MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB2

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008387	GCTGGT	2	12	4883	4894	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115345641
2	NC_008387	CGTGCC	2	12	5159	5170	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115345641
3	NC_008387	CAGATC	2	12	7448	7459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115345643
4	NC_008387	GCGCGG	2	12	7943	7954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345644
5	NC_008387	GATCAG	2	12	8884	8895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115345644
6	NC_008387	GAAACA	2	12	9387	9398	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115345644
7	NC_008387	GTGCTG	2	12	11068	11079	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115345646
8	NC_008387	GGATCT	2	12	11412	11423	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115345646
9	NC_008387	TGCCCG	2	12	11635	11646	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115345647
10	NC_008387	CCGGGA	2	12	12654	12665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115345648
11	NC_008387	CGATCT	2	12	13574	13585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115345648
12	NC_008387	CCCGAC	2	12	14991	15002	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	115345649
13	NC_008387	CTGATC	2	12	20231	20242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115345653
14	NC_008387	GTTCAG	2	12	24359	24370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115345658
15	NC_008387	ACAGGA	2	12	26289	26300	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	115345659
16	NC_008387	TATCCT	2	12	26387	26398	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008387	TCTGGC	2	12	27678	27689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008387	TTGCCC	2	12	28804	28815	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	115345661
19	NC_008387	GCTGGT	3	18	30402	30419	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115345662
20	NC_008387	GTCCAC	2	12	35240	35251	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115345666
21	NC_008387	TCCTTG	2	12	35853	35864	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	115345666
22	NC_008387	ATCGGC	2	12	36654	36665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115345666
23	NC_008387	CGGCCA	2	12	43137	43148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115345672
24	NC_008387	ATAGCC	2	12	43714	43725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115345672
25	NC_008387	GTTGGG	2	12	44797	44808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345673
26	NC_008387	GGTATT	2	12	46766	46777	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	115345674
27	NC_008387	CCAGGC	2	12	48711	48722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115345676
28	NC_008387	CCTTGG	2	12	55746	55757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345683
29	NC_008387	ATCACC	2	12	56766	56777	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	115345684
30	NC_008387	ATTGTG	2	12	58807	58818	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008387	TGGCGA	2	12	63923	63934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115345688
32	NC_008387	GGGTTG	2	12	66122	66133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345690

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.