MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB3

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008388	GTCT	2	8	980	987	0 %	50 %	25 %	25 %	115345695
2	NC_008388	AGGC	2	8	1150	1157	25 %	0 %	50 %	25 %	115345695
3	NC_008388	GCCT	2	8	1963	1970	0 %	25 %	25 %	50 %	115345696
4	NC_008388	CCGA	2	8	2791	2798	25 %	0 %	25 %	50 %	115345697
5	NC_008388	TGCG	2	8	3250	3257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008388	TCCG	2	8	3293	3300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008388	AACC	2	8	3352	3359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008388	ACCA	2	8	5107	5114	50 %	0 %	0 %	50 %	115345701
9	NC_008388	GTCT	2	8	5272	5279	0 %	50 %	25 %	25 %	115345701
10	NC_008388	AGTA	2	8	5916	5923	50 %	25 %	25 %	0 %	115345702
11	NC_008388	ATCC	2	8	6171	6178	25 %	25 %	0 %	50 %	115345702
12	NC_008388	TGAA	2	8	7193	7200	50 %	25 %	25 %	0 %	115345702
13	NC_008388	GCTT	2	8	7302	7309	0 %	50 %	25 %	25 %	115345702
14	NC_008388	TTTC	2	8	7449	7456	0 %	75 %	0 %	25 %	115345702
15	NC_008388	TCAG	2	8	7468	7475	25 %	25 %	25 %	25 %	115345702
16	NC_008388	GGCT	2	8	7737	7744	0 %	25 %	50 %	25 %	115345702
17	NC_008388	CGAG	2	8	7906	7913	25 %	0 %	50 %	25 %	115345703
18	NC_008388	GACT	2	8	8056	8063	25 %	25 %	25 %	25 %	115345703
19	NC_008388	TCAT	2	8	9044	9051	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008388	CTTG	2	8	9193	9200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008388	CGAG	2	8	9220	9227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008388	AGCG	2	8	10275	10282	25 %	0 %	50 %	25 %	115345704
23	NC_008388	CAGA	2	8	11863	11870	50 %	0 %	25 %	25 %	115345706
24	NC_008388	GGAT	2	8	11947	11954	25 %	25 %	50 %	0 %	115345706
25	NC_008388	CCGA	2	8	11960	11967	25 %	0 %	25 %	50 %	115345706
26	NC_008388	ACTC	2	8	11968	11975	25 %	25 %	0 %	50 %	115345706
27	NC_008388	CTTG	2	8	12458	12465	0 %	50 %	25 %	25 %	115345706
28	NC_008388	AGAT	2	8	13005	13012	50 %	25 %	25 %	0 %	115345707
29	NC_008388	TGAA	2	8	13383	13390	50 %	25 %	25 %	0 %	115345707
30	NC_008388	ACGC	2	8	13849	13856	25 %	0 %	25 %	50 %	115345708
31	NC_008388	GCGT	2	8	13971	13978	0 %	25 %	50 %	25 %	115345708
32	NC_008388	GGAA	2	8	14571	14578	50 %	0 %	50 %	0 %	115345708
33	NC_008388	TTTC	2	8	14850	14857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008388	TCAT	2	8	15240	15247	25 %	50 %	0 %	25 %	115345710
35	NC_008388	ATTT	2	8	15905	15912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.