 %	20 %	40 %	40 %	115358008
51	NC_008391	CCGGC	2	10	42103	42112	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_008391	GACAC	2	10	44537	44546	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008391	AGGGC	2	10	46374	46383	20 %	0 %	60 %	20 %	115358013
54	NC_008391	GGCCC	2	10	49562	49571	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_008391	GAGTC	2	10	50238	50247	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008391	CGATG	2	10	51555	51564	20 %	20 %	40 %	20 %	115358017
57	NC_008391	ACAGC	2	10	54208	54217	40 %	0 %	20 %	40 %	115358019
58	NC_008391	GTGGC	2	10	56215	56224	0 %	20 %	60 %	20 %	115358020
59	NC_008391	AGGCG	2	10	57725	57734	20 %	0 %	60 %	20 %	115358022
60	NC_008391	ACGTC	2	10	59159	59168	20 %	20 %	20 %	40 %	115358023
61	NC_008391	CGGCG	2	10	59277	59286	0 %	0 %	60 %	40 %	115358023
62	NC_008391	TTCGG	2	10	61133	61142	0 %	40 %	40 %	20 %	115358024
63	NC_008391	CGCGC	2	10	61908	61917	0 %	0 %	40 %	60 %	115358025
64	NC_008391	CGAGC	2	10	62676	62685	20 %	0 %	40 %	40 %	115358025
65	NC_008391	GCGCG	2	10	62747	62756	0 %	0 %	60 %	40 %	115358025
66	NC_008391	CGGCG	2	10	65410	65419	0 %	0 %	60 %	40 %	115358027
67	NC_008391	CGAAG	2	10	65865	65874	40 %	0 %	40 %	20 %	115358028
68	NC_008391	GCTGC	2	10	66818	66827	0 %	20 %	40 %	40 %	115358029
69	NC_008391	CCGCG	2	10	67466	67475	0 %	0 %	40 %	60 %	115358029
70	NC_008391	CGGGC	2	10	68546	68555	0 %	0 %	60 %	40 %	115358029
71	NC_008391	ATTCG	2	10	69281	69290	20 %	40 %	20 %	20 %	115358029
72	NC_008391	ACGGC	2	10	69797	69806	20 %	0 %	40 %	40 %	115358030
73	NC_008391	TTCCA	2	10	70898	70907	20 %	40 %	0 %	40 %	115358032
74	NC_008391	CCGAT	2	10	72182	72191	20 %	20 %	20 %	40 %	115358034
75	NC_008391	CGCGC	2	10	73795	73804	0 %	0 %	40 %	60 %	115358036
76	NC_008391	ATTCT	2	10	74465	74474	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008391	CGTCG	2	10	75686	75695	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_008391	CGGGC	2	10	77365	77374	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_008391	GTTCG	2	10	78974	78983	0 %	40 %	40 %	20 %	115358043
80	NC_008391	CGTTT	2	10	79675	79684	0 %	60 %	20 %	20 %	115358043
81	NC_008391	CGTGC	2	10	80918	80927	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_008391	CGATC	2	10	80932	80941	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_008391	CGCGG	2	10	83089	83098	0 %	0 %	60 %	40 %	115358045
84	NC_008391	ATCTC	2	10	84739	84748	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008391	TGCGC	2	10	85745	85754	0 %	20 %	40 %	40 %	115358047
86	NC_008391	GAGAG	2	10	85938	85947	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008391	TTTCG	2	10	89295	89304	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008391	GCATG	2	10	89387	89396	20 %	20 %	40 %	20 %	115358051
89	NC_008391	CGGCG	2	10	90687	90696	0 %	0 %	60 %	40 %	115358051
90	NC_008391	CGGCG	2	10	91180	91189	0 %	0 %	60 %	40 %	115358052
91	NC_008391	GCCGA	2	10	91763	91772	20 %	0 %	40 %	40 %	115358052
92	NC_008391	GCCGG	2	10	92401	92410	0 %	0 %	60 %	40 %	115358052
93	NC_008391	TGCCG	2	10	92928	92937	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_008391	AGCGC	2	10	92956	92965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_008391	CGCGC	2	10	93423	93432	0 %	0 %	40 %	60 %	115358053
96	NC_008391	CGGCC	2	10	94587	94596	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
97	NC_008391	ACGGC	2	10	97865	97874	20 %	0 %	40 %	40 %	115358057
98	NC_008391	CGTCG	2	10	98244	98253	0 %	20 %	40 %	40 %	115358057
99	NC_008391	GCGCG	2	10	99899	99908	0 %	0 %	60 %	40 %	115358059
100	NC_008391	CGGAT	2	10	100794	100803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008391	CCGTG	2	10	100835	100844	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008391	GCCGC	2	10	103971	103980	0 %	0 %	40 %	60 %	115358064
103	NC_008391	CGAAG	2	10	104424	104433	40 %	0 %	40 %	20 %	115358064
104	NC_008391	CGCGC	2	10	108057	108066	0 %	0 %	40 %	60 %	115358067
105	NC_008391	GAAGC	2	10	108067	108076	40 %	0 %	40 %	20 %	115358067
106	NC_008391	GCGCG	2	10	108099	108108	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_008391	CCGGT	2	10	108212	108221	0 %	20 %	40 %	40 %	115358068
108	NC_008391	CGCGC	2	10	108869	108878	0 %	0 %	40 %	60 %	115358068
109	NC_008391	CACGA	2	10	109711	109720	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_008391	GCGCG	2	10	111481	111490	0 %	0 %	60 %	40 %	115358071
