MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB2

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008387	GC	3	6	31	36	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008387	GC	3	6	258	263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008387	GC	3	6	465	470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008387	GC	3	6	664	669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008387	GC	3	6	693	698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008387	CG	3	6	748	753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008387	GC	3	6	1004	1009	0 %	0 %	50 %	50 %	115345637
8	NC_008387	CG	3	6	1482	1487	0 %	0 %	50 %	50 %	115345639
9	NC_008387	GC	3	6	1761	1766	0 %	0 %	50 %	50 %	115345639
10	NC_008387	GA	3	6	1899	1904	50 %	0 %	50 %	0 %	115345639
11	NC_008387	GC	4	8	2163	2170	0 %	0 %	50 %	50 %	115345639
12	NC_008387	GC	3	6	2211	2216	0 %	0 %	50 %	50 %	115345639
13	NC_008387	GC	3	6	2431	2436	0 %	0 %	50 %	50 %	115345639
14	NC_008387	CT	3	6	3815	3820	0 %	50 %	0 %	50 %	115345640
15	NC_008387	CG	4	8	3893	3900	0 %	0 %	50 %	50 %	115345640
16	NC_008387	GC	3	6	4141	4146	0 %	0 %	50 %	50 %	115345640
17	NC_008387	GC	3	6	4977	4982	0 %	0 %	50 %	50 %	115345641
18	NC_008387	CG	3	6	4998	5003	0 %	0 %	50 %	50 %	115345641
19	NC_008387	GC	3	6	5232	5237	0 %	0 %	50 %	50 %	115345641
20	NC_008387	GC	3	6	5382	5387	0 %	0 %	50 %	50 %	115345641
21	NC_008387	CG	4	8	5493	5500	0 %	0 %	50 %	50 %	115345641
22	NC_008387	GC	3	6	5671	5676	0 %	0 %	50 %	50 %	115345642
23	NC_008387	GC	3	6	5746	5751	0 %	0 %	50 %	50 %	115345642
24	NC_008387	GC	4	8	5833	5840	0 %	0 %	50 %	50 %	115345642
25	NC_008387	CG	3	6	6559	6564	0 %	0 %	50 %	50 %	115345642
26	NC_008387	GT	3	6	6618	6623	0 %	50 %	50 %	0 %	115345642
27	NC_008387	CG	3	6	6664	6669	0 %	0 %	50 %	50 %	115345642
28	NC_008387	GC	3	6	7217	7222	0 %	0 %	50 %	50 %	115345643
29	NC_008387	GC	4	8	8290	8297	0 %	0 %	50 %	50 %	115345644
30	NC_008387	CT	3	6	8666	8671	0 %	50 %	0 %	50 %	115345644
31	NC_008387	GC	3	6	10272	10277	0 %	0 %	50 %	50 %	115345645
32	NC_008387	GC	3	6	10369	10374	0 %	0 %	50 %	50 %	115345645
33	NC_008387	GC	3	6	10676	10681	0 %	0 %	50 %	50 %	115345646
34	NC_008387	CA	3	6	10815	10820	50 %	0 %	0 %	50 %	115345646
35	NC_008387	CG	3	6	11527	11532	0 %	0 %	50 %	50 %	115345647
36	NC_008387	GC	4	8	11870	11877	0 %	0 %	50 %	50 %	115345647
37	NC_008387	GC	4	8	12118	12125	0 %	0 %	50 %	50 %	115345647
38	NC_008387	CA	3	6	12936	12941	50 %	0 %	0 %	50 %	115345648
39	NC_008387	GC	4	8	14266	14273	0 %	0 %	50 %	50 %	115345649
40	NC_008387	CG	3	6	15474	15479	0 %	0 %	50 %	50 %	115345649
41	NC_008387	GC	3	6	15579	15584	0 %	0 %	50 %	50 %	115345649
42	NC_008387	GC	3	6	16182	16187	0 %	0 %	50 %	50 %	115345650
43	NC_008387	CG	3	6	16524	16529	0 %	0 %	50 %	50 %	115345650
44	NC_008387	CG	3	6	16681	16686	0 %	0 %	50 %	50 %	115345650
45	NC_008387	CG	3	6	16713	16718	0 %	0 %	50 %	50 %	115345650
46	NC_008387	AT	3	6	17361	17366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008387	CG	3	6	17860	17865	0 %	0 %	50 %	50 %	115345651
48	NC_008387	GC	3	6	18063	18068	0 %	0 %	50 %	50 %	115345651
49	NC_008387	GC	4	8	18376	18383	0 %	0 %	50 %	50 %	115345652
50	NC_008387	CG	3	6	18485	18490	0 %	0 %	50 %	50 %	115345652
