MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB2

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008387	C	6	6	1017	1022	0 %	0 %	0 %	100 %	115345637
2	NC_008387	G	6	6	1339	1344	0 %	0 %	100 %	0 %	115345639
3	NC_008387	C	7	7	2466	2472	0 %	0 %	0 %	100 %	115345639
4	NC_008387	C	7	7	3264	3270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_008387	G	6	6	4516	4521	0 %	0 %	100 %	0 %	115345640
6	NC_008387	G	7	7	7903	7909	0 %	0 %	100 %	0 %	115345644
7	NC_008387	A	8	8	9486	9493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008387	G	7	7	9867	9873	0 %	0 %	100 %	0 %	115345645
9	NC_008387	C	6	6	10144	10149	0 %	0 %	0 %	100 %	115345645
10	NC_008387	G	6	6	12168	12173	0 %	0 %	100 %	0 %	115345647
11	NC_008387	G	6	6	14081	14086	0 %	0 %	100 %	0 %	115345649
12	NC_008387	G	7	7	15936	15942	0 %	0 %	100 %	0 %	115345650
13	NC_008387	G	6	6	18468	18473	0 %	0 %	100 %	0 %	115345652
14	NC_008387	G	8	8	20420	20427	0 %	0 %	100 %	0 %	115345653
15	NC_008387	T	6	6	21375	21380	0 %	100 %	0 %	0 %	115345655
16	NC_008387	T	6	6	21556	21561	0 %	100 %	0 %	0 %	115345655
17	NC_008387	G	7	7	22727	22733	0 %	0 %	100 %	0 %	115345656
18	NC_008387	A	6	6	23511	23516	100 %	0 %	0 %	0 %	115345657
19	NC_008387	G	7	7	25544	25550	0 %	0 %	100 %	0 %	115345659
20	NC_008387	T	7	7	26600	26606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008387	C	6	6	29188	29193	0 %	0 %	0 %	100 %	115345661
22	NC_008387	C	6	6	31100	31105	0 %	0 %	0 %	100 %	115345663
23	NC_008387	C	6	6	31737	31742	0 %	0 %	0 %	100 %	115345663
24	NC_008387	G	7	7	32693	32699	0 %	0 %	100 %	0 %	115345664
25	NC_008387	C	6	6	34299	34304	0 %	0 %	0 %	100 %	115345665
26	NC_008387	A	6	6	35090	35095	100 %	0 %	0 %	0 %	115345665
27	NC_008387	G	6	6	35730	35735	0 %	0 %	100 %	0 %	115345666
28	NC_008387	C	6	6	36749	36754	0 %	0 %	0 %	100 %	115345666
29	NC_008387	T	7	7	36918	36924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008387	T	6	6	42737	42742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008387	G	6	6	50052	50057	0 %	0 %	100 %	0 %	115345677
32	NC_008387	C	6	6	51292	51297	0 %	0 %	0 %	100 %	115345679
33	NC_008387	C	6	6	53187	53192	0 %	0 %	0 %	100 %	115345681
34	NC_008387	G	6	6	54485	54490	0 %	0 %	100 %	0 %	115345682
35	NC_008387	G	7	7	55217	55223	0 %	0 %	100 %	0 %	115345683
36	NC_008387	G	6	6	55458	55463	0 %	0 %	100 %	0 %	115345683
37	NC_008387	G	6	6	56042	56047	0 %	0 %	100 %	0 %	115345683
38	NC_008387	G	7	7	56086	56092	0 %	0 %	100 %	0 %	115345683
39	NC_008387	T	6	6	56639	56644	0 %	100 %	0 %	0 %	115345684
40	NC_008387	G	7	7	57993	57999	0 %	0 %	100 %	0 %	115345685
41	NC_008387	G	8	8	59180	59187	0 %	0 %	100 %	0 %	115345686
42	NC_008387	T	6	6	59322	59327	0 %	100 %	0 %	0 %	115345686
43	NC_008387	T	6	6	59516	59521	0 %	100 %	0 %	0 %	115345686
44	NC_008387	G	6	6	61437	61442	0 %	0 %	100 %	0 %	115345687
45	NC_008387	G	6	6	63618	63623	0 %	0 %	100 %	0 %	115345688
46	NC_008387	T	6	6	64180	64185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008387	G	6	6	64992	64997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008387	C	6	6	65108	65113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_008387	G	6	6	66106	66111	0 %	0 %	100 %	0 %	115345690
50	NC_008387	G	6	6	66379	66384	0 %	0 %	100 %	0 %	115345690
51	NC_008387	C	6	6	67347	67352	0 %	0 %	0 %	100 %	115345690
52	NC_008387	T	6	6	68435	68440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.