MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008386	CG	3	6	7541	7546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008386	GA	3	6	19609	19614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008386	AT	3	6	19879	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008386	GC	3	6	22365	22370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008386	AT	3	6	23927	23932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008386	GT	3	6	29429	29434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008386	CG	3	6	35552	35557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008386	GC	3	6	36107	36112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008386	GA	3	6	46642	46647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008386	GT	3	6	49247	49252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008386	CG	3	6	51242	51247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008386	AT	3	6	51786	51791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008386	CG	3	6	51805	51810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008386	TA	4	8	67352	67359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008386	TC	3	6	69131	69136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008386	CG	3	6	69552	69557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008386	GA	3	6	69575	69580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008386	CA	3	6	69695	69700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008386	CT	3	6	71403	71408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008386	CG	4	8	71618	71625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008386	GC	3	6	77514	77519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008386	TG	3	6	78778	78783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008386	TC	3	6	78908	78913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008386	CG	3	6	80556	80561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008386	TG	3	6	80604	80609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008386	GC	4	8	80798	80805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008386	GC	3	6	80878	80883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008386	GA	4	8	81133	81140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008386	CT	3	6	95528	95533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008386	AG	3	6	96634	96639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008386	AC	4	8	96819	96826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008386	CG	4	8	97183	97190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008386	CG	3	6	98880	98885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008386	AT	4	8	99130	99137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008386	AC	3	6	101011	101016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008386	CG	3	6	101027	101032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008386	AT	3	6	101106	101111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008386	GC	3	6	101713	101718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.