MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Burkholderia cepacia AMMD plasmid 1

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008385	GC	3	6	1425	1430	0 %	0 %	50 %	50 %	115345485
2	NC_008385	GC	3	6	1489	1494	0 %	0 %	50 %	50 %	115345485
3	NC_008385	CG	3	6	1729	1734	0 %	0 %	50 %	50 %	115345485
4	NC_008385	GC	3	6	1805	1810	0 %	0 %	50 %	50 %	115345485
5	NC_008385	CG	3	6	2171	2176	0 %	0 %	50 %	50 %	115345485
6	NC_008385	GC	3	6	3217	3222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008385	GC	3	6	3801	3806	0 %	0 %	50 %	50 %	115345486
8	NC_008385	CG	3	6	4145	4150	0 %	0 %	50 %	50 %	115345487
9	NC_008385	GC	3	6	4973	4978	0 %	0 %	50 %	50 %	115345489
10	NC_008385	GC	3	6	5274	5279	0 %	0 %	50 %	50 %	115345489
11	NC_008385	GC	3	6	5428	5433	0 %	0 %	50 %	50 %	115345489
12	NC_008385	CG	3	6	5634	5639	0 %	0 %	50 %	50 %	115345489
13	NC_008385	CG	3	6	6049	6054	0 %	0 %	50 %	50 %	115345489
14	NC_008385	GC	3	6	7676	7681	0 %	0 %	50 %	50 %	115345493
15	NC_008385	GC	3	6	7872	7877	0 %	0 %	50 %	50 %	115345493
16	NC_008385	GC	3	6	8274	8279	0 %	0 %	50 %	50 %	115345494
17	NC_008385	CG	3	6	9040	9045	0 %	0 %	50 %	50 %	115345494
18	NC_008385	GC	3	6	9120	9125	0 %	0 %	50 %	50 %	115345494
19	NC_008385	CG	3	6	9187	9192	0 %	0 %	50 %	50 %	115345494
20	NC_008385	GC	3	6	9499	9504	0 %	0 %	50 %	50 %	115345495
21	NC_008385	GC	3	6	9572	9577	0 %	0 %	50 %	50 %	115345495
22	NC_008385	CG	3	6	9947	9952	0 %	0 %	50 %	50 %	115345495
23	NC_008385	GC	3	6	10622	10627	0 %	0 %	50 %	50 %	115345496
24	NC_008385	GC	3	6	10797	10802	0 %	0 %	50 %	50 %	115345496
25	NC_008385	CG	3	6	10944	10949	0 %	0 %	50 %	50 %	115345496
26	NC_008385	GC	4	8	11019	11026	0 %	0 %	50 %	50 %	115345496
27	NC_008385	GC	4	8	11187	11194	0 %	0 %	50 %	50 %	115345496
28	NC_008385	GC	3	6	11252	11257	0 %	0 %	50 %	50 %	115345496
29	NC_008385	GC	3	6	12127	12132	0 %	0 %	50 %	50 %	115345498
30	NC_008385	CG	3	6	12166	12171	0 %	0 %	50 %	50 %	115345498
31	NC_008385	CG	3	6	12467	12472	0 %	0 %	50 %	50 %	115345498
32	NC_008385	GC	3	6	12551	12556	0 %	0 %	50 %	50 %	115345498
33	NC_008385	AC	3	6	13547	13552	50 %	0 %	0 %	50 %	115345500
34	NC_008385	TG	3	6	14725	14730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008385	GA	3	6	14839	14844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008385	GC	3	6	14973	14978	0 %	0 %	50 %	50 %	115345502
37	NC_008385	CG	3	6	15448	15453	0 %	0 %	50 %	50 %	115345503
38	NC_008385	GC	3	6	15522	15527	0 %	0 %	50 %	50 %	115345503
39	NC_008385	GC	3	6	15851	15856	0 %	0 %	50 %	50 %	115345503
40	NC_008385	GC	4	8	16150	16157	0 %	0 %	50 %	50 %	115345503
41	NC_008385	GC	3	6	16170	16175	0 %	0 %	50 %	50 %	115345503
42	NC_008385	CG	3	6	16261	16266	0 %	0 %	50 %	50 %	115345503
43	NC_008385	GC	3	6	16443	16448	0 %	0 %	50 %	50 %	115345503
44	NC_008385	CG	3	6	16622	16627	0 %	0 %	50 %	50 %	115345503
45	NC_008385	GC	3	6	19367	19372	0 %	0 %	50 %	50 %	115345504
46	NC_008385	GC	3	6	19554	19559	0 %	0 %	50 %	50 %	115345505
47	NC_008385	GC	3	6	19761	19766	0 %	0 %	50 %	50 %	115345505
48	NC_008385	AC	3	6	19953	19958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008385	CG	3	6	20132	20137	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
50	NC_008385	GC	3	6	20369	20374	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
51	NC_008385	GC	3	6	20463	20468	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
52	NC_008385	CG	3	6	20497	20502	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
53	NC_008385	GC	4	8	20511	20518	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
54	NC_008385	CG	3	6	20531	20536	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
55	NC_008385	GC	3	6	21186	21191	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
56	NC_008385	GC	3	6	21448	21453	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
57	NC_008385	CG	3	6	21475	21480	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
58	NC_008385	CG	3	6	21565	21570	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
59	NC_008385	GC	3	6	22286	22291	0 %	0 %	50 %	50 %	115345507
60	NC_008385	GC	3	6	22411	22416	0 %	0 %	50 %	50 %	115345507
61	NC_008385	GC	3	6	22499	22504	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
62	NC_008385	GC	3	6	22746	22751	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
63	NC_008385	GC	3	6	22848	22853	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
64	NC_008385	GC	3	6	23284	23289	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
65	NC_008385	GC	3	6	23321	23326	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
66	NC_008385	CG	3	6	23465	23470	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
