MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008386	TG	3	6	830	835	0 %	50 %	50 %	0 %	115345531
2	NC_008386	CT	3	6	1127	1132	0 %	50 %	0 %	50 %	115345531
3	NC_008386	GC	3	6	1246	1251	0 %	0 %	50 %	50 %	115345531
4	NC_008386	GC	3	6	1992	1997	0 %	0 %	50 %	50 %	115345531
5	NC_008386	CG	3	6	2303	2308	0 %	0 %	50 %	50 %	115345532
6	NC_008386	GC	3	6	3484	3489	0 %	0 %	50 %	50 %	115345534
7	NC_008386	CG	3	6	3952	3957	0 %	0 %	50 %	50 %	115345534
8	NC_008386	GC	3	6	4416	4421	0 %	0 %	50 %	50 %	115345534
9	NC_008386	CG	3	6	6066	6071	0 %	0 %	50 %	50 %	115345535
10	NC_008386	CG	3	6	6424	6429	0 %	0 %	50 %	50 %	115345536
11	NC_008386	GC	3	6	6734	6739	0 %	0 %	50 %	50 %	115345536
12	NC_008386	CG	3	6	8183	8188	0 %	0 %	50 %	50 %	115345537
13	NC_008386	CG	4	8	9441	9448	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
14	NC_008386	GC	4	8	9522	9529	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
15	NC_008386	GC	3	6	9888	9893	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
16	NC_008386	CG	3	6	10018	10023	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
17	NC_008386	CG	3	6	10198	10203	0 %	0 %	50 %	50 %	115345539
18	NC_008386	AT	3	6	10303	10308	50 %	50 %	0 %	0 %	115345539
19	NC_008386	CG	3	6	10373	10378	0 %	0 %	50 %	50 %	115345539
20	NC_008386	GC	5	10	10465	10474	0 %	0 %	50 %	50 %	115345539
21	NC_008386	GC	3	6	11390	11395	0 %	0 %	50 %	50 %	115345540
22	NC_008386	GC	3	6	11779	11784	0 %	0 %	50 %	50 %	115345541
23	NC_008386	CG	5	10	11862	11871	0 %	0 %	50 %	50 %	115345541
24	NC_008386	AG	3	6	12093	12098	50 %	0 %	50 %	0 %	115345541
25	NC_008386	GC	3	6	13148	13153	0 %	0 %	50 %	50 %	115345542
26	NC_008386	CG	3	6	13315	13320	0 %	0 %	50 %	50 %	115345543
27	NC_008386	GC	3	6	15152	15157	0 %	0 %	50 %	50 %	115345544
28	NC_008386	CG	4	8	15275	15282	0 %	0 %	50 %	50 %	115345544
29	NC_008386	CG	3	6	15783	15788	0 %	0 %	50 %	50 %	115345544
30	NC_008386	GC	3	6	16488	16493	0 %	0 %	50 %	50 %	115345545
31	NC_008386	GC	3	6	16506	16511	0 %	0 %	50 %	50 %	115345545
32	NC_008386	CG	3	6	17141	17146	0 %	0 %	50 %	50 %	115345547
33	NC_008386	GC	3	6	17257	17262	0 %	0 %	50 %	50 %	115345547
34	NC_008386	CG	3	6	17813	17818	0 %	0 %	50 %	50 %	115345548
35	NC_008386	GC	4	8	20087	20094	0 %	0 %	50 %	50 %	115345550
36	NC_008386	AG	3	6	21319	21324	50 %	0 %	50 %	0 %	115345551
37	NC_008386	GA	3	6	21508	21513	50 %	0 %	50 %	0 %	115345551
38	NC_008386	GC	3	6	22198	22203	0 %	0 %	50 %	50 %	115345551
39	NC_008386	GC	3	6	22246	22251	0 %	0 %	50 %	50 %	115345551
40	NC_008386	GC	3	6	23244	23249	0 %	0 %	50 %	50 %	115345552
41	NC_008386	TC	3	6	23303	23308	0 %	50 %	0 %	50 %	115345552
