MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008386	A	6	6	2144	2149	100 %	0 %	0 %	0 %	115345532
2	NC_008386	C	6	6	3020	3025	0 %	0 %	0 %	100 %	115345532
3	NC_008386	A	6	6	3068	3073	100 %	0 %	0 %	0 %	115345532
4	NC_008386	A	6	6	3239	3244	100 %	0 %	0 %	0 %	115345532
5	NC_008386	A	6	6	4047	4052	100 %	0 %	0 %	0 %	115345534
6	NC_008386	C	6	6	4300	4305	0 %	0 %	0 %	100 %	115345534
7	NC_008386	A	6	6	10280	10285	100 %	0 %	0 %	0 %	115345539
8	NC_008386	A	6	6	11433	11438	100 %	0 %	0 %	0 %	115345540
9	NC_008386	C	6	6	12518	12523	0 %	0 %	0 %	100 %	115345541
10	NC_008386	G	6	6	12849	12854	0 %	0 %	100 %	0 %	115345542
11	NC_008386	A	6	6	17578	17583	100 %	0 %	0 %	0 %	115345547
12	NC_008386	T	7	7	19589	19595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008386	A	6	6	20658	20663	100 %	0 %	0 %	0 %	115345550
14	NC_008386	C	6	6	28292	28297	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_008386	A	6	6	28566	28571	100 %	0 %	0 %	0 %	115345560
16	NC_008386	T	7	7	29488	29494	0 %	100 %	0 %	0 %	115345562
17	NC_008386	T	6	6	29505	29510	0 %	100 %	0 %	0 %	115345562
18	NC_008386	A	6	6	35635	35640	100 %	0 %	0 %	0 %	115345565
19	NC_008386	A	6	6	36187	36192	100 %	0 %	0 %	0 %	115345566
20	NC_008386	T	7	7	38219	38225	0 %	100 %	0 %	0 %	115345568
21	NC_008386	T	6	6	39498	39503	0 %	100 %	0 %	0 %	115345569
22	NC_008386	T	7	7	40368	40374	0 %	100 %	0 %	0 %	115345569
23	NC_008386	T	6	6	46460	46465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008386	A	7	7	51622	51628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008386	T	7	7	51694	51700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008386	A	7	7	52697	52703	100 %	0 %	0 %	0 %	115345580
27	NC_008386	T	6	6	53934	53939	0 %	100 %	0 %	0 %	115345580
28	NC_008386	T	6	6	54772	54777	0 %	100 %	0 %	0 %	115345580
29	NC_008386	G	6	6	55611	55616	0 %	0 %	100 %	0 %	115345580
30	NC_008386	T	6	6	60502	60507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008386	C	7	7	63446	63452	0 %	0 %	0 %	100 %	115345586
32	NC_008386	T	6	6	65386	65391	0 %	100 %	0 %	0 %	115345588
33	NC_008386	C	6	6	66086	66091	0 %	0 %	0 %	100 %	115345588
34	NC_008386	A	7	7	71156	71162	100 %	0 %	0 %	0 %	115345595
35	NC_008386	T	6	6	75844	75849	0 %	100 %	0 %	0 %	115345600
36	NC_008386	T	6	6	76510	76515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008386	T	6	6	77416	77421	0 %	100 %	0 %	0 %	115345605
38	NC_008386	C	6	6	77524	77529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_008386	A	7	7	79123	79129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008386	T	6	6	79313	79318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008386	T	6	6	81304	81309	0 %	100 %	0 %	0 %	115345610
42	NC_008386	T	7	7	82249	82255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008386	T	6	6	88760	88765	0 %	100 %	0 %	0 %	115345618
44	NC_008386	G	6	6	90052	90057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008386	G	6	6	90073	90078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008386	A	6	6	91198	91203	100 %	0 %	0 %	0 %	115345621
47	NC_008386	C	6	6	92095	92100	0 %	0 %	0 %	100 %	115345622
48	NC_008386	C	6	6	95541	95546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_008386	T	7	7	95768	95774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008386	T	6	6	96146	96151	0 %	100 %	0 %	0 %	115345625
51	NC_008386	C	6	6	98577	98582	0 %	0 %	0 %	100 %	115345628
52	NC_008386	C	6	6	99215	99220	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_008386	T	6	6	99862	99867	0 %	100 %	0 %	0 %	115345630
54	NC_008386	A	6	6	101777	101782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008386	A	6	6	103863	103868	100 %	0 %	0 %	0 %	115345634

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.