MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008386	TG	3	6	830	835	0 %	50 %	50 %	0 %	115345531
2	NC_008386	CT	3	6	1127	1132	0 %	50 %	0 %	50 %	115345531
3	NC_008386	GC	3	6	1246	1251	0 %	0 %	50 %	50 %	115345531
4	NC_008386	GC	3	6	1992	1997	0 %	0 %	50 %	50 %	115345531
5	NC_008386	CG	3	6	2303	2308	0 %	0 %	50 %	50 %	115345532
6	NC_008386	GC	3	6	3484	3489	0 %	0 %	50 %	50 %	115345534
7	NC_008386	CG	3	6	3952	3957	0 %	0 %	50 %	50 %	115345534
8	NC_008386	GC	3	6	4416	4421	0 %	0 %	50 %	50 %	115345534
9	NC_008386	CG	3	6	6066	6071	0 %	0 %	50 %	50 %	115345535
10	NC_008386	CG	3	6	6424	6429	0 %	0 %	50 %	50 %	115345536
11	NC_008386	GC	3	6	6734	6739	0 %	0 %	50 %	50 %	115345536
12	NC_008386	CG	3	6	7541	7546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008386	CG	3	6	8183	8188	0 %	0 %	50 %	50 %	115345537
14	NC_008386	CG	4	8	9441	9448	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
15	NC_008386	GC	4	8	9522	9529	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
16	NC_008386	GC	3	6	9888	9893	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
17	NC_008386	CG	3	6	10018	10023	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
18	NC_008386	CG	3	6	10198	10203	0 %	0 %	50 %	50 %	115345539
19	NC_008386	AT	3	6	10303	10308	50 %	50 %	0 %	0 %	115345539
20	NC_008386	CG	3	6	10373	10378	0 %	0 %	50 %	50 %	115345539
21	NC_008386	GC	5	10	10465	10474	0 %	0 %	50 %	50 %	115345539
22	NC_008386	GC	3	6	11390	11395	0 %	0 %	50 %	50 %	115345540
23	NC_008386	GC	3	6	11779	11784	0 %	0 %	50 %	50 %	115345541
24	NC_008386	CG	5	10	11862	11871	0 %	0 %	50 %	50 %	115345541
25	NC_008386	AG	3	6	12093	12098	50 %	0 %	50 %	0 %	115345541
26	NC_008386	GC	3	6	13148	13153	0 %	0 %	50 %	50 %	115345542
27	NC_008386	CG	3	6	13315	13320	0 %	0 %	50 %	50 %	115345543
28	NC_008386	GC	3	6	15152	15157	0 %	0 %	50 %	50 %	115345544
29	NC_008386	CG	4	8	15275	15282	0 %	0 %	50 %	50 %	115345544
30	NC_008386	CG	3	6	15783	15788	0 %	0 %	50 %	50 %	115345544
31	NC_008386	GC	3	6	16488	16493	0 %	0 %	50 %	50 %	115345545
32	NC_008386	GC	3	6	16506	16511	0 %	0 %	50 %	50 %	115345545
33	NC_008386	CG	3	6	17141	17146	0 %	0 %	50 %	50 %	115345547
34	NC_008386	GC	3	6	17257	17262	0 %	0 %	50 %	50 %	115345547
35	NC_008386	CG	3	6	17813	17818	0 %	0 %	50 %	50 %	115345548
36	NC_008386	GA	3	6	19609	19614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008386	AT	3	6	19879	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008386	GC	4	8	20087	20094	0 %	0 %	50 %	50 %	115345550
39	NC_008386	AG	3	6	21319	21324	50 %	0 %	50 %	0 %	115345551
40	NC_008386	GA	3	6	21508	21513	50 %	0 %	50 %	0 %	115345551
41	NC_008386	GC	3	6	22198	22203	0 %	0 %	50 %	50 %	115345551
42	NC_008386	GC	3	6	22246	22251	0 %	0 %	50 %	50 %	115345551
43	NC_008386	GC	3	6	22365	22370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008386	GC	3	6	23244	23249	0 %	0 %	50 %	50 %	115345552
45	NC_008386	TC	3	6	23303	23308	0 %	50 %	0 %	50 %	115345552
46	NC_008386	CG	3	6	23603	23608	0 %	0 %	50 %	50 %	115345552
47	NC_008386	GA	3	6	23874	23879	50 %	0 %	50 %	0 %	115345552
48	NC_008386	AT	3	6	23927	23932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008386	CG	3	6	25349	25354	0 %	0 %	50 %	50 %	115345557
50	NC_008386	GA	3	6	26165	26170	50 %	0 %	50 %	0 %	115345557
