MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB3

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008388	AT	3	6	563	568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008388	GC	3	6	1586	1591	0 %	0 %	50 %	50 %	115345696
3	NC_008388	GT	3	6	1877	1882	0 %	50 %	50 %	0 %	115345696
4	NC_008388	GA	3	6	2047	2052	50 %	0 %	50 %	0 %	115345696
5	NC_008388	TG	3	6	2467	2472	0 %	50 %	50 %	0 %	115345696
6	NC_008388	GC	3	6	3308	3313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008388	GC	3	6	3721	3726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008388	CG	3	6	4227	4232	0 %	0 %	50 %	50 %	115345700
9	NC_008388	CG	3	6	4588	4593	0 %	0 %	50 %	50 %	115345700
10	NC_008388	GT	3	6	4632	4637	0 %	50 %	50 %	0 %	115345700
11	NC_008388	GC	3	6	4895	4900	0 %	0 %	50 %	50 %	115345700
12	NC_008388	GA	3	6	5094	5099	50 %	0 %	50 %	0 %	115345701
13	NC_008388	AC	3	6	5790	5795	50 %	0 %	0 %	50 %	115345702
14	NC_008388	GA	4	8	6142	6149	50 %	0 %	50 %	0 %	115345702
15	NC_008388	AG	3	6	6850	6855	50 %	0 %	50 %	0 %	115345702
16	NC_008388	GT	3	6	7052	7057	0 %	50 %	50 %	0 %	115345702
17	NC_008388	CG	3	6	7174	7179	0 %	0 %	50 %	50 %	115345702
18	NC_008388	CA	3	6	9027	9032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008388	GC	3	6	9179	9184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008388	AT	3	6	9434	9439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008388	CT	3	6	9444	9449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008388	GC	3	6	9878	9883	0 %	0 %	50 %	50 %	115345704
23	NC_008388	GC	3	6	10238	10243	0 %	0 %	50 %	50 %	115345704
24	NC_008388	CG	3	6	10293	10298	0 %	0 %	50 %	50 %	115345704
25	NC_008388	CA	3	6	10482	10487	50 %	0 %	0 %	50 %	115345705
26	NC_008388	GA	3	6	12535	12540	50 %	0 %	50 %	0 %	115345706
27	NC_008388	CT	3	6	12800	12805	0 %	50 %	0 %	50 %	115345707
28	NC_008388	GC	5	10	13670	13679	0 %	0 %	50 %	50 %	115345708
29	NC_008388	CG	3	6	13939	13944	0 %	0 %	50 %	50 %	115345708
30	NC_008388	TA	3	6	14906	14911	50 %	50 %	0 %	0 %	115345709
31	NC_008388	CG	3	6	15533	15538	0 %	0 %	50 %	50 %	115345710
32	NC_008388	CA	3	6	16007	16012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.