42	NC_008386	CG	3	6	23603	23608	0 %	0 %	50 %	50 %	115345552
43	NC_008386	GA	3	6	23874	23879	50 %	0 %	50 %	0 %	115345552
44	NC_008386	CG	3	6	25349	25354	0 %	0 %	50 %	50 %	115345557
45	NC_008386	GA	3	6	26165	26170	50 %	0 %	50 %	0 %	115345557
46	NC_008386	GC	3	6	26209	26214	0 %	0 %	50 %	50 %	115345557
47	NC_008386	CT	3	6	26541	26546	0 %	50 %	0 %	50 %	115345558
48	NC_008386	GC	3	6	27002	27007	0 %	0 %	50 %	50 %	115345558
49	NC_008386	GC	3	6	27272	27277	0 %	0 %	50 %	50 %	115345558
50	NC_008386	CG	4	8	27428	27435	0 %	0 %	50 %	50 %	115345558
51	NC_008386	CG	3	6	27654	27659	0 %	0 %	50 %	50 %	115345559
52	NC_008386	GC	3	6	27993	27998	0 %	0 %	50 %	50 %	115345559
53	NC_008386	GA	4	8	29735	29742	50 %	0 %	50 %	0 %	115345562
54	NC_008386	CG	3	6	29877	29882	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
55	NC_008386	GC	3	6	30446	30451	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
56	NC_008386	GA	3	6	31514	31519	50 %	0 %	50 %	0 %	115345562
57	NC_008386	CG	3	6	31543	31548	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
58	NC_008386	GC	3	6	32303	32308	0 %	0 %	50 %	50 %	115345563
59	NC_008386	TG	3	6	32656	32661	0 %	50 %	50 %	0 %	115345563
60	NC_008386	GC	4	8	33373	33380	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
61	NC_008386	TC	3	6	33470	33475	0 %	50 %	0 %	50 %	115345564
62	NC_008386	CG	4	8	33638	33645	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
63	NC_008386	CG	3	6	33723	33728	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
64	NC_008386	TG	3	6	34297	34302	0 %	50 %	50 %	0 %	115345564
65	NC_008386	AG	3	6	34366	34371	50 %	0 %	50 %	0 %	115345564
66	NC_008386	CG	3	6	35001	35006	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
67	NC_008386	TC	3	6	37585	37590	0 %	50 %	0 %	50 %	115345567
68	NC_008386	TC	3	6	38405	38410	0 %	50 %	0 %	50 %	115345568
69	NC_008386	TC	3	6	38962	38967	0 %	50 %	0 %	50 %	115345568
70	NC_008386	AC	3	6	39530	39535	50 %	0 %	0 %	50 %	115345569
71	NC_008386	CG	3	6	39713	39718	0 %	0 %	50 %	50 %	115345569
72	NC_008386	GC	3	6	39748	39753	0 %	0 %	50 %	50 %	115345569
73	NC_008386	GC	3	6	41344	41349	0 %	0 %	50 %	50 %	115345571
74	NC_008386	CG	3	6	41732	41737	0 %	0 %	50 %	50 %	115345571
75	NC_008386	GA	3	6	42289	42294	50 %	0 %	50 %	0 %	115345572
76	NC_008386	GC	3	6	42378	42383	0 %	0 %	50 %	50 %	115345572
77	NC_008386	GA	3	6	42859	42864	50 %	0 %	50 %	0 %	115345572
78	NC_008386	GC	3	6	43330	43335	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
79	NC_008386	GC	3	6	44326	44331	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
