MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008386	CAAAAG	2	12	2993	3004	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115345532
2	NC_008386	GACAAA	2	12	3516	3527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115345534
3	NC_008386	CCAGGG	2	12	7898	7909	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115345537
4	NC_008386	GCTCGC	2	12	10131	10142	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115345539
5	NC_008386	CTGCGC	2	12	13811	13822	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115345543
6	NC_008386	GGCCAA	2	12	17114	17125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345547
7	NC_008386	GATCGA	2	12	21548	21559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115345551
8	NC_008386	TCTGCT	2	12	22727	22738	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	115345552
9	NC_008386	ATGCTG	2	12	23568	23579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115345552
10	NC_008386	GAGATG	2	12	27836	27847	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	115345559
11	NC_008386	TTGGCG	2	12	28077	28088	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115345559
12	NC_008386	GAAGCA	2	12	29250	29261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	115345561
13	NC_008386	CTAGCG	2	12	35188	35199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115345564
14	NC_008386	GGGTTT	2	12	35206	35217	0 %	50 %	50 %	0 %	115345564
15	NC_008386	CAACCA	2	12	35710	35721	50 %	0 %	0 %	50 %	115345565
16	NC_008386	AATCAC	2	12	38289	38300	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	115345568
17	NC_008386	CGCAGC	2	12	39555	39566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115345569
18	NC_008386	CACGCA	2	12	43241	43252	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	115345573
19	NC_008386	TGAGGC	2	12	44371	44382	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115345573
20	NC_008386	CTTGCC	2	12	45824	45835	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	115345573
21	NC_008386	CCTTGA	2	12	56963	56974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115345580
22	NC_008386	GCGGCA	2	12	63637	63648	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115345587
23	NC_008386	GCCAAA	2	12	68822	68833	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	115345591
24	NC_008386	CAGCCT	2	12	72478	72489	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115345597
25	NC_008386	CAAGAA	2	12	75996	76007	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115345601
26	NC_008386	CCTCTC	2	12	78468	78479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345608
27	NC_008386	TGCCGG	2	12	79926	79937	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115345609
28	NC_008386	ACCCAA	2	12	91488	91499	50 %	0 %	0 %	50 %	115345621
29	NC_008386	GAACCG	2	12	101352	101363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345633
30	NC_008386	CACCGG	2	12	105898	105909	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115345635

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.