51	NC_008386	GC	3	6	26209	26214	0 %	0 %	50 %	50 %	115345557
52	NC_008386	CT	3	6	26541	26546	0 %	50 %	0 %	50 %	115345558
53	NC_008386	GC	3	6	27002	27007	0 %	0 %	50 %	50 %	115345558
54	NC_008386	GC	3	6	27272	27277	0 %	0 %	50 %	50 %	115345558
55	NC_008386	CG	4	8	27428	27435	0 %	0 %	50 %	50 %	115345558
56	NC_008386	CG	3	6	27654	27659	0 %	0 %	50 %	50 %	115345559
57	NC_008386	GC	3	6	27993	27998	0 %	0 %	50 %	50 %	115345559
58	NC_008386	GT	3	6	29429	29434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008386	GA	4	8	29735	29742	50 %	0 %	50 %	0 %	115345562
60	NC_008386	CG	3	6	29877	29882	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
61	NC_008386	GC	3	6	30446	30451	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
62	NC_008386	GA	3	6	31514	31519	50 %	0 %	50 %	0 %	115345562
63	NC_008386	CG	3	6	31543	31548	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
64	NC_008386	GC	3	6	32303	32308	0 %	0 %	50 %	50 %	115345563
65	NC_008386	TG	3	6	32656	32661	0 %	50 %	50 %	0 %	115345563
66	NC_008386	GC	4	8	33373	33380	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
67	NC_008386	TC	3	6	33470	33475	0 %	50 %	0 %	50 %	115345564
68	NC_008386	CG	4	8	33638	33645	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
69	NC_008386	CG	3	6	33723	33728	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
70	NC_008386	TG	3	6	34297	34302	0 %	50 %	50 %	0 %	115345564
71	NC_008386	AG	3	6	34366	34371	50 %	0 %	50 %	0 %	115345564
72	NC_008386	CG	3	6	35001	35006	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
73	NC_008386	CG	3	6	35552	35557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008386	GC	3	6	36107	36112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008386	TC	3	6	37585	37590	0 %	50 %	0 %	50 %	115345567
76	NC_008386	TC	3	6	38405	38410	0 %	50 %	0 %	50 %	115345568
77	NC_008386	TC	3	6	38962	38967	0 %	50 %	0 %	50 %	115345568
78	NC_008386	AC	3	6	39530	39535	50 %	0 %	0 %	50 %	115345569
79	NC_008386	CG	3	6	39713	39718	0 %	0 %	50 %	50 %	115345569
80	NC_008386	GC	3	6	39748	39753	0 %	0 %	50 %	50 %	115345569
81	NC_008386	GC	3	6	41344	41349	0 %	0 %	50 %	50 %	115345571
82	NC_008386	CG	3	6	41732	41737	0 %	0 %	50 %	50 %	115345571
83	NC_008386	GA	3	6	42289	42294	50 %	0 %	50 %	0 %	115345572
84	NC_008386	GC	3	6	42378	42383	0 %	0 %	50 %	50 %	115345572
85	NC_008386	GA	3	6	42859	42864	50 %	0 %	50 %	0 %	115345572
86	NC_008386	GC	3	6	43330	43335	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
87	NC_008386	GC	3	6	44326	44331	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
88	NC_008386	GC	3	6	44503	44508	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
89	NC_008386	GC	5	10	44920	44929	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
90	NC_008386	CG	3	6	44963	44968	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
91	NC_008386	TC	3	6	45841	45846	0 %	50 %	0 %	50 %	115345573
92	NC_008386	GA	3	6	46642	46647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008386	AT	3	6	47030	47035	50 %	50 %	0 %	0 %	115345575
94	NC_008386	AT	3	6	47471	47476	50 %	50 %	0 %	0 %	115345575
95	NC_008386	TA	3	6	48074	48079	50 %	50 %	0 %	0 %	115345576
96	NC_008386	CT	3	6	48443	48448	0 %	50 %	0 %	50 %	115345576