80	NC_008386	GC	3	6	44503	44508	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
81	NC_008386	GC	5	10	44920	44929	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
82	NC_008386	CG	3	6	44963	44968	0 %	0 %	50 %	50 %	115345573
83	NC_008386	TC	3	6	45841	45846	0 %	50 %	0 %	50 %	115345573
84	NC_008386	AT	3	6	47030	47035	50 %	50 %	0 %	0 %	115345575
85	NC_008386	AT	3	6	47471	47476	50 %	50 %	0 %	0 %	115345575
86	NC_008386	TA	3	6	48074	48079	50 %	50 %	0 %	0 %	115345576
87	NC_008386	CT	3	6	48443	48448	0 %	50 %	0 %	50 %	115345576
88	NC_008386	CG	3	6	48906	48911	0 %	0 %	50 %	50 %	115345576
89	NC_008386	GC	3	6	49802	49807	0 %	0 %	50 %	50 %	115345577
90	NC_008386	GC	3	6	49939	49944	0 %	0 %	50 %	50 %	115345577
91	NC_008386	GC	3	6	52654	52659	0 %	0 %	50 %	50 %	115345580
92	NC_008386	AT	4	8	52663	52670	50 %	50 %	0 %	0 %	115345580
93	NC_008386	TC	3	6	53805	53810	0 %	50 %	0 %	50 %	115345580
94	NC_008386	AC	3	6	54946	54951	50 %	0 %	0 %	50 %	115345580
95	NC_008386	CG	3	6	54987	54992	0 %	0 %	50 %	50 %	115345580
96	NC_008386	CG	3	6	56468	56473	0 %	0 %	50 %	50 %	115345580
97	NC_008386	AC	3	6	56527	56532	50 %	0 %	0 %	50 %	115345580
98	NC_008386	AT	3	6	58205	58210	50 %	50 %	0 %	0 %	115345580
99	NC_008386	TC	3	6	60117	60122	0 %	50 %	0 %	50 %	115345580
100	NC_008386	CA	3	6	61127	61132	50 %	0 %	0 %	50 %	115345583
101	NC_008386	GC	3	6	61588	61593	0 %	0 %	50 %	50 %	115345584
102	NC_008386	CG	3	6	61633	61638	0 %	0 %	50 %	50 %	115345584
103	NC_008386	GC	3	6	63274	63279	0 %	0 %	50 %	50 %	115345586
104	NC_008386	GC	3	6	63328	63333	0 %	0 %	50 %	50 %	115345586
105	NC_008386	CT	3	6	63623	63628	0 %	50 %	0 %	50 %	115345587
106	NC_008386	CG	3	6	63654	63659	0 %	0 %	50 %	50 %	115345587
107	NC_008386	GC	3	6	63771	63776	0 %	0 %	50 %	50 %	115345587
108	NC_008386	GT	3	6	63843	63848	0 %	50 %	50 %	0 %	115345587
109	NC_008386	CT	3	6	63895	63900	0 %	50 %	0 %	50 %	115345587
110	NC_008386	GC	4	8	65843	65850	0 %	0 %	50 %	50 %	115345588
111	NC_008386	CA	3	6	67063	67068	50 %	0 %	0 %	50 %	115345589
112	NC_008386	CG	3	6	67646	67651	0 %	0 %	50 %	50 %	115345590
113	NC_008386	GT	3	6	67890	67895	0 %	50 %	50 %	0 %	115345590
114	NC_008386	CG	4	8	68428	68435	0 %	0 %	50 %	50 %	115345591
115	NC_008386	GC	3	6	68549	68554	0 %	0 %	50 %	50 %	115345591
116	NC_008386	AC	3	6	68598	68603	50 %	0 %	0 %	50 %	115345591
117	NC_008386	CA	3	6	68800	68805	50 %	0 %	0 %	50 %	115345591
118	NC_008386	GC	3	6	68879	68884	0 %	0 %	50 %	50 %	115345591
119	NC_008386	CG	3	6	68948	68953	0 %	0 %	50 %	50 %	115345591
120	NC_008386	GC	4	8	70138	70145	0 %	0 %	50 %	50 %	115345593
121	NC_008386	AC	3	6	70879	70884	50 %	0 %	0 %	50 %	115345595
