MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 1407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008386	GAT	2	6	63	68	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008386	TGG	2	6	190	195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008386	GCA	2	6	475	480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008386	GTC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008386	TGC	2	6	840	845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
6	NC_008386	ACG	2	6	868	873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345531
7	NC_008386	GCC	2	6	891	896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345531
8	NC_008386	GGT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345531
9	NC_008386	GCC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345531
10	NC_008386	TTG	2	6	989	994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345531
11	NC_008386	CTG	2	6	1099	1104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
12	NC_008386	TGC	2	6	1218	1223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
13	NC_008386	GCA	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345531
14	NC_008386	GGC	2	6	1279	1284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345531
15	NC_008386	TGC	2	6	1338	1343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
16	NC_008386	CGG	2	6	1532	1537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345531
17	NC_008386	TCG	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
18	NC_008386	GTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345531
19	NC_008386	CAT	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345531
20	NC_008386	TGC	2	6	1890	1895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
21	NC_008386	AGC	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345531
22	NC_008386	GCG	2	6	2058	2063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345531
23	NC_008386	GCA	2	6	2164	2169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
24	NC_008386	TGC	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345532
25	NC_008386	CGA	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
26	NC_008386	GAC	2	6	2342	2347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
27	NC_008386	CAG	2	6	2354	2359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
28	NC_008386	GAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345532
29	NC_008386	TCA	2	6	2410	2415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345532
30	NC_008386	ACA	2	6	2454	2459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345532
31	NC_008386	TGC	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345532
32	NC_008386	CAA	3	9	2561	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345532
33	NC_008386	GGT	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345532
34	NC_008386	GCT	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345532
35	NC_008386	CCG	2	6	2883	2888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345532
36	NC_008386	GCA	3	9	2971	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
37	NC_008386	TCA	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345532
38	NC_008386	CCA	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345532
39	NC_008386	TGT	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345532
40	NC_008386	GAC	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
41	NC_008386	GCG	3	9	3349	3357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345533
42	NC_008386	ATC	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345533
43	NC_008386	TCT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345534
44	NC_008386	CGA	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345534
45	NC_008386	CGA	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345534
46	NC_008386	TGG	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345534
47	NC_008386	CAG	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345534
48	NC_008386	TGG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345534
49	NC_008386	GAT	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345534
50	NC_008386	CCA	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345534
51	NC_008386	TCA	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345534
52	NC_008386	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115345534
53	NC_008386	CGG	2	6	4268	4273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345534
54	NC_008386	CAA	2	6	4563	4568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345534
55	NC_008386	TTG	2	6	4572	4577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345534
56	NC_008386	ACA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345534
57	NC_008386	CGC	2	6	4671	4676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345534
58	NC_008386	GGC	2	6	5118	5123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008386	TCG	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345535
60	NC_008386	AGT	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345535
61	NC_008386	GCA	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345535
62	NC_008386	CGG	3	9	5544	5552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345535
63	NC_008386	TCA	2	6	5717	5722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345535
64	NC_008386	CTT	3	9	5728	5736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345535
65	NC_008386	GCC	2	6	5770	5775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345535
66	NC_008386	TCC	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345535
67	NC_008386	ACC	2	6	5945	5950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345535
68	NC_008386	TCA	2	6	6032	6037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345535
69	NC_008386	CGG	2	6	6039	6044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345535
70	NC_008386	GAT	2	6	6148	6153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345535
71	NC_008386	CAC	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008386	CAT	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008386	CCA	2	6	6334	6339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008386	CTG	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345536
75	NC_008386	TCA	2	6	6458	6463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345536
76	NC_008386	AAC	2	6	6580	6585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345536
77	NC_008386	CAC	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345536
78	NC_008386	CGC	2	6	6763	6768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345536
79	NC_008386	ACC	2	6	6820	6825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345536
80	NC_008386	TGC	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345536
81	NC_008386	TGC	2	6	6968	6973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345536
82	NC_008386	GGC	2	6	7103	7108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345536
83	NC_008386	CCA	2	6	7120	7125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345536
84	NC_008386	GCT	2	6	7163	7168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345536
85	NC_008386	GCA	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345536
86	NC_008386	AAC	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345536
87	NC_008386	CAT	2	6	7599	7604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008386	TGC	2	6	7643	7648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008386	CGG	2	6	7661	7666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008386	CGC	2	6	7775	7780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345537
91	NC_008386	GCC	2	6	7785	7790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345537
