MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB4

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008389	ACA	2	6	127	132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008389	CGG	2	6	179	184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008389	AGA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008389	CCT	2	6	502	507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008389	TTC	2	6	547	552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008389	ACA	2	6	718	723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008389	GAT	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008389	ATG	2	6	898	903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345713
9	NC_008389	GGA	2	6	1057	1062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345714
10	NC_008389	CGG	2	6	1121	1126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345714
11	NC_008389	AGT	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008389	CTT	2	6	1890	1895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345715
13	NC_008389	GAT	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345715
14	NC_008389	TCT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345715
15	NC_008389	GAA	2	6	2103	2108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345715
16	NC_008389	ACC	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345715
17	NC_008389	TCG	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345715
18	NC_008389	AGG	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345715
19	NC_008389	GGC	2	6	2330	2335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345715
20	NC_008389	GGT	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345715
21	NC_008389	GCG	2	6	2474	2479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345715
22	NC_008389	AGA	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345715
23	NC_008389	GCA	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345715
24	NC_008389	ATC	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345715
25	NC_008389	GAT	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345715
26	NC_008389	ACA	2	6	2841	2846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345715
27	NC_008389	CGA	2	6	3061	3066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345716
28	NC_008389	TCT	2	6	3093	3098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345716
29	NC_008389	GAT	2	6	3103	3108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345716
30	NC_008389	GCG	2	6	3141	3146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345716
31	NC_008389	GAC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345716
32	NC_008389	CCG	2	6	3276	3281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345716
33	NC_008389	TTC	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345716
34	NC_008389	TTG	2	6	3368	3373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345716
35	NC_008389	CAC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345716
36	NC_008389	CTT	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008389	TCT	2	6	3613	3618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008389	TCC	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008389	CGG	2	6	3763	3768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008389	GAT	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008389	TCG	2	6	3862	3867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008389	AAG	2	6	4313	4318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345717
43	NC_008389	CGG	2	6	4471	4476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345717
44	NC_008389	GTC	2	6	4532	4537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345717
45	NC_008389	TGC	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345717
46	NC_008389	TTC	2	6	4686	4691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008389	GCC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008389	GTT	2	6	4874	4879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345718
49	NC_008389	TTG	2	6	4887	4892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345718
50	NC_008389	AAC	2	6	5025	5030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345718
51	NC_008389	CTG	2	6	5073	5078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008389	CTT	2	6	5186	5191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008389	ACG	2	6	5577	5582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008389	CCG	2	6	5644	5649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008389	GGC	2	6	5752	5757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.