122	NC_008386	GC	3	6	72125	72130	0 %	0 %	50 %	50 %	115345596
123	NC_008386	GC	3	6	72634	72639	0 %	0 %	50 %	50 %	115345597
124	NC_008386	CG	3	6	73100	73105	0 %	0 %	50 %	50 %	115345597
125	NC_008386	CG	3	6	74501	74506	0 %	0 %	50 %	50 %	115345598
126	NC_008386	GC	3	6	74635	74640	0 %	0 %	50 %	50 %	115345598
127	NC_008386	GC	3	6	74786	74791	0 %	0 %	50 %	50 %	115345599
128	NC_008386	CT	4	8	74803	74810	0 %	50 %	0 %	50 %	115345599
129	NC_008386	GC	3	6	75444	75449	0 %	0 %	50 %	50 %	115345599
130	NC_008386	CG	3	6	75528	75533	0 %	0 %	50 %	50 %	115345599
131	NC_008386	CG	3	6	75807	75812	0 %	0 %	50 %	50 %	115345600
132	NC_008386	CG	3	6	76056	76061	0 %	0 %	50 %	50 %	115345601
133	NC_008386	GC	3	6	77884	77889	0 %	0 %	50 %	50 %	115345607
134	NC_008386	GC	3	6	77910	77915	0 %	0 %	50 %	50 %	115345607
135	NC_008386	TC	3	6	79409	79414	0 %	50 %	0 %	50 %	115345609
136	NC_008386	TC	3	6	79688	79693	0 %	50 %	0 %	50 %	115345609
137	NC_008386	GA	3	6	79890	79895	50 %	0 %	50 %	0 %	115345609
138	NC_008386	GC	3	6	80436	80441	0 %	0 %	50 %	50 %	115345609
139	NC_008386	GC	4	8	81484	81491	0 %	0 %	50 %	50 %	115345610
140	NC_008386	CG	3	6	81859	81864	0 %	0 %	50 %	50 %	115345610
141	NC_008386	CG	3	6	82613	82618	0 %	0 %	50 %	50 %	115345611
142	NC_008386	GC	4	8	82823	82830	0 %	0 %	50 %	50 %	115345611
143	NC_008386	CG	3	6	83204	83209	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
144	NC_008386	AG	3	6	83285	83290	50 %	0 %	50 %	0 %	115345612
145	NC_008386	TG	3	6	83320	83325	0 %	50 %	50 %	0 %	115345612
146	NC_008386	GC	3	6	83467	83472	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
147	NC_008386	CG	3	6	83530	83535	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
148	NC_008386	CG	3	6	83693	83698	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
149	NC_008386	AC	3	6	84451	84456	50 %	0 %	0 %	50 %	115345612
150	NC_008386	GC	3	6	84516	84521	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
151	NC_008386	TG	3	6	84758	84763	0 %	50 %	50 %	0 %	115345612
152	NC_008386	GC	3	6	85111	85116	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
153	NC_008386	GC	3	6	85345	85350	0 %	0 %	50 %	50 %	115345613
154	NC_008386	CG	3	6	85787	85792	0 %	0 %	50 %	50 %	115345614
155	NC_008386	GC	3	6	86287	86292	0 %	0 %	50 %	50 %	115345614
156	NC_008386	CG	3	6	86575	86580	0 %	0 %	50 %	50 %	115345614
157	NC_008386	GC	3	6	87380	87385	0 %	0 %	50 %	50 %	115345615
158	NC_008386	CG	3	6	87423	87428	0 %	0 %	50 %	50 %	115345615
159	NC_008386	GT	4	8	88181	88188	0 %	50 %	50 %	0 %	115345616
160	NC_008386	GC	3	6	88341	88346	0 %	0 %	50 %	50 %	115345617
