MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008386	CATC	2	8	51	58	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008386	GTTT	2	8	484	491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008386	GAAA	2	8	5026	5033	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008386	TGGT	2	8	6193	6200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008386	GCTC	2	8	19070	19077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008386	AGCA	2	8	19949	19956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008386	TTCA	2	8	22546	22553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008386	ATGC	2	8	28467	28474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008386	GCGA	2	8	28487	28494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008386	ATCT	2	8	41827	41834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008386	TGCA	2	8	46486	46493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008386	GATT	2	8	46675	46682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008386	CTGC	2	8	49271	49278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008386	GAGG	2	8	51004	51011	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008386	GTCT	2	8	51214	51221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008386	CAAA	2	8	51322	51329	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008386	ATTG	2	8	51813	51820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008386	TCAA	2	8	52590	52597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008386	CGGT	2	8	60950	60957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008386	TTTG	2	8	61193	61200	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008386	CCGG	2	8	62760	62767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008386	TAGG	2	8	62806	62813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008386	ATGA	2	8	63524	63531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008386	AACG	2	8	68298	68305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008386	ACCG	2	8	69025	69032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008386	ATAG	2	8	71634	71641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008386	GACG	2	8	71741	71748	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008386	TGTA	2	8	76537	76544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008386	GGGT	2	8	77492	77499	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008386	GCCA	2	8	78574	78581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008386	CAGA	2	8	78626	78633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008386	CCCA	2	8	78669	78676	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_008386	GTTC	2	8	80867	80874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008386	TCAC	2	8	94914	94921	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008386	TGCC	2	8	95465	95472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008386	GAAT	2	8	96883	96890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008386	GACG	2	8	97306	97313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008386	CCCA	2	8	97359	97366	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_008386	GCTC	2	8	99281	99288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008386	GTCA	2	8	100689	100696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008386	GGCG	2	8	100746	100753	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008386	AAGT	2	8	101087	101094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008386	TCTG	2	8	106227	106234	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.