92	NC_008386	CGC	2	6	7988	7993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345537
93	NC_008386	GCT	2	6	8034	8039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345537
94	NC_008386	CAG	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
95	NC_008386	GCG	2	6	8111	8116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345537
96	NC_008386	AGC	2	6	8176	8181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
97	NC_008386	GTG	2	6	8191	8196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345537
98	NC_008386	CCG	2	6	8215	8220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345537
99	NC_008386	CAG	2	6	8426	8431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
100	NC_008386	GAT	2	6	8495	8500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345537
101	NC_008386	TTC	2	6	8515	8520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345537
102	NC_008386	GAC	3	9	8637	8645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
103	NC_008386	GCA	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
104	NC_008386	CAA	2	6	8740	8745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345538
105	NC_008386	GAT	2	6	8777	8782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345538
106	NC_008386	GGC	2	6	8784	8789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345538
107	NC_008386	GGT	2	6	8819	8824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345538
108	NC_008386	TCG	2	6	8835	8840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345538
109	NC_008386	CGC	2	6	8998	9003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345538
110	NC_008386	CCG	2	6	9009	9014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345538
111	NC_008386	GAT	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345538
112	NC_008386	TGC	2	6	9271	9276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345538
113	NC_008386	CCG	2	6	9384	9389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345538
114	NC_008386	CGG	2	6	9514	9519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345538
115	NC_008386	TGT	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345538
116	NC_008386	CTC	2	6	9584	9589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345538
117	NC_008386	TGT	2	6	9648	9653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345538
118	NC_008386	TCG	2	6	9760	9765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345538
119	NC_008386	AGC	2	6	9909	9914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345538
120	NC_008386	CAG	2	6	9923	9928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345538
121	NC_008386	CGC	2	6	9943	9948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345538
122	NC_008386	ATC	2	6	10040	10045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345538
123	NC_008386	TCC	2	6	10058	10063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345539
124	NC_008386	GGT	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345539
125	NC_008386	CAC	2	6	10087	10092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345539
126	NC_008386	CGT	2	6	10296	10301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345539
127	NC_008386	GCA	2	6	10388	10393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345539
128	NC_008386	TTC	2	6	10402	10407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345539
129	NC_008386	GCG	2	6	10492	10497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345539
130	NC_008386	TGA	2	6	10650	10655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345539
131	NC_008386	GCC	2	6	10751	10756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345539
132	NC_008386	GCC	2	6	10775	10780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345539
133	NC_008386	CAT	2	6	10804	10809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345539
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135	NC_008386	GCA	2	6	11147	11152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345540
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138	NC_008386	GCA	2	6	11339	11344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345540
139	NC_008386	GCC	2	6	11356	11361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345540
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141	NC_008386	TGC	2	6	11537	11542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008386	TTG	2	6	11573	11578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345541
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147	NC_008386	CGG	2	6	11807	11812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345541
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239	NC_008386	GAC	2	6	18659	18664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_008386	CGG	2	6	18724	18729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_008386	GGT	2	6	18739	18744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_008386	ATC	2	6	18945	18950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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245	NC_008386	ATG	2	6	19011	19016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
246	NC_008386	TGA	2	6	19028	19033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_008386	TGG	2	6	19144	19149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_008386	ATA	2	6	19365	19370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_008386	CAG	3	9	19403	19411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_008386	TCT	2	6	19439	19444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_008386	GGA	2	6	19462	19467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_008386	AAT	2	6	19492	19497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_008386	ACC	2	6	19538	19543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_008386	CGT	2	6	19689	19694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_008386	AAC	2	6	19939	19944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_008386	GCA	2	6	19958	19963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345550
258	NC_008386	CTG	2	6	20141	20146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345550
259	NC_008386	GGT	2	6	20311	20316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345550
260	NC_008386	GGC	2	6	20431	20436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345550
261	NC_008386	ATT	2	6	20832	20837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345550
262	NC_008386	CGT	2	6	20850	20855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345550
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264	NC_008386	CTT	2	6	20932	20937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345550
265	NC_008386	TGC	2	6	20942	20947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345550
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284	NC_008386	GCT	2	6	22620	22625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345552
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287	NC_008386	GGC	2	6	22985	22990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345552
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289	NC_008386	GCG	2	6	23078	23083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345552
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301	NC_008386	GCC	2	6	23914	23919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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313	NC_008386	CGG	2	6	24733	24738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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375	NC_008386	TCA	2	6	29458	29463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345562
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