51	NC_008387	GC	3	6	18902	18907	0 %	0 %	50 %	50 %	115345652
52	NC_008387	GC	3	6	19089	19094	0 %	0 %	50 %	50 %	115345652
53	NC_008387	TC	3	6	19205	19210	0 %	50 %	0 %	50 %	115345652
54	NC_008387	GC	3	6	19325	19330	0 %	0 %	50 %	50 %	115345652
55	NC_008387	CG	4	8	19356	19363	0 %	0 %	50 %	50 %	115345652
56	NC_008387	CG	3	6	19836	19841	0 %	0 %	50 %	50 %	115345653
57	NC_008387	GC	3	6	20203	20208	0 %	0 %	50 %	50 %	115345653
58	NC_008387	CG	3	6	20631	20636	0 %	0 %	50 %	50 %	115345654
59	NC_008387	GC	4	8	20709	20716	0 %	0 %	50 %	50 %	115345654
60	NC_008387	CA	3	6	20723	20728	50 %	0 %	0 %	50 %	115345654
61	NC_008387	CG	4	8	20743	20750	0 %	0 %	50 %	50 %	115345654
62	NC_008387	GC	4	8	21292	21299	0 %	0 %	50 %	50 %	115345654
63	NC_008387	GC	3	6	21335	21340	0 %	0 %	50 %	50 %	115345654
64	NC_008387	GC	3	6	21860	21865	0 %	0 %	50 %	50 %	115345655
65	NC_008387	GC	3	6	22030	22035	0 %	0 %	50 %	50 %	115345655
66	NC_008387	CG	3	6	22831	22836	0 %	0 %	50 %	50 %	115345656
67	NC_008387	CG	3	6	22859	22864	0 %	0 %	50 %	50 %	115345656
68	NC_008387	GC	4	8	23227	23234	0 %	0 %	50 %	50 %	115345657
69	NC_008387	GC	3	6	23464	23469	0 %	0 %	50 %	50 %	115345657
70	NC_008387	GC	3	6	23560	23565	0 %	0 %	50 %	50 %	115345657
71	NC_008387	GC	3	6	24449	24454	0 %	0 %	50 %	50 %	115345658
72	NC_008387	GC	3	6	24642	24647	0 %	0 %	50 %	50 %	115345658
73	NC_008387	GC	3	6	26270	26275	0 %	0 %	50 %	50 %	115345659
74	NC_008387	GC	3	6	26479	26484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008387	TG	3	6	26793	26798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008387	GT	3	6	26834	26839	0 %	50 %	50 %	0 %	115345660
77	NC_008387	AG	3	6	27734	27739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008387	GC	3	6	28846	28851	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
79	NC_008387	CA	3	6	29315	29320	50 %	0 %	0 %	50 %	115345661
80	NC_008387	GC	4	8	29341	29348	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
81	NC_008387	GC	3	6	29464	29469	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
82	NC_008387	GC	4	8	30134	30141	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
83	NC_008387	GC	3	6	30153	30158	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
84	NC_008387	GC	3	6	30245	30250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008387	GC	3	6	30564	30569	0 %	0 %	50 %	50 %	115345662
86	NC_008387	GC	3	6	31044	31049	0 %	0 %	50 %	50 %	115345663
87	NC_008387	CG	3	6	31910	31915	0 %	0 %	50 %	50 %	115345663
88	NC_008387	GC	3	6	32219	32224	0 %	0 %	50 %	50 %	115345663
89	NC_008387	GT	3	6	32286	32291	0 %	50 %	50 %	0 %	115345663
90	NC_008387	TG	3	6	33194	33199	0 %	50 %	50 %	0 %	115345665
91	NC_008387	CG	4	8	33327	33334	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
92	NC_008387	GC	4	8	33532	33539	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
93	NC_008387	CG	3	6	33838	33843	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
94	NC_008387	CG	3	6	34287	34292	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
95	NC_008387	CG	3	6	34611	34616	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
96	NC_008387	CG	3	6	34731	34736	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
97	NC_008387	CG	3	6	34791	34796	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
