MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Burkholderia cepacia AMMD plasmid 1

Total Repeats: 805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008385	CGG	2	6	209	214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008385	CGC	2	6	259	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008385	TTC	2	6	307	312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345483
4	NC_008385	CTT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345483
5	NC_008385	GCA	2	6	359	364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345483
6	NC_008385	GCC	2	6	367	372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345483
7	NC_008385	GGC	2	6	388	393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345483
8	NC_008385	GCC	2	6	411	416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345483
9	NC_008385	CTT	2	6	434	439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345483
10	NC_008385	TCC	2	6	499	504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345483
11	NC_008385	AGT	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345483
12	NC_008385	AGC	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345483
13	NC_008385	GAA	2	6	633	638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345483
14	NC_008385	GAC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008385	CTT	2	6	913	918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345484
16	NC_008385	CGG	2	6	934	939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345484
17	NC_008385	CGA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345484
18	NC_008385	GGC	3	9	1094	1102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345484
19	NC_008385	AGG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008385	GCC	2	6	1236	1241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345485
21	NC_008385	CCG	3	9	1246	1254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345485
22	NC_008385	CGG	2	6	1277	1282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345485
23	NC_008385	GGC	2	6	1340	1345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345485
24	NC_008385	GCC	2	6	1349	1354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345485
25	NC_008385	GCC	2	6	1377	1382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345485
26	NC_008385	GCC	2	6	1442	1447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345485
27	NC_008385	CCG	2	6	1459	1464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345485
28	NC_008385	AGT	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345485
29	NC_008385	AAG	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345485
30	NC_008385	AGC	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345485
31	NC_008385	CAA	2	6	1715	1720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345485
32	NC_008385	CAA	2	6	1766	1771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345485
33	NC_008385	CGA	4	12	1811	1822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345485
34	NC_008385	GTG	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345485
35	NC_008385	ACT	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345485
36	NC_008385	GAA	2	6	2270	2275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345485
37	NC_008385	CGA	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345485
38	NC_008385	ACG	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345485
39	NC_008385	GCC	2	6	2399	2404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008385	GGC	2	6	2414	2419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008385	GCA	2	6	2486	2491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008385	CGA	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008385	GGC	2	6	2694	2699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008385	GCC	2	6	2704	2709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008385	CGC	2	6	2768	2773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_008385	GGC	2	6	2996	3001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008385	GGC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008385	GTT	2	6	3279	3284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008385	AAT	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008385	GCC	2	6	3342	3347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008385	AAG	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008385	GTC	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345486
53	NC_008385	CGT	3	9	3709	3717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345486
54	NC_008385	CCG	2	6	3741	3746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345486
55	NC_008385	GAT	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345486
56	NC_008385	TCG	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345486
57	NC_008385	CGC	4	12	3935	3946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345486
58	NC_008385	GCT	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345486
59	NC_008385	GAC	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345486
60	NC_008385	CGG	2	6	4029	4034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345487
61	NC_008385	CGG	2	6	4056	4061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345487
62	NC_008385	CAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345487
63	NC_008385	GGT	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345487
64	NC_008385	GGC	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008385	CTT	2	6	4506	4511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345488
66	NC_008385	TGA	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345488
67	NC_008385	GCG	2	6	4544	4549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345488
68	NC_008385	ACT	2	6	4610	4615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345488
69	NC_008385	CGG	2	6	4629	4634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345488
70	NC_008385	CGC	2	6	4716	4721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345488
71	NC_008385	TGA	2	6	4873	4878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345488
72	NC_008385	GGC	2	6	4881	4886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008385	CGG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345489
74	NC_008385	GCT	2	6	4989	4994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345489
75	NC_008385	CTG	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345489
76	NC_008385	GTG	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345489
77	NC_008385	GCG	2	6	5075	5080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345489
78	NC_008385	GCG	2	6	5086	5091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345489
79	NC_008385	ATC	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345489
80	NC_008385	CGG	2	6	5139	5144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345489
81	NC_008385	CGA	3	9	5166	5174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345489
82	NC_008385	GCC	2	6	5176	5181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345489
83	NC_008385	TGG	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345489
84	NC_008385	GAA	2	6	5460	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345489
85	NC_008385	GCC	2	6	5544	5549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345489
86	NC_008385	CCG	2	6	5581	5586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345489
87	NC_008385	TGC	2	6	5609	5614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345489
88	NC_008385	GGC	2	6	5646	5651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345489
89	NC_008385	GGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345489
90	NC_008385	GGC	2	6	5673	5678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345489
91	NC_008385	GCC	2	6	5683	5688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345489
92	NC_008385	CGG	2	6	5738	5743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345489
93	NC_008385	GCA	2	6	5759	5764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345489
94	NC_008385	CGA	2	6	5816	5821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345489
95	NC_008385	GCA	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345489
96	NC_008385	TGG	2	6	5885	5890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345489
97	NC_008385	CCA	2	6	5934	5939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345489
98	NC_008385	TCA	2	6	5972	5977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345489
99	NC_008385	GAC	2	6	6019	6024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345489
100	NC_008385	GCC	2	6	6056	6061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345489
101	NC_008385	GTG	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345489
102	NC_008385	GAA	2	6	6139	6144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008385	GCG	2	6	6213	6218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345490
104	NC_008385	TGC	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345490
105	NC_008385	CGG	2	6	6256	6261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345490
106	NC_008385	GCT	2	6	6358	6363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345490
107	NC_008385	CGC	2	6	6635	6640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345491
108	NC_008385	GGC	2	6	6667	6672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345491
109	NC_008385	CGC	2	6	6718	6723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345491
110	NC_008385	GGC	2	6	6808	6813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008385	TCA	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008385	ATC	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008385	TGC	2	6	6894	6899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008385	CAT	2	6	6938	6943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008385	GAT	2	6	6951	6956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008385	GCA	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008385	GCG	2	6	6982	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008385	GGA	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008385	TGC	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008385	GGC	3	9	7034	7042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008385	GGA	2	6	7107	7112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008385	GCC	2	6	7256	7261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345492
123	NC_008385	GCT	2	6	7293	7298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345492
124	NC_008385	TGG	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345492
125	NC_008385	ATC	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345492
126	NC_008385	CTT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345492
127	NC_008385	GAA	2	6	7687	7692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345493
128	NC_008385	GCG	2	6	7742	7747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345493
129	NC_008385	GCG	2	6	7772	7777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345493
130	NC_008385	TGA	2	6	7799	7804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345493
131	NC_008385	TTC	2	6	7807	7812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345493
132	NC_008385	GCC	2	6	7819	7824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345493
133	NC_008385	CGG	2	6	8136	8141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008385	CAA	2	6	8160	8165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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261	NC_008385	CTT	2	6	14423	14428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345501
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265	NC_008385	TTA	2	6	14699	14704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_008385	TCC	2	6	26836	26841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
496	NC_008385	TCC	2	6	26863	26868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
497	NC_008385	GCC	2	6	26888	26893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
498	NC_008385	GGT	2	6	26989	26994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
499	NC_008385	TGG	2	6	27047	27052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_008385	GCA	2	6	27324	27329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345509

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