MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008384	TCCTCG	2	12	94366	94377	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008384	GCCGGC	2	12	105963	105974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008384	CGAAAC	2	12	107804	107815	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008384	GGCTGC	2	12	121968	121979	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008384	CAGCGA	2	12	143164	143175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008384	GCCTTC	2	12	153200	153211	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008384	TCGGTT	2	12	172070	172081	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008384	TCGTGG	2	12	204331	204342	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008384	GCTGGT	2	12	207730	207741	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008384	GTCGCC	2	12	208578	208589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008384	CGGCCG	2	12	210168	210179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008384	CAACGT	5	30	211843	211872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008384	GCTTTG	2	12	211990	212001	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008384	ATGATT	2	12	240746	240757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008384	CGCCGA	2	12	268868	268879	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008384	GGGAGG	2	12	271027	271038	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008384	CTCGAC	2	12	279049	279060	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008384	GATTTT	2	12	310301	310312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008384	CCCGAG	2	12	374941	374952	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008384	AGTTGC	2	12	379452	379463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008384	TGCGTC	2	12	386311	386322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008384	GGACGA	2	12	386866	386877	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008384	CACATC	2	12	422076	422087	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008384	AGCGAT	2	12	433243	433254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008384	GGCGGG	2	12	477221	477232	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008384	ACGCAG	2	12	578496	578507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008384	ATTGTC	2	12	581395	581406	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008384	CGCAAT	2	12	587748	587759	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008384	GCCTGC	2	12	625182	625193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008384	AGGCAT	2	12	653293	653304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008384	CTTTAG	2	12	666451	666462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008384	GCCGGC	2	12	675993	676004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.