MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia cepacia AMMD plasmid 1

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008385	TTCCC	2	10	265	274	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_008385	AGGCC	2	10	1108	1117	20 %	0 %	40 %	40 %	115345484
3	NC_008385	CCGCC	2	10	1289	1298	0 %	0 %	20 %	80 %	115345485
4	NC_008385	GGCCG	2	10	3829	3838	0 %	0 %	60 %	40 %	115345486
5	NC_008385	GCGAA	2	10	4930	4939	40 %	0 %	40 %	20 %	115345489
6	NC_008385	GGCGC	2	10	5550	5559	0 %	0 %	60 %	40 %	115345489
7	NC_008385	GAGCG	2	10	7055	7064	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008385	GCGCC	2	10	11129	11138	0 %	0 %	40 %	60 %	115345496
9	NC_008385	CGCGC	2	10	12993	13002	0 %	0 %	40 %	60 %	115345499
10	NC_008385	GATCG	2	10	13276	13285	20 %	20 %	40 %	20 %	115345499
11	NC_008385	CCTTG	2	10	14051	14060	0 %	40 %	20 %	40 %	115345500
12	NC_008385	CGAGG	2	10	14845	14854	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008385	GGCGA	2	10	15129	15138	20 %	0 %	60 %	20 %	115345502
14	NC_008385	CAAAG	2	10	15343	15352	60 %	0 %	20 %	20 %	115345503
15	NC_008385	GCGCG	2	10	15753	15762	0 %	0 %	60 %	40 %	115345503
16	NC_008385	GGGCC	2	10	15765	15774	0 %	0 %	60 %	40 %	115345503
17	NC_008385	GCGCC	2	10	16227	16236	0 %	0 %	40 %	60 %	115345503
18	NC_008385	AAGTG	2	10	17097	17106	40 %	20 %	40 %	0 %	115345503
19	NC_008385	CGATG	2	10	18431	18440	20 %	20 %	40 %	20 %	115345504
20	NC_008385	TCGGC	2	10	18526	18535	0 %	20 %	40 %	40 %	115345504
21	NC_008385	GCCGT	2	10	20617	20626	0 %	20 %	40 %	40 %	115345506
22	NC_008385	CGCGC	2	10	20988	20997	0 %	0 %	40 %	60 %	115345506
23	NC_008385	CGAGC	2	10	22887	22896	20 %	0 %	40 %	40 %	115345508
24	NC_008385	GCACC	2	10	23156	23165	20 %	0 %	20 %	60 %	115345508
25	NC_008385	GCCAC	2	10	26204	26213	20 %	0 %	20 %	60 %	115345508
26	NC_008385	GGTGC	2	10	28080	28089	0 %	20 %	60 %	20 %	115345509
27	NC_008385	CGTCA	2	10	31823	31832	20 %	20 %	20 %	40 %	115345515
28	NC_008385	CCCTC	2	10	32268	32277	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_008385	CCCGC	2	10	32382	32391	0 %	0 %	20 %	80 %	115345516
30	NC_008385	CAGGC	2	10	32761	32770	20 %	0 %	40 %	40 %	115345516
31	NC_008385	TGCCC	2	10	33264	33273	0 %	20 %	20 %	60 %	115345517
32	NC_008385	GGGCT	2	10	34630	34639	0 %	20 %	60 %	20 %	115345518
33	NC_008385	GCCGA	2	10	35895	35904	20 %	0 %	40 %	40 %	115345520
34	NC_008385	GCCGC	2	10	36381	36390	0 %	0 %	40 %	60 %	115345520
35	NC_008385	GCCGG	2	10	36753	36762	0 %	0 %	60 %	40 %	115345520
36	NC_008385	TGCGA	2	10	37975	37984	20 %	20 %	40 %	20 %	115345522
37	NC_008385	TGCGC	2	10	40025	40034	0 %	20 %	40 %	40 %	115345524
38	NC_008385	ATCCA	2	10	42777	42786	40 %	20 %	0 %	40 %	115345527

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.