MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB4

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008389	GA	3	6	826	831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008389	GA	3	6	1335	1340	50 %	0 %	50 %	0 %	115345714
3	NC_008389	TC	3	6	1360	1365	0 %	50 %	0 %	50 %	115345714
4	NC_008389	TG	3	6	1370	1375	0 %	50 %	50 %	0 %	115345714
5	NC_008389	GA	3	6	2114	2119	50 %	0 %	50 %	0 %	115345715
6	NC_008389	CG	3	6	2145	2150	0 %	0 %	50 %	50 %	115345715
7	NC_008389	GC	3	6	2373	2378	0 %	0 %	50 %	50 %	115345715
8	NC_008389	CG	3	6	2715	2720	0 %	0 %	50 %	50 %	115345715
9	NC_008389	GC	3	6	2941	2946	0 %	0 %	50 %	50 %	115345716
10	NC_008389	TC	3	6	2970	2975	0 %	50 %	0 %	50 %	115345716
11	NC_008389	TC	3	6	3447	3452	0 %	50 %	0 %	50 %	115345716
12	NC_008389	CG	3	6	3486	3491	0 %	0 %	50 %	50 %	115345716
13	NC_008389	GC	3	6	3560	3565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008389	TA	3	6	4045	4050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008389	GA	3	6	4867	4872	50 %	0 %	50 %	0 %	115345718
16	NC_008389	AC	3	6	5047	5052	50 %	0 %	0 %	50 %	115345718
17	NC_008389	TG	3	6	5210	5215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008389	CA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008389	GC	3	6	5449	5454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.