111	NC_008391	CGACC	2	10	112066	112075	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_008391	GCGGG	2	10	115206	115215	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
113	NC_008391	CCACG	2	10	116864	116873	20 %	0 %	20 %	60 %	115358076
114	NC_008391	TCTTG	2	10	118538	118547	0 %	60 %	20 %	20 %	115358078
115	NC_008391	CCAGG	2	10	118834	118843	20 %	0 %	40 %	40 %	115358078
116	NC_008391	GCGTC	2	10	121593	121602	0 %	20 %	40 %	40 %	115358080
117	NC_008391	ACGCA	2	10	121842	121851	40 %	0 %	20 %	40 %	115358080
118	NC_008391	GCGAA	2	10	122474	122483	40 %	0 %	40 %	20 %	115358080
119	NC_008391	GCGAC	2	10	123221	123230	20 %	0 %	40 %	40 %	115358081
120	NC_008391	GCAAG	2	10	123240	123249	40 %	0 %	40 %	20 %	115358081
121	NC_008391	AGGCA	2	10	124355	124364	40 %	0 %	40 %	20 %	115358082
122	NC_008391	GCGTT	2	10	124501	124510	0 %	40 %	40 %	20 %	115358082
123	NC_008391	CGCGT	2	10	125407	125416	0 %	20 %	40 %	40 %	115358083
124	NC_008391	GCGCG	2	10	126597	126606	0 %	0 %	60 %	40 %	115358084
125	NC_008391	CGGGC	2	10	127464	127473	0 %	0 %	60 %	40 %	115358086
126	NC_008391	CGCGC	2	10	128466	128475	0 %	0 %	40 %	60 %	115358086
127	NC_008391	GAAGG	2	10	128908	128917	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008391	TTGTC	2	10	129074	129083	0 %	60 %	20 %	20 %	115358088
129	NC_008391	TCGCA	2	10	129949	129958	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008391	GTTCG	2	10	130930	130939	0 %	40 %	40 %	20 %	115358089
131	NC_008391	TCGCA	2	10	133541	133550	20 %	20 %	20 %	40 %	115358091
132	NC_008391	GGGCT	2	10	133905	133914	0 %	20 %	60 %	20 %	115358092
133	NC_008391	GACGC	2	10	134942	134951	20 %	0 %	40 %	40 %	115358094
134	NC_008391	GCGAT	2	10	136806	136815	20 %	20 %	40 %	20 %	115358095
135	NC_008391	CGACG	2	10	137901	137910	20 %	0 %	40 %	40 %	115358096
136	NC_008391	GGCGC	2	10	137911	137920	0 %	0 %	60 %	40 %	115358096
137	NC_008391	GCGCC	2	10	138493	138502	0 %	0 %	40 %	60 %	115358096
138	NC_008391	ACGCG	2	10	138855	138864	20 %	0 %	40 %	40 %	115358096
139	NC_008391	GTCGC	2	10	138934	138943	0 %	20 %	40 %	40 %	115358096
140	NC_008391	CGCAC	2	10	139347	139356	20 %	0 %	20 %	60 %	115358096
141	NC_008391	CGCGC	2	10	140509	140518	0 %	0 %	40 %	60 %	115358098
142	NC_008391	TCGAG	2	10	142274	142283	20 %	20 %	40 %	20 %	115358099
143	NC_008391	GCGCC	2	10	144041	144050	0 %	0 %	40 %	60 %	115358101
144	NC_008391	ACACA	2	10	144133	144142	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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146	NC_008391	CGGCG	2	10	145073	145082	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
147	NC_008391	CGTTT	2	10	145125	145134	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_008391	TCGCG	2	10	145566	145575	0 %	20 %	40 %	40 %	115358103
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152	NC_008391	TTTTG	2	10	149631	149640	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_008391	CAGCG	2	10	158364	158373	20 %	0 %	40 %	40 %	115358113
162	NC_008391	CCCAG	2	10	159071	159080	20 %	0 %	20 %	60 %	115358113
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164	NC_008391	GCGTC	2	10	159602	159611	0 %	20 %	40 %	40 %	115358114
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168	NC_008391	GCGAC	2	10	162185	162194	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_008391	CGCGA	2	10	172604	172613	20 %	0 %	40 %	40 %	115358126
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197	NC_008391	GCGCC	2	10	195513	195522	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
198	NC_008391	GCGCG	2	10	195841	195850	0 %	0 %	60 %	40 %	115358148
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246	NC_008391	GCAAT	2	10	235725	235734	40 %	20 %	20 %	20 %	115358189
247	NC_008391	GCGCG	2	10	236244	236253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
248	NC_008391	AGCGA	2	10	236778	236787	40 %	0 %	40 %	20 %	115358190
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260	NC_008391	GTCGG	2	10	248179	248188	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
261	NC_008391	GCGCG	2	10	248806	248815	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
262	NC_008391	GCGAA	2	10	249257	249266	40 %	0 %	40 %	20 %	115358202
263	NC_008391	CGCGT	2	10	249797	249806	0 %	20 %	40 %	40 %	115358203
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266	NC_008391	CGGTT	2	10	252042	252051	0 %	40 %	40 %	20 %	115358205
267	NC_008391	CTGCG	2	10	252159	252168	0 %	20 %	40 %	40 %	115358205
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