97	NC_008386	CG	3	6	48906	48911	0 %	0 %	50 %	50 %	115345576
98	NC_008386	GT	3	6	49247	49252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008386	GC	3	6	49802	49807	0 %	0 %	50 %	50 %	115345577
100	NC_008386	GC	3	6	49939	49944	0 %	0 %	50 %	50 %	115345577
101	NC_008386	CG	3	6	51242	51247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008386	AT	3	6	51786	51791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008386	CG	3	6	51805	51810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008386	GC	3	6	52654	52659	0 %	0 %	50 %	50 %	115345580
105	NC_008386	AT	4	8	52663	52670	50 %	50 %	0 %	0 %	115345580
106	NC_008386	TC	3	6	53805	53810	0 %	50 %	0 %	50 %	115345580
107	NC_008386	AC	3	6	54946	54951	50 %	0 %	0 %	50 %	115345580
108	NC_008386	CG	3	6	54987	54992	0 %	0 %	50 %	50 %	115345580
109	NC_008386	CG	3	6	56468	56473	0 %	0 %	50 %	50 %	115345580
110	NC_008386	AC	3	6	56527	56532	50 %	0 %	0 %	50 %	115345580
111	NC_008386	AT	3	6	58205	58210	50 %	50 %	0 %	0 %	115345580
112	NC_008386	TC	3	6	60117	60122	0 %	50 %	0 %	50 %	115345580
113	NC_008386	CA	3	6	61127	61132	50 %	0 %	0 %	50 %	115345583
114	NC_008386	GC	3	6	61588	61593	0 %	0 %	50 %	50 %	115345584
115	NC_008386	CG	3	6	61633	61638	0 %	0 %	50 %	50 %	115345584
116	NC_008386	GC	3	6	63274	63279	0 %	0 %	50 %	50 %	115345586
117	NC_008386	GC	3	6	63328	63333	0 %	0 %	50 %	50 %	115345586
118	NC_008386	CT	3	6	63623	63628	0 %	50 %	0 %	50 %	115345587
119	NC_008386	CG	3	6	63654	63659	0 %	0 %	50 %	50 %	115345587
120	NC_008386	GC	3	6	63771	63776	0 %	0 %	50 %	50 %	115345587
121	NC_008386	GT	3	6	63843	63848	0 %	50 %	50 %	0 %	115345587
122	NC_008386	CT	3	6	63895	63900	0 %	50 %	0 %	50 %	115345587
123	NC_008386	GC	4	8	65843	65850	0 %	0 %	50 %	50 %	115345588
124	NC_008386	CA	3	6	67063	67068	50 %	0 %	0 %	50 %	115345589
125	NC_008386	TA	4	8	67352	67359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008386	CG	3	6	67646	67651	0 %	0 %	50 %	50 %	115345590
127	NC_008386	GT	3	6	67890	67895	0 %	50 %	50 %	0 %	115345590
128	NC_008386	CG	4	8	68428	68435	0 %	0 %	50 %	50 %	115345591
129	NC_008386	GC	3	6	68549	68554	0 %	0 %	50 %	50 %	115345591
130	NC_008386	AC	3	6	68598	68603	50 %	0 %	0 %	50 %	115345591
131	NC_008386	CA	3	6	68800	68805	50 %	0 %	0 %	50 %	115345591
132	NC_008386	GC	3	6	68879	68884	0 %	0 %	50 %	50 %	115345591
133	NC_008386	CG	3	6	68948	68953	0 %	0 %	50 %	50 %	115345591
134	NC_008386	TC	3	6	69131	69136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008386	CG	3	6	69552	69557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008386	GA	3	6	69575	69580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008386	CA	3	6	69695	69700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008386	GC	4	8	70138	70145	0 %	0 %	50 %	50 %	115345593
139	NC_008386	AC	3	6	70879	70884	50 %	0 %	0 %	50 %	115345595
140	NC_008386	CT	3	6	71403	71408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008386	CG	4	8	71618	71625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008386	GC	3	6	72125	72130	0 %	0 %	50 %	50 %	115345596
143	NC_008386	GC	3	6	72634	72639	0 %	0 %	50 %	50 %	115345597
144	NC_008386	CG	3	6	73100	73105	0 %	0 %	50 %	50 %	115345597
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.