98	NC_008387	CG	3	6	34947	34952	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
99	NC_008387	CG	3	6	34984	34989	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
100	NC_008387	GC	3	6	35131	35136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008387	CG	3	6	35335	35340	0 %	0 %	50 %	50 %	115345666
102	NC_008387	GC	3	6	35887	35892	0 %	0 %	50 %	50 %	115345666
103	NC_008387	GC	3	6	35953	35958	0 %	0 %	50 %	50 %	115345666
104	NC_008387	CG	3	6	36262	36267	0 %	0 %	50 %	50 %	115345666
105	NC_008387	GC	3	6	36292	36297	0 %	0 %	50 %	50 %	115345666
106	NC_008387	GC	3	6	36360	36365	0 %	0 %	50 %	50 %	115345666
107	NC_008387	CG	3	6	36523	36528	0 %	0 %	50 %	50 %	115345666
108	NC_008387	GC	3	6	36670	36675	0 %	0 %	50 %	50 %	115345666
109	NC_008387	CT	3	6	37125	37130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008387	GT	3	6	38054	38059	0 %	50 %	50 %	0 %	115345667
111	NC_008387	CT	3	6	38591	38596	0 %	50 %	0 %	50 %	115345668
112	NC_008387	CG	5	10	38864	38873	0 %	0 %	50 %	50 %	115345668
113	NC_008387	CG	3	6	38988	38993	0 %	0 %	50 %	50 %	115345668
114	NC_008387	GC	3	6	39162	39167	0 %	0 %	50 %	50 %	115345668
115	NC_008387	GC	3	6	39427	39432	0 %	0 %	50 %	50 %	115345669
116	NC_008387	CG	3	6	39558	39563	0 %	0 %	50 %	50 %	115345669
117	NC_008387	GC	3	6	39708	39713	0 %	0 %	50 %	50 %	115345669
118	NC_008387	GC	3	6	40088	40093	0 %	0 %	50 %	50 %	115345669
119	NC_008387	AG	3	6	40116	40121	50 %	0 %	50 %	0 %	115345669
120	NC_008387	GC	3	6	40362	40367	0 %	0 %	50 %	50 %	115345669
121	NC_008387	CG	3	6	40448	40453	0 %	0 %	50 %	50 %	115345669
122	NC_008387	CG	3	6	40606	40611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008387	AT	3	6	41433	41438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008387	GT	3	6	42133	42138	0 %	50 %	50 %	0 %	115345671
125	NC_008387	GC	3	6	42216	42221	0 %	0 %	50 %	50 %	115345671
126	NC_008387	CA	3	6	42367	42372	50 %	0 %	0 %	50 %	115345671
127	NC_008387	TC	3	6	42553	42558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008387	CG	4	8	42765	42772	0 %	0 %	50 %	50 %	115345672
129	NC_008387	GC	3	6	43161	43166	0 %	0 %	50 %	50 %	115345672
130	NC_008387	GT	3	6	44409	44414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008387	CA	3	6	45347	45352	50 %	0 %	0 %	50 %	115345673
132	NC_008387	TG	3	6	46544	46549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008387	TC	3	6	46900	46905	0 %	50 %	0 %	50 %	115345674
134	NC_008387	CT	3	6	47180	47185	0 %	50 %	0 %	50 %	115345674
135	NC_008387	CT	3	6	47320	47325	0 %	50 %	0 %	50 %	115345674
136	NC_008387	GC	3	6	47937	47942	0 %	0 %	50 %	50 %	115345675
137	NC_008387	GC	3	6	47995	48000	0 %	0 %	50 %	50 %	115345675
138	NC_008387	GC	3	6	48023	48028	0 %	0 %	50 %	50 %	115345675
139	NC_008387	GA	3	6	48058	48063	50 %	0 %	50 %	0 %	115345675
140	NC_008387	GC	5	10	48089	48098	0 %	0 %	50 %	50 %	115345675
141	NC_008387	GC	3	6	48119	48124	0 %	0 %	50 %	50 %	115345675
142	NC_008387	GC	3	6	48450	48455	0 %	0 %	50 %	50 %	115345675
143	NC_008387	CG	4	8	48547	48554	0 %	0 %	50 %	50 %	115345675
144	NC_008387	CG	3	6	48839	48844	0 %	0 %	50 %	50 %	115345676
145	NC_008387	GC	3	6	49349	49354	0 %	0 %	50 %	50 %	115345676
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.