MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008384	CCGAC	2	10	44790	44799	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_008384	ACAAG	2	10	77844	77853	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008384	CAAAA	2	10	89293	89302	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008384	AGGTG	2	10	91452	91461	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008384	GCAAC	2	10	92513	92522	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008384	GATGG	2	10	132574	132583	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008384	GCCGA	2	10	143040	143049	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008384	TCACC	2	10	143153	143162	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_008384	TCTCC	2	10	160916	160925	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_008384	GTTGA	2	10	175572	175581	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008384	AGACT	2	10	183820	183829	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008384	GTCCC	2	10	207067	207076	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_008384	GCCCA	2	10	210030	210039	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_008384	CGGAC	2	10	210158	210167	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008384	AGAGG	2	10	219677	219686	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008384	TTGCC	2	10	241066	241075	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008384	CGATG	2	10	269544	269553	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008384	GGCAG	2	10	270300	270309	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008384	GTTGT	2	10	280694	280703	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008384	CCTCA	2	10	284756	284765	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_008384	AGCGA	2	10	298784	298793	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008384	CGCTC	2	10	327422	327431	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_008384	GCAAG	2	10	330084	330093	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008384	TTGAA	2	10	340588	340597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008384	GACCG	2	10	345675	345684	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008384	TCGCA	2	10	346804	346813	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008384	CGAGA	2	10	357349	357358	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008384	GCTCC	2	10	366578	366587	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_008384	GATCA	2	10	371610	371619	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008384	GTCAG	2	10	372317	372326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008384	CCGCT	2	10	372393	372402	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_008384	GCTGT	2	10	376180	376189	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008384	GAAAT	2	10	381025	381034	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008384	CAGGG	2	10	381971	381980	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008384	TCTCG	2	10	384678	384687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_008384	TCCGA	2	10	387903	387912	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008384	ACCCC	2	10	390273	390282	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
38	NC_008384	TGGAT	2	10	398507	398516	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008384	AGACA	2	10	415098	415107	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008384	GCGTC	2	10	419035	419044	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008384	CGGGC	2	10	420417	420426	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008384	ATTTG	2	10	433113	433122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008384	TCAGC	2	10	434029	434038	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_008384	GCACT	2	10	488581	488590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008384	CCGTT	2	10	489235	489244	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008384	GACTG	2	10	503697	503706	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008384	AATGC	2	10	538947	538956	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008384	TGGTG	2	10	548194	548203	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008384	TCAAA	2	10	551686	551695	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008384	GAGAC	2	10	562735	562744	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008384	ACCCT	2	10	562807	562816	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_008384	ATCTG	2	10	564299	564308	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008384	AAAGC	2	10	574740	574749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008384	CCCAG	2	10	581340	581349	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_008384	ACTTT	2	10	584627	584636	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008384	GCGAA	2	10	587894	587903	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008384	GAAGA	2	10	591288	591297	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008384	TTCGT	2	10	610650	610659	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008384	CTCGC	2	10	627757	627766	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_008384	GGCCG	2	10	649724	649733	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008384	TCTTG	2	10	650568	650577	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008384	TGATG	2	10	658308	658317	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008384	GGCCG	2	10	683207	683216	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.