161	NC_008386	CG	3	6	88710	88715	0 %	0 %	50 %	50 %	115345617
162	NC_008386	CG	3	6	88866	88871	0 %	0 %	50 %	50 %	115345618
163	NC_008386	GC	3	6	88981	88986	0 %	0 %	50 %	50 %	115345618
164	NC_008386	GC	3	6	89368	89373	0 %	0 %	50 %	50 %	115345618
165	NC_008386	GC	3	6	89462	89467	0 %	0 %	50 %	50 %	115345618
166	NC_008386	GC	4	8	89554	89561	0 %	0 %	50 %	50 %	115345618
167	NC_008386	CG	3	6	89582	89587	0 %	0 %	50 %	50 %	115345618
168	NC_008386	GC	3	6	90260	90265	0 %	0 %	50 %	50 %	115345619
169	NC_008386	TG	3	6	91189	91194	0 %	50 %	50 %	0 %	115345621
170	NC_008386	GC	3	6	91444	91449	0 %	0 %	50 %	50 %	115345621
171	NC_008386	GC	4	8	92262	92269	0 %	0 %	50 %	50 %	115345622
172	NC_008386	CG	3	6	92513	92518	0 %	0 %	50 %	50 %	115345622
173	NC_008386	GC	3	6	92905	92910	0 %	0 %	50 %	50 %	115345623
174	NC_008386	AC	3	6	93102	93107	50 %	0 %	0 %	50 %	115345623
175	NC_008386	GC	3	6	93985	93990	0 %	0 %	50 %	50 %	115345624
176	NC_008386	CT	3	6	94175	94180	0 %	50 %	0 %	50 %	115345624
177	NC_008386	CT	3	6	94279	94284	0 %	50 %	0 %	50 %	115345624
178	NC_008386	GT	4	8	94377	94384	0 %	50 %	50 %	0 %	115345624
179	NC_008386	GC	3	6	97590	97595	0 %	0 %	50 %	50 %	115345627
180	NC_008386	GC	3	6	98320	98325	0 %	0 %	50 %	50 %	115345628
181	NC_008386	GC	4	8	98512	98519	0 %	0 %	50 %	50 %	115345628
182	NC_008386	CG	3	6	98736	98741	0 %	0 %	50 %	50 %	115345628
183	NC_008386	CG	3	6	99035	99040	0 %	0 %	50 %	50 %	115345629
184	NC_008386	CG	3	6	99789	99794	0 %	0 %	50 %	50 %	115345630
185	NC_008386	CG	3	6	101379	101384	0 %	0 %	50 %	50 %	115345633
186	NC_008386	GC	3	6	102599	102604	0 %	0 %	50 %	50 %	115345634
187	NC_008386	CG	3	6	102620	102625	0 %	0 %	50 %	50 %	115345634
188	NC_008386	CG	4	8	103053	103060	0 %	0 %	50 %	50 %	115345634
189	NC_008386	GT	3	6	103279	103284	0 %	50 %	50 %	0 %	115345634
190	NC_008386	GA	3	6	103412	103417	50 %	0 %	50 %	0 %	115345634
191	NC_008386	GC	3	6	103518	103523	0 %	0 %	50 %	50 %	115345634
192	NC_008386	CT	3	6	103617	103622	0 %	50 %	0 %	50 %	115345634
193	NC_008386	GC	3	6	103637	103642	0 %	0 %	50 %	50 %	115345634
194	NC_008386	GC	3	6	104676	104681	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
195	NC_008386	AG	3	6	104745	104750	50 %	0 %	50 %	0 %	115345635
196	NC_008386	CG	4	8	105394	105401	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
197	NC_008386	GC	3	6	105423	105428	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
198	NC_008386	GC	3	6	105959	105964	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
199	NC_008386	GC	3	6	106101	106106	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.