MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB2

Total Repeats: 850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008387	CCG	2	6	786	791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345637
2	NC_008387	ACC	2	6	868	873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345637
3	NC_008387	TCG	2	6	886	891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345637
4	NC_008387	GCG	2	6	960	965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345637
5	NC_008387	ATC	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345637
6	NC_008387	CCG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345638
7	NC_008387	AGG	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345638
8	NC_008387	CAC	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345639
9	NC_008387	ACC	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345639
10	NC_008387	TGG	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345639
11	NC_008387	CGC	2	6	1461	1466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345639
12	NC_008387	GGC	2	6	1547	1552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345639
13	NC_008387	CAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345639
14	NC_008387	CCG	2	6	1629	1634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345639
15	NC_008387	CGG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345639
16	NC_008387	ATC	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345639
17	NC_008387	GCC	2	6	2060	2065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345639
18	NC_008387	TGC	2	6	2173	2178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345639
19	NC_008387	GCC	2	6	2192	2197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345639
20	NC_008387	CAT	2	6	2317	2322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345639
21	NC_008387	CAC	3	9	2371	2379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345639
22	NC_008387	CGG	2	6	2737	2742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345639
23	NC_008387	CAC	2	6	2749	2754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345639
24	NC_008387	GCA	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345639
25	NC_008387	GCG	2	6	2817	2822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345639
26	NC_008387	ACG	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345639
27	NC_008387	GAC	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345639
28	NC_008387	CGC	2	6	2979	2984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345639
29	NC_008387	GCA	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345639
30	NC_008387	GGT	2	6	3142	3147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345639
31	NC_008387	CTG	2	6	3595	3600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345640
32	NC_008387	ACC	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345640
33	NC_008387	CTG	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345640
34	NC_008387	CTG	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345640
35	NC_008387	GAA	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345640
36	NC_008387	GTG	2	6	4135	4140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345640
37	NC_008387	GAT	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345640
38	NC_008387	GGC	3	9	4274	4282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345640
39	NC_008387	ACC	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345640
40	NC_008387	GCG	2	6	4584	4589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345641
41	NC_008387	TCA	2	6	4594	4599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345641
42	NC_008387	GCG	2	6	4605	4610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345641
43	NC_008387	CGG	2	6	4636	4641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345641
44	NC_008387	TGC	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345641
45	NC_008387	TGT	2	6	4670	4675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345641
46	NC_008387	GTC	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345641
47	NC_008387	GCC	2	6	5034	5039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345641
48	NC_008387	CAC	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345641
49	NC_008387	TCC	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345641
50	NC_008387	GGC	2	6	5130	5135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345641
51	NC_008387	CGG	2	6	5150	5155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345641
52	NC_008387	GGC	2	6	5207	5212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345641
53	NC_008387	GCA	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345641
54	NC_008387	GCC	2	6	5300	5305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345641
55	NC_008387	CCA	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345641
56	NC_008387	TGA	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345641
57	NC_008387	GGC	2	6	5462	5467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345641
58	NC_008387	GCC	2	6	5759	5764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345642
59	NC_008387	CAG	3	9	5777	5785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345642
60	NC_008387	TGC	2	6	5826	5831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345642
61	NC_008387	CCG	2	6	5885	5890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345642
62	NC_008387	GCC	2	6	5933	5938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345642
63	NC_008387	ATC	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345642
64	NC_008387	CGA	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345642
65	NC_008387	GAT	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345642
66	NC_008387	CAC	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345642
67	NC_008387	TCG	2	6	6372	6377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345642
68	NC_008387	CAG	2	6	6407	6412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345642
69	NC_008387	TGG	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345642
70	NC_008387	ATC	2	6	6675	6680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345642
71	NC_008387	TGA	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345642
72	NC_008387	TTG	2	6	6959	6964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345643
73	NC_008387	CCA	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345643
74	NC_008387	GTA	2	6	7091	7096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345643
75	NC_008387	CTG	2	6	7136	7141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345643
76	NC_008387	GCC	2	6	7265	7270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345643
77	NC_008387	CCG	2	6	7346	7351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345643
78	NC_008387	GGC	2	6	7598	7603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345643
79	NC_008387	CAT	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345643
80	NC_008387	GAT	2	6	7652	7657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345643
81	NC_008387	CTG	2	6	7676	7681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345643
82	NC_008387	ACG	2	6	7703	7708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345643
83	NC_008387	GCG	2	6	7751	7756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345643
84	NC_008387	GCG	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345644
85	NC_008387	AGC	2	6	7921	7926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345644
86	NC_008387	CCA	2	6	8091	8096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345644
87	NC_008387	CCA	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345644
88	NC_008387	GCC	2	6	8148	8153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345644
89	NC_008387	GCC	2	6	8305	8310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345644
90	NC_008387	CAG	2	6	8344	8349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345644
91	NC_008387	TTC	2	6	8353	8358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345644
92	NC_008387	GAT	2	6	8590	8595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345644
93	NC_008387	AGA	2	6	8615	8620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345644
94	NC_008387	GGC	2	6	8672	8677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345644
95	NC_008387	CAT	2	6	8691	8696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345644
96	NC_008387	TGC	2	6	8816	8821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345644
97	NC_008387	CCG	2	6	8912	8917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345644
98	NC_008387	AGG	2	6	8933	8938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345644
99	NC_008387	CAT	2	6	9013	9018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345644
100	NC_008387	TCC	2	6	9043	9048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345644
101	NC_008387	GCT	2	6	9145	9150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345644
102	NC_008387	CGG	2	6	9255	9260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345644
103	NC_008387	GCA	2	6	9294	9299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345644
104	NC_008387	CGG	2	6	9458	9463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345644
105	NC_008387	CAT	2	6	9654	9659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345645
106	NC_008387	GTG	2	6	9751	9756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345645
107	NC_008387	GAC	2	6	10021	10026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345645
108	NC_008387	GTT	2	6	10043	10048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345645
109	NC_008387	GCC	2	6	10087	10092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345645
110	NC_008387	TGA	2	6	10155	10160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345645
111	NC_008387	CTG	2	6	10189	10194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345645
112	NC_008387	GAT	2	6	10203	10208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345645
113	NC_008387	GGC	2	6	10336	10341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345645
114	NC_008387	CAT	2	6	10623	10628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345646
115	NC_008387	CGG	2	6	11189	11194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345646
116	NC_008387	TGG	2	6	11228	11233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345646
117	NC_008387	GCT	2	6	11456	11461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345647
118	NC_008387	TCA	2	6	11463	11468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345647
119	NC_008387	GGC	2	6	11575	11580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345647
120	NC_008387	GGT	2	6	11599	11604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345647
121	NC_008387	GCC	2	6	11619	11624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345647
122	NC_008387	GGT	2	6	11779	11784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345647
123	NC_008387	GCG	2	6	11980	11985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345647
124	NC_008387	GGC	2	6	12003	12008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345647
125	NC_008387	GGC	2	6	12103	12108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345647
126	NC_008387	GCG	2	6	12151	12156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345647
127	NC_008387	GGC	2	6	12281	12286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345647
128	NC_008387	CTG	2	6	12314	12319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345647
129	NC_008387	GGC	2	6	12366	12371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345647
130	NC_008387	CGG	2	6	12432	12437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345648
131	NC_008387	CGG	2	6	12483	12488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345648
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135	NC_008387	GAT	2	6	12588	12593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345648
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