67	NC_008385	GC	3	6	23559	23564	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
68	NC_008385	GC	3	6	23799	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
69	NC_008385	CG	3	6	23923	23928	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
70	NC_008385	GC	3	6	24628	24633	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
71	NC_008385	CG	3	6	24816	24821	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
72	NC_008385	GC	3	6	24951	24956	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
73	NC_008385	CG	3	6	25093	25098	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
74	NC_008385	GC	3	6	25442	25447	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
75	NC_008385	CG	3	6	25484	25489	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
76	NC_008385	GC	3	6	25682	25687	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
77	NC_008385	CG	3	6	26429	26434	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
78	NC_008385	GC	3	6	26475	26480	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
79	NC_008385	CG	3	6	26826	26831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008385	CA	3	6	27087	27092	50 %	0 %	0 %	50 %	115345509
81	NC_008385	GC	3	6	27474	27479	0 %	0 %	50 %	50 %	115345509
82	NC_008385	CG	3	6	27836	27841	0 %	0 %	50 %	50 %	115345509
83	NC_008385	GC	3	6	27891	27896	0 %	0 %	50 %	50 %	115345509
84	NC_008385	GC	3	6	28072	28077	0 %	0 %	50 %	50 %	115345509
85	NC_008385	CG	3	6	28434	28439	0 %	0 %	50 %	50 %	115345509
86	NC_008385	GC	3	6	28491	28496	0 %	0 %	50 %	50 %	115345509
87	NC_008385	GC	3	6	28721	28726	0 %	0 %	50 %	50 %	115345509
88	NC_008385	GC	4	8	28900	28907	0 %	0 %	50 %	50 %	115345509
89	NC_008385	CG	3	6	29307	29312	0 %	0 %	50 %	50 %	115345510
90	NC_008385	GC	3	6	30323	30328	0 %	0 %	50 %	50 %	115345512
91	NC_008385	GC	3	6	30571	30576	0 %	0 %	50 %	50 %	115345512
92	NC_008385	AG	4	8	30591	30598	50 %	0 %	50 %	0 %	115345512
93	NC_008385	GC	3	6	31093	31098	0 %	0 %	50 %	50 %	115345513
94	NC_008385	GC	3	6	31364	31369	0 %	0 %	50 %	50 %	115345514
95	NC_008385	CG	3	6	32363	32368	0 %	0 %	50 %	50 %	115345516
96	NC_008385	CG	3	6	32573	32578	0 %	0 %	50 %	50 %	115345516
97	NC_008385	GC	3	6	32795	32800	0 %	0 %	50 %	50 %	115345516
98	NC_008385	GC	3	6	34860	34865	0 %	0 %	50 %	50 %	115345519
99	NC_008385	GC	3	6	35060	35065	0 %	0 %	50 %	50 %	115345519
100	NC_008385	CG	3	6	36034	36039	0 %	0 %	50 %	50 %	115345520
101	NC_008385	GT	3	6	36118	36123	0 %	50 %	50 %	0 %	115345520
102	NC_008385	CG	3	6	36212	36217	0 %	0 %	50 %	50 %	115345520
103	NC_008385	CG	3	6	36511	36516	0 %	0 %	50 %	50 %	115345520
104	NC_008385	CG	3	6	36729	36734	0 %	0 %	50 %	50 %	115345520
105	NC_008385	CG	3	6	36899	36904	0 %	0 %	50 %	50 %	115345520
106	NC_008385	GC	3	6	37386	37391	0 %	0 %	50 %	50 %	115345521
107	NC_008385	GA	4	8	37530	37537	50 %	0 %	50 %	0 %	115345521
108	NC_008385	CG	3	6	37613	37618	0 %	0 %	50 %	50 %	115345522
109	NC_008385	GA	3	6	37839	37844	50 %	0 %	50 %	0 %	115345522
110	NC_008385	GC	3	6	38218	38223	0 %	0 %	50 %	50 %	115345522
111	NC_008385	CG	3	6	38315	38320	0 %	0 %	50 %	50 %	115345522
112	NC_008385	GC	4	8	38580	38587	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
113	NC_008385	CG	3	6	38625	38630	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
114	NC_008385	GC	3	6	38714	38719	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
115	NC_008385	GC	4	8	38851	38858	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
116	NC_008385	CG	3	6	39110	39115	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
117	NC_008385	CG	3	6	39186	39191	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
118	NC_008385	CG	3	6	39487	39492	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
119	NC_008385	GC	3	6	39760	39765	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
120	NC_008385	GC	4	8	39978	39985	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
121	NC_008385	CG	3	6	40194	40199	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
122	NC_008385	GC	3	6	41256	41261	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
123	NC_008385	GC	3	6	41947	41952	0 %	0 %	50 %	50 %	115345525
124	NC_008385	GC	3	6	42010	42015	0 %	0 %	50 %	50 %	115345525
125	NC_008385	CG	3	6	42101	42106	0 %	0 %	50 %	50 %	115345525
126	NC_008385	GC	3	6	42211	42216	0 %	0 %	50 %	50 %	115345526
127	NC_008385	GC	3	6	42274	42279	0 %	0 %	50 %	50 %	115345526
128	NC_008385	AG	3	6	42453	42458	50 %	0 %	50 %	0 %	115345526
129	NC_008385	GC	4	8	43118	43125	0 %	0 %	50 %	